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12-03-2018 1 ENZIMAS • Nem todas as proteínas são ... – ... ENZIMAS • Todas as enzimas são ... – PROTEÍNAS (Quase todas ...) – As ribozimas (anos 80, séc XX) são moléculas de RNA com atividade catalítica; – O sistema imunitário pode produzir anticorpos com atividade catalítica (podem ser produzidos anticorpos catalíticos a usar como potenciais fármacos, p.ex. para degradar cocaína em tratamentos de desintoxicação); – Um campo de investigação promissor ... Desenvolvimento de moléculas sintéticas capazes de se comportarem como enzimas... 12-03-2018 2 Enzimas • Proteínas globulares (“empacotadas”) – ∃ pouco espaço entre as cadeias • Arranjos espaciais – α-enzima (apenas hélices α; citrato sintase) – β-enzima (apenas folhas β; quimotripsina) – α/β enzima (hélices α e folhas β alternadas/misturadas; cinases e desidrogenases) – α+β enzima (segmentos de estruturas β e hélices α separadas; lisozima, ribonuclease) • Isoenzimas – Catalisam a mesma reação mas produzidas em tecidos diferentes; diferente afinidade pelo substrato - diagnósticos clínicos errados Classificação das enzimas (6 classes) Enzyme Commission – International Union of Biochemistry • 1. Oxiredutases • 2. Transferases • 3. Hidrolases • 4. Liases • 5. Isomerases • 6. Ligases 12-03-2018 3 Classificação em função da reação catalisada • Hexocinase = ATP:Glicose transferase (E.C. 2.7.1.1) • 1º dígito – classe (transferase) • 2º dígito – subclasse (fosfotransferase) • 3º dígito – fosfotransferase com um grupo OH como aceitador • 4º dígito – D-glicose como molécula aceitadora As enzimas aumentam a velocidade da reação por estabilização do estado de transição, reduzindo a energia de ativação A energia de ligação libertada pelas interações E-S é responsável pela especificidade das enzimas 12-03-2018 4 Especificidade enzimática e ação catalítica 1. Modelo chave-fechadura (Modelo de Fischer-1894) Especificidade enzimática e ação catalítica 2. Modelo “encaixe induzido” (Modelo de Koshland-1958) 12-03-2018 5 Especificidade enzimática e ação catalítica 3. Modelo de Foote e Milstein (1994) (existem diferentes estados conformacionais da E e do S e a ligação ocorre preferencialmente entre as conformações complementares) Mecanismos de AÇÃO das ENZIMAS • Catálise ácido-base (exemplo: conversão de cetona em enol) Catálise ÁCIDA Catálise BÁSICA 12-03-2018 6 Mecanismos de AÇÃO das ENZIMAS • Catálise covalente – Agente nucleofílico – Agente eletrofílico Mecanismos de AÇÃO das ENZIMAS • Catálise iónica metálica (ou por ião metálico) – Cofatores metálicos na E • (Fe, Cu, Zn, Mn, Co...) – Iões captados do meio na formação ES • (Na, K, Mg, Ca,...) 12-03-2018 7 Mecanismos de AÇÃO das ENZIMAS (cont.) • Tríade catalítica (sinergia das 3 catálises) – Proteases serínicas – Tripsina • Resíduos de GLY e aa com grupo carboxílico (ASP) na bolsa catalítica-especificidade p/ substratos volumosos e básicos – Quimotripsina • Resíduos de GLY e aa aromáticos na bolsa catalítica- especificidade p/ substratos volumosos e hidrofóbicos – Elastase • Resíduos de TRE e aa hidrofóbicos na bolsa catalítica – especificidade p/ substratos pequenos hidrofóbicos CINÉTICA ENZIMÁTICA Michaelis-Menten 12-03-2018 8 K-1 CINÉTICA ENZIMÁTICA Michaelis-Menten modelo explicativo – curva hiperbólica (rectangular) 12-03-2018 9 12-03-2018 10 Linearização (gráfico dos “inversos”) Método de Lineweaver-Burk 12-03-2018 11 12-03-2018 12 As enzimas alostéricas não obedecem à cinética de M-M A ligação de uma molécula de S a um local ativo afeta a afinidade de outros locais ativos da mesma enzima – Cooperatividade. As enzimas são catalisadores muito eficazes ... 