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22/09/2010 1 UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMCA E BIOLOGIA MOLECULAR BQI 100 – BIOQUÍMICA FUNDAMENTAL Enzimas Funções das Proteínas PROTEÍNAS Estruturais Motoras Hormonais Enzimas Transporte Defesa Nucleoproteínas Reserva de Membrana Transporte de moléculas no sangue: AG - lipoproteínas, minerais, O2, albumina Anticorpos Catalisadores Ferritina – reserva de minerais Transportadores trans- membranas: canais iônicos, transp. de elétrons, transdução de sinais Centríolos – actina, miosina, tropponina. Túbulos - ancorina Enzimas são, principalmente, proteínas com atividade catalítica; Praticamente todas as reações que caracterizam o metabolismo celular são catalisadas por enzimas; Aceleram a velocidade de uma reação, sem no entanto participar dela como reagente ou produto. Oferecem um ambiente específico e preciso dentro qual uma certa reação possa ocorrer rapidamente (sítio ativo) Não afetam o equilíbrio e sim a velocidade de uma reação Conceitos Gerais Cofatores Enzimáticos Citocromo oxidase Citocromo oxidase; catalase; peroxidase Piruvato quinase Hexoquinase; Glicose-6-fosfatase; Piruvato quinase Arginase; Ribonuclease redutase Dinitrogenase Urease Glutationa peroxidase Anidrase carbônica; Álcool desidrogenase Algumas enzimas que contêm ou necessitam de elementos inorgânicos como cofatores Cofatores Enzimáticos Coenzima Exemplos de grupos transferidos Precursor dietético em mamíferos Tiamina pirofosfato Aldeídos Tiamina (vitamina B1) Flavina adenina dinucleotídeo Elétrons Riboflavina (vitamina B2) Nicotinamida adenina dinucleotídeo Íon hidreto (:H-) Ácido nicotínico (niacina) Coenzima A Grupo acila Ácido pantotênico mais outras moléculas Pirodoxal fosfato Grupos amino Piridixina (vitamina B6) 5’-desoxiadenosil- cobalamina (coenzima B12) Átomos de H e grupos alquila Vitamina B12 Biocitina CO2 Biotina Tetraidrofolato Unidades de 1C Folato Ácido lipóico Elétrons e grupos acila Não é necessário estar presente na dieta Algumas coenzimas que funcionam como transpostadoras transientes de grupos funcionais ou de átomos específicos Nomenclatura Enzimática Glicose Glicose-6-fosfato Hexoquinase 22/09/2010 2 Nome da enzima: ATP:Glicose fosfotransferase (indicando que catalisa a transferencia de um grupo fosfato do ATP para a glicose) Número E.C. (Número na classificação enzimática) 2.7.1.1 2: o primeiro dígito, denota o nome da classe: transferase 7: o segundo dígito, a subclasse: fosfotransferase 1: o terceiro dígito, o grupo receptor: hidroxila 1: o quarto dígito, o receptor do grupo fosfato: D-glicose Nomenclatura Enzimática Classificação das enzimas Nº Classe Tipo de reação catalisada 1 Oxirredutase Transferência de elétrons (íons hidretos ou átomos de H) 2 Transferase Reações de transferência de grupos 3 Hidrolases Reações de hidrólises (transferência de grupos funcionais para a água) 4 Liases Adição de grupos às duplas ligações ou formação de duplas ligações por meio de remoção de grupos 5 Isomeras Transferência de grupos dentro da mesma molécula para formar isômeros 6 Ligases Formação de ligações do tipo C─C, C─S, C─O e C─N por meio de reações de condensação acopladas à quebra do ATP Classificação internacional das enzimas Catálise Enzimática E + S ES EP E + P Grupos Catalíticos nas Enzimas Resíduos de aminoácidos Forma ácida geral (doadora de prótons) Forma básica geral (receptora de prótons) C A T Á L I S E E N Z I M Á T I C A Grupos envolvidos na catálise ácido- básica geral Grupos Catalíticos nas Enzimas 2-fosfoglicerato, ligado a enolase Intermediário enólico Fosfoenolpiruvato C A T Á L I S E E N Z I M Á T I C A Grupos Catalíticos nas