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Introdução Condições essenciais para a vida: Seres vivos devem autoduplicar-se Organismos devem catalisar reações químicas de modo eficiente e seletivo, captando substancias e energia do ambiente! A variação do é negativa Sacarose É um processo exergônico, espontâneo. Ao longo de um tempo, longo, o volume do açúcar no açucareiro diminuirá, devido à essa reação. A vida necessita dessa reação para liberação de energia e realizar tarefas à nível celular. A enzima pode catalisar essa reação, dessa forma ela acontece ainda mais rápido (micro/nanossegundos). ENZIMAS ● Em sua grande maioria é formada por proteínas. ● Atuam em condições amenas de pH e temperatura (organismo que vivem em condições extremas, exemplo à baixo), salinidade, etc. ● Também funcionam em condições biológicas extremas Tardígrado (organismo microscópio) aguenta grandes quantidades de reações, inclusive radiações cósmicas. Ou seja, há enzimas que suportam quantidades exorbitantes de radiações que outros organismos não aguentariam, condições amenas. Bactéria radiococos utilizada para resfriar reatores, aguentam, também, quantidades exorbitantes de radiação Concluindo, a vida é extremamente adaptável, evolutiva. Além disso, as enzimas: ▪ Degradam nutrientes (quebra da sacarose, por ex.) atuar no processo de transformações de energia. ▪ Conservam e transformam energia química (vias bioquímicas/metabólicas - metabolismo, que são reações dependentes de enzimas, catabolismo - quebra de moléculas e o anabolismo - síntese/construção de moléculas. ▪ Produzem macromoléculas a partir de precursores simples ▪ Regulam vias metabólicas homeostase (inibidores, catalisadores) ▪ Grande uso industrial (naturais, recombinantes, etc.) Industria química e alimentícia, agricultura, farmacêutica, etc.) ▪ Relacionadas a doenças (ex.: desordens genéticas hereditárias) – isoenzimas no coração, enzimas hepáticas, etc. no plasma sanguíneo podem indicar problemas ▪ Diagnóstico (ex.: enzimas do plasma, eritrócitos ou tecidos). Catálise aceleração das reações químicas Vitalismo é o fato de que determinadas reações aconteciam somente quando havia vida (estava errado de acordo com Edward Buchner) As ribozimas também são enzimas (RNA) podem catalisar reações químicas Componente químico adicional necessário para a função: Cofator: íons inorgânicos Coenzima: moléculas orgânicas complexas (ex.: vitaminas) Grupos prostético essenciais para o funcionamento das enzimas. Enzimas completa: holoenzima (enzima funcional) Parte proteica: apoenzima ou apoproteína Substrato: molécula que sofre a reação química, que é ligado à enzima, poderá sofrer catálise (ação enzimática) Obtenção: endógenas, alimentação; Nomenclatura das enzimas Normalmente se adiciona o sufixo ase ao nome do substrato ou à atividade especifica da enzima: Urease – catalisa a hidrólise da ureia DNA-polimerase – polimeriza o DNA (função) Pepsina – pepsis vem do grego: digestão. Sistema de classificação enzimático – EC (enzime commission) number (identificação de enzimas) Quatro algarismos: ex.: ATP – glicose fosfotransferase (2.7.1.1) código 2: transferase (1º NÚMERO – GRUPO A QUE PERTENCE AS ENZIMAS) 7: fosfotransferase (2º NÚMERO – TIPO DE ATIVIDADE QUE ELA EXERCE) 1: transfere P para grupo OH- (3º NÚMERO – SUBGRUPO DO 2º NÚMERO – AINDA RELACIONADA A ATIVIDADE QUE A ENZIMA EXERCE) 1: tem D-glicose como aceptor (4º NÚMERO – QUEM É O ACEPTOR?) Existe o contato da enzima com seu substrato formando o complexo: enzima-substrato E: enzima livre S: substrato ES: complexo enzima-substrato EP: complexo de enzima-produto P: produto As reações químicas que envolvem as enzimas estão em equilíbrio. -As enzimas não são consumidas nessas reações químicas, são apenas ferramentas. -As enzimas não são capazes de alterar o equilíbrio das reações, o que muda é o tempo em que essas reações são realizadas. Portanto, de acordo com o gráfico, a velocidade da reação enzimática depende da concentração do substrato [s], quanto maior [s], maior a v da reação. Isso ocorre até o ponto de saturação das enzimas, máximo de formação do complexo enzima – substrato. A velocidade máxima, portanto, nesse ponto, é constante. Sítio catalítico (sítio ativo) – ocorre a catálise Existem catalisadores não biológicos. De forma geral aumentam a velocidade das reações, mas como? Devido a diminuição da energia de ativação (energia necessária para que uma reação química aconteça, leva a molécula até o estado de transição) reações exergônicas, espontâneas; Substrato produto A imagem acima mostra o quanto é acelerado a velocidade das reações por algumas enzimas. A temperatura e pH podem desnaturar proteínas, dessa forma esses parâmetros influenciam nas enzimas. Mudança conformacional otimização Especificidade é a facilidade do substrato se ligar facilmente à enzima, reconhecimento substrato-enzima encaixe eficiente ou ineficiente; afinidade. 1) Redução da entropia; diminuição das conformações possíveis. 2) Dessolvatação dos substratos; geralmente os sítios catalíticos tem resíduos hidrofóbicos que expulsam água; portanto a dessolvatação melhora as reações químicas que envolvem as enzimas; 3) Distorção dos substratos (ET); 4) Alinhamento dos grupos funcionais da enzima (ajuste induzido – induced fit) Os eventos moleculares são simultâneos e dinâmicos, não sequenciais; Bastonase Enzimas regulatórias Atividade catalítica ↑ ou ↓ em respostas a certos sinais Ajustes na velocidade da via metabólica adaptação a condições variantes Tipos comuns: ▪ Enzimas alostéricas (ligações reversíveis a compostos) ▪ Modificações covalentes ▪ Ativadas por remoção de segmento peptídicos (irreversível) Subunidade regulatória é normalmente diferente da subunidade catalítica (inibidor ou ativador); Exemplos de enzimas alostéricas (enzimas de regulação): Homotrópicas: o ativador ou inibidor é o próprio substrato. Heterotrópicas: outro ativador Quando a concentração do produto diminui, a enzima volta para seu estado mais ativo e volta a estar apta a realizar sua função; A via acima é desacelerada, muita isoleucina; Pós-traducionais: enzimas nativas