1. Ação na “economia” energética celular a) (redução da energia de ativação) 2. Ação na ordem de ocorrência das reações celulares 3. Alta eficiência em baixas concentrações a) Regeneração final; não são consumidas na reação; são necessárias quantidades E < S) 4. Especificidade E/S - factor acelerador da reação 5. Ação das enzimas é regulável 12-03-2018 13 Regulação enzimática • Atividade enzimática vs. pH e Temperatura • Não é uma regulação específica propriamente dita ... • Todas as enzimas de uma mesma via metabólica sofrem esses efeitos • Mecanismos de REGULAÇÃO ENZIMÁTICA – Controlo alostérico – Modificação covalente reversível – Ativação por quebra proteolítica • REGULAÇÃO ENZIMÁTICA – Controlo alostérico • Formação de ligação não-covalente e reversível entre E e um efetor alostérico (ex: o seu P ou com um P das reações seguintes) – desestabilização da conformação o que impede a regeneração para consumir nova molécula de S (a enzima alostérica é inibida pelo próprio produto final da via metabólica) (“feedback inhibition”) inibição alostérica pelo ATP no C. Krebs • Efetores ou moduladores positivos ou negativos (“feedback activation and feedback inhibition”) 12-03-2018 14 • REGULAÇÃO ENZIMÁTICA – Modificação covalente reversível • A fosforilação é a modificação mais comum • (estado de enzima inativa pela adição de grupos fosfato inorgânico, AMP, UMP, metil...) e ativação com a retirada do grupo, ou vice-versa... • Forma inativa – não fosforilada • Forma ativa – forma fosforilada • Fosforilase do glicogénio • Glicogénio + Pi Glicogénio + Glicose-1-fosfato • REGULAÇÃO ENZIMÁTICA – Ativação por quebra/clivagem proteolítica • Percursor inativo (zimogénio ou proenzima=enzima com aa a mais do que os necessários que impedem a ação catalítica da enzima) que por clivagem proteolítica passa à forma ativa (enzima ativa) • Procaspases - Caspases • Tripsinogénio – Tripsina • Quimotripsinogénio - Quimotripsina • (...) 12-03-2018 15 Mecanismos de Inibição Enzimática • Inibição reversível – Competitiva – Não competitiva • Inibição irreversível Análise gráfica – AÇÃO DE INIBIDORES COMPETITIVOS A) Efeito do I diminui V reação (curva azul) - Aumento do KM e manutenção do valor de Vmax B) gráfico de Lineweaver-Burk - Valores inversos da velocidade e de [S] revelam que a inibição competitiva ocorre com o aumento do KM (aumento inclinação). 12-03-2018 16 Análise gráfica – AÇÃO DE INIBIDORES NÃO-COMPETITIVOS A) a enzima sob a ação do inibidor não pode atingir a Vmax e um aumento de substrato não reverte a inibição (ligação noutro local que não o sítio catalítico); afinidade da E pelo S não se altera (km mantém-se) B) a queda da Vmax é a causa do aumento da inclinação do gráfico enquanto que o valor de KM apresenta pouco ou nenhum aumento. 12-03-2018 17 Mecanismos de Inibição Enzimática • Inibição irreversível – Alteração química permanente de algum grupo funcional essencial (ex: destruição do sítio catalítico) • Medicamentos=inibidores irreversíveis de reação enzimática (alta especificidade; poucos efeitos colaterais) • Insecticidas organofosforados e carbamatos – inibem a acetilcolinesterase (hidrólise da acetilcolina em colina e acetato) • Inibidores na clínica (inibidores de enzimas para tratamento de patologias) – INIBIDORES DA ACETILCOLINESTERASE » Manter a função cognitiva dos doentes num nível constante » Aumento na concentração e no tempo de ação da acetilcolina na sinapse – INIBIDORES DE PROTEASES DO VÍRUS HIV » Tratamento da SIDA c/ inibidores enzimáticos » Ritonavir; Saquinavir; Nelfinavir; Lopinavir; Indinavir