A alternativa incorreta é a que diz que "o artigo indefinido UMA se trata de uma substituição nominal anafórica". Na verdade, o artigo indefinido "uma" não é uma substituição anafórica, mas sim um determinante que introduz um novo referente. As outras afirmações estão corretas em suas definições de anáfora e catafórica.

Vamos analisar cada item: 1. Em "Joana e Maria são excelentes profissionais. Elas se formaram no IFTO", o pronome ELAS representa uma referência pessoal anafórica. - Correto. O pronome "elas" faz referência às profissionais Joana e Maria. 2. Em "Realizara todos os seus sonhos, menos este: o de entrar para a Academia", o pronome ESTE representa uma referência demonstrativa catafórica. - Correto. O pronome "este" faz referência ao sonho mencionado anteriormente. 3. Em "Meu primo comprou uma BMW. Eu também quero uma", o artigo indefinido UMA se trata de uma substituição nominal anafórica. - Incorreto. O artigo "uma" não representa uma substituição nominal anafórica, mas sim uma repetição do substantivo "BMW". 4. Em "Pedro comprou um carro novo e José também", o item lexical TAMBÉM se trata de uma substituição demonstrativa anafórica. - Incorreto. O item lexical "também" não representa uma substituição demonstrativa anafórica, mas sim uma adição de informação. Portanto, a única alternativa incorreta é a terceira: "Em 'Meu primo comprou uma BMW. Eu também quero uma', o artigo indefinido UMA se trata de uma substituição nominal anafórica."