Enzimas Quimiotripsina R2 - NH2 C A T Á L I S E E N Z I M Á T I C A 22/09/2010 3 E n e rg ia L iv re , G Coordenada da reação Não catalisada C A T Á L I S E E N Z I M Á T I C A C A T Á L I S E E N Z I M Á T I C A Substrato Estado de transição Produtos Sem enzima Enzima complementar ao substrato Enzima complementar ao estado de transição E n e rg ia L iv re , G E n e rg ia L iv re , G E n e rg ia L iv re , G Coordenada da reação O ajuste induzido Hexoquinase + substrato Hexoquinase Cinética Enzimática Velocidade (v) vs. concentração do substrato S P Lei da velocidade: v = k[S] K= constante de velocidade de primeira ordem 2 S P Lei da velocidade: v = k[S]2 K= constante de velocidade de segunda ordem (K: constante de proporcionalidade, reflete a probabilidade da reação acontecer) Ex. K= 0,03 s-1: 3% de substrato será convertido em produto em 1 segundo C A T Á L I S E E N Z I M Á T I C A A concentração do substrato afeta a velocidade da reação [S] (mM) V 0 ( M /m in ) V = Δ[P] ou Δ[S] / unidade de tempo EFEITO DA [S] NA VELOCIDADE DAS REAÇÕES ENZIMÁTICAS Vo = velocidade inicial, medida no início das reações [S] = concentração do substrato [E] = concentração de enzima; T e pH fixos 22/09/2010 4 Cinética Enzimática Km = constante de Michaelis-Menten Vmax = velocidade máxima Se a Vo = ½ Vmax Km = [S] Valor de Km para algumas enzimas Substrato Enzima Km (mM) Catalase H2O2 25 Hexoquinase (cérebro) ATP 0,4 D-glicose 0,05 D-glicose 1,5 ~ [S intracelular] Inibição Enzimática Reversíveis Irreversíveis Competitiva Incompetitiva Vmáx → não altera Km → aumenta Inibição competitiva Inibições Reversíveis I N I B I Ç Ã O Inibições Reversíveis Vmáx → diminui Km → diminui Inibição Incompetitiva I N I B I Ç Ã O I N I B I Ç Ã O Inibições Irreversíveis Inibição Enzimática I N I B I Ç Ã O Inibições Irreversíveis 22/09/2010 5 EFEITO DO pH NA VELOCIDADE DAS REAÇÕES ENZIMÁTICAS V = Δ[P] ou Δ[S] / unidade de tempo Vo = velocidade inicial, medida no início das reações [S], [E] eT fixos Pepsina Glicose 6- fosfatase EFEITO DA TEMPERATURA NA VELOCIDADE DAS REAÇÕES ENZIMÁTICAS V = Δ[P] ou Δ[S] / unidade de tempo Vo = velocidade inicial, medida no início das reações [S], [E] e pH fixos 35ºC 50ºC 25ºC 15ºC 5ºC V E L O C ID A D E D A R E A Ç Ã O TEMPERATURA Regulação da atividade enzimática Regulação ALOSTÉRICA Enzimas Alostéricas Alteram sua atividade enzimática em resposta a sinais metabólicos; Em geral catalisam reações irreversíveis; São controladas alostericamente: • pelo produto da reação; • por compostos provenientes de outras vias; • pelo produto final da própria via (feed-back ou retrocontrole); São normalmente proteínas oligoméricas, possuindo duas ou mais subunidades proteícas; Apresentam sítio catalítico e sítio(s) alostérico(s); Enzimas Alostéricas Substrato Modulador Positivo Enzima inativa Enzima ativa Complexo enzima substrato ativo Enzimas Alostéricas L- treonina L- isoleucina Treonina desidratase Inibição por retroalimentação 22/09/2010 6 ATP: inibidor alostérico da fosfofrutocinase ADP: ATIVADOR alostérico da fosfofrutocinase Enzimas Alostéricas Regulação por modificação covalente A Fosforilase do Glicogênio Fosforilase quinase Fosforilase fosfatase Fosforilase a ativa Regulação por clivagem proteolítica: Os Zimogênios Zimogênio Agente ativador Enzima ativa Peptídeo inativo Pepsinogênio H+/pepsina Pepsina Fragmentos Tripsinogênio tripsina Tripsina Fragmentos quimotripsinogênio quimotripsina Fragmentos Tripsinogênio (inativo) Tripsina (ativa) Enteropeptidase ZimogêniosQuimotripsinogênio (inativo) Quimotripsina (ativa) α-Quimotripsina (ativa) Tripsina Quimotripsina Considere a seguinte interconversão que ocorre na glicólise: