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Disciplina: Microbiologia e Imunologia Aula 2: A importância da diversidade microbiana para o planeta Apresentação Nesta aula, os eventos que deram origem ao planeta serão o ponto de partida para conhecer a evolução dos primeirosmodelos de células. Mesmo não sendo possível obter um modelo �dedigno dessa era, os estudos de sequenciamento de RNA ribossômico sugerem que o último ancestral comum (designado pela sigla LUCA - last universal common ancestor) era um procarionte anaeróbio de ambiente marinho. Em referência aos estudos genômicos, apresentaremos as principais teorias e divergências evolutivas que deram origem aos três domínios de vida e nos �zeram constatar que, no planeta, todos os seres vivos possuem células, material genético para replicação e um metabolismo próprio para manutenção das reações químicas. Além disso, hoje sabemos que todos possuem ancestrais com os mesmos genes básicos, em especial o sistema de membrana para geração de ATP. Os conhecimentos adquiridos com os domínios archaea, bacteria e eukarya e a recente participação dos vírus como agentes propulsores da evolução ampliam as funções dos estudos em microbiologia nos campos ambiental, industrial e clínico. Objetivos Apresentar a origem do planeta e o último ancestral comum (LUCA); De�nir as principais características de bactéria e eukarya; Analisar as origens dos primeiros seres aeróbios e dos vírus no planeta. As origens da vida na Terra A origem da Terra data de 4,5 bilhões de anos Inúmeros estudos que explicam a origem do planeta descrevem que tudo começou a partir de uma poeira nebulosa e dos gases liberados por uma estrela supernova originada a partir da explosão de uma estrela antiga. O sol teve origem no centro dessa nuvem: compactado, ele libertaria enorme quantidade de luz e energia através de �ssão nuclear. Os materiais que permaneceram nessa nuvem começaram a se agregar graças às inúmeras colisões e também à própria atração gravitacional, aumentando, assim, o volume original dos planetas do sistema solar. Na Terra, a energia liberada durante esse processo transformou inicialmente o planeta em uma massa de magma extremamente quente, que ainda receberia massas vindas do espaço. Esse ambiente inóspito deve ter durado 500 milhões de anos. Para muitos, o nosso planeta deveria se chamar água devido à abundância de rios, mares e oceanos vistos em imagens de satélites. Mas como surgiu a água na Terra? As colisões de cometas e asteroides glaciais com os gases vulcânicos vindos do interior do planeta geraram, conforme o esperado, muitos vapores, mas esse fenômeno constante acabou gerando um esfriamento da superfície terrestre. Depois de um longo período, �nalmente a condensação desse vapor d´água transformou o acúmulo de água em dois oceanos primitivos, algo em torno de 4,4 a 4,3 bilhões de anos. Essas evidências começaram a surgir a partir de estudos com microfósseis encontrados no Canadá e na Austrália. Rochas com idades entre 3,5 e 3,7 bilhões de anos contêm formações microbianas denominadas estromatólitos . Para garantir que se trata de microfósseis, são procurados nessas rochas traços das seguintes matérias orgânicas preservadas: Gra�te Carbonato Apatita 1 http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html Microfósseis analisados em rochas no Canadá explicam a origem da vida no planeta. | Fonte: National Geographic / CNN https://www.nationalgeographic.com.es/ciencia/actualidad/indicios-vida-microbiana-unas-rocas-australia-hace-3480-millones-anos_11497 https://edition.cnn.com/videos/world/2017/03/01/earths-oldest-fossils.cnn Fonte: Pixabay Fonte: Pixabay Primeira hipótese O início da vida no planeta ocorreu no leito do fundo dos oceanos, em fendas bem abaixo da superfície recobertas com ferro e outros compostos catalíticos localizados em fontes hidrotermais. Em contato com as águas frias dos oceanos, essas superfícies formaram precipitados que funcionariam como catalisadores para a formação de ligações. Essas ligações originaram: Aminoácidos Peptídeos simples Açúcares Bases nigtrogenadas 2 Atenção Segundo estudos na área, graças ao aparecimento de fosfatos, foram formados os nucleotídeos e, em seguida, o RNA, cuja atividade enzimática é a ribozima. O mundo de�nitivamente começou com RNA. Uma das hipóteses é que o primeiro esboço de células teria sido formado com montmorillonita, um tipo de argila bem comum na Terra primitiva. Isso deu origem a vesículas que aumentariam de tamanho incorporando o RNA e outros compostos. Segunda hipótese Sugere que a primeira célula autorreplicante teria surgido nas bacias marinhas mais rasas a partir de um caldo primordial rico em compostos orgânicos e inorgânicos. A única dúvida para atestar essa hipótese é que a superfície da Terra nesse período era constantemente bombardeada por meteoros, apresentando muitas �utuações na temperatura com essas tempestades. Como esse ambiente poderia manter o modelo de célula? http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html MAS COMO SERIA ESSA BACTÉRIA PRIMITIVA? Fonte: Wikipedia Inicialmente, você precisa saber que o oxigênio surgiu no planeta somente depois da evolução da fotossíntese oxigênica (fotossíntese formadora de oxigênio) com as cianobactérias . Portanto, o metabolismo seria totalmente anaeróbio, sem a participação de oxigênio. Os cientistas acreditam que essa célula (LUCA) teria surgido há 4,25 bilhões de anos nos ventos quentes hidrotermais do nordeste do Oceano Pací�co como uma célula anaeróbica e autótrofa . Ela dependia de hidrogênio, dióxido de carbono (CO2) e nitrogênio para formar compostos orgânicos, como amônia. 3 4 Teoria LUCA Em 1984, o biólogo evolucionista Jim Lake (Universidade da Califórnia, em Los Angeles) propôs uma árvore de dois domínios. Ela começou com LUCA para depois se rami�car em bactéria e archea. Mais adiante, surgiriam as eukaryotas. Décadas depois, essa teoria ganhou força pelas mãos do biologista molecular William Martin, da Universidade de Newcastle, no Reino Unido. O dois biólogos publicaram na Nature Microbiology em 2016 um estudo do sequenciamento de genes em arqueas presentes nos ventos termais marítimos cujas condições de vida estariam mais próximas da ancestral LUCA .5 Sistema de classificação em três domínios. Antes de falar de cada componente, vamos entender os dois tipos de célula? Tipos de células https://cs.wikipedia.org/wiki/Sinice#/media/File:Nostoc.jpg http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html Estruturas presentes em uma célula procariota e eucariota. / Fonte: Wikipedia Eucariota Mais complexo e evoluído, ele surgiu depois do procarioto. Uma de suas principais características é uma região denominada núcleo, onde está o DNA, uma molécula linear bem maior e mais complexa do que em procariotos. Possui várias funções especí�cas comandadas por organelas. Exemplo: mitocôndrias e cloroplastos. Modelos de eucarioto: Algas; Fungos; Protistas; Plantas; Animais. Procariota Ser vivo estruturalmente mais simples, pois não possui organelas com membranas. O material genético é processado diretamente no citoplasma; portanto, a replicação e a síntese de RNA e de proteínas ocorrem no mesmo local . O seu DNA é um cromossomo pequeno, condensado e circular chamado nucleoide. Vários procariotos possuem um DNA extracromossomial denominado plasmídeo. Eles utilizam a membrana plasmática para gerar energia. Modelos de procarioto: Bactéria; Arquea. 6 7 https://en.wikipedia.org/wiki/Cell_(biology)#/media/File:Celltypes.svg http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.htmlhttp://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html Fonte: Freepik Domínios eukarya, bactéria e archaea Na evolução do planeta, os eucariotos surgiram há 2 bilhões de anos depois do aumento do oxigênio no planeta com o surgimento de micro-organismos aeróbios. Esse surgimento ocorreu pela incorporação de uma bactéria que realizava o metabolismo aeróbio, dando origem à mitocôndria nas células animais. Nas plantas, houve a endossimbiose de uma cianobactéria fotossintética. 8 Comentário A prova disso é que tanto a mitocôndria como o cloroplasto possuem DNA circular próprio e ribossomos. São provas indiscutíveis de que eles foram seres vivos. O mais interessante é que alguns antibióticos que atuam em bactérias livres acabam atacando também a mitocôndria. Em resumo, todos os seres eucariotos surgiram no planeta de uma célula quimera: combinação de célula com característica de bactéria e archaea. Vamos ver agora quais são essas características: Bactéria https://www.freepik.com/free-photo/3d-abstract-medical-background-with-virus-cells-dna-strands_4007390.htm http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html Fonte: Freepik Em destaque, há a presença de uma estrutura externa formada por carboidratos e peptídeos denominada parede celular. https://pixabay.com/pt/illustrations/bact%C3%A9rias-m%C3%A9dica-biologia-sa%C3%BAde-3662695/ Clique nos botões para ver as informações. Há nas mais variadas formas: Distribuição Outro tipo de agrupamento dependendo do gênero e da espécie. Organização Provém de compostos produzidos por organismos vivos ou mortos, embora bactérias também produzam a sua fonte de energia (fotossintéticas). Nutrição Ocorre por divisão de uma célula em duas iguais (�ssão binária). Reprodução Este domínio agrupa 16 �los de acordo com: Tipo de fonte de carbono; Tipo de energia; Faixa de pH ótima para crescimento; Temperatura. Filos De todos os seus �los, destacam-se as proteobactérias, bactérias com uma enorme diversidade morfológica e metabólica. Muitas proteobactérias possuem importância médica: exemplares dos gêneros entérica, Escherichia, Salmonella e Enterobacter estão associados a infecções intestinais bacterianas. A mitocôndria – lembre-se da endossimbiose - surgiu a partir de uma proteobactéria, especi�camente de um tipo semelhante à atual Riquétsia (bactéria parasita intracelular). Incluem-se também nesse �lo bactérias importantes do solo, como Azotobacter (�xadoras de nitrogênio) e Nitrosomonas (oxidam amônia). Salmonella, exemplo de proteobactéria | Fonte: Wikipedia Gram-negativas Agrupam bactérias dos gêneros Staphylococcus, Streptococcus, Mycobacterium e Clostridium. Elas são responsáveis por: Infecções de pele; Orofaringe; Tuberculose; Tétano; Outras infecções. Gram-positivas Comentário Os �los cianobactérias e procloró�tas são responsáveis pela síntese de oxigênio na Terra. Já bactérias hipertermó�las de rami�cação precoce são capazes de crescer em temperaturas de 90°C. https://pt.wikipedia.org/wiki/Salmonella#/media/File:SalmonellaNIAID.jpg Archaea Fonte: Wikipedia Bactéria altamente especializada em resistir a temperaturas altas ou muito baixas nos ambientes com concentrações elevadas de sal e valores extremos de pH. Sua capacidade de adaptação evita a desnaturação das suas proteínas e impede o rompimento celular. As bactérias hipertermó�las estão localizadas em fontes termais ricas em enxofre e fendas termais de águas profundas. 9 Exemplo Pyrococcus furiosus (uma hipertermó�la do �lo Euryarchaeota) possui a temperatura ótima de crescimento em 100°C. Já o �lo Crenarchaeota contém arqueas que vivem tanto em água fervente como em ponto de congelamento, embora a maioria permaneça em ambientes com temperaturas de 80°C. Águas termais são locais abundantes para arqueas resistentes a altas temperaturas. | Fonte: Wikipedia Eukarya https://en.wikipedia.org/wiki/Bacteria#/media/File:EscherichiaColi_NIAID.jpg http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html https://en.wikipedia.org/wiki/Archaea#/media/File:Grand_prismatic_spring.jpg Árvore filogenética do domínio Eukarya. | Fonte: Wikipedia Fonte: Pixabay Possui enorme diversidade de organismos. Sua relação �logenética foi construída com base no RNA ribossômico (rRNA), que, em eucariotos, é altamente conservado e mantém relações com os outros domínios. O registro �logenético do domínio eukarya data de 2 bilhões de anos, quando ocorreu o maior acúmulo de oxigênio na atmosfera e a camada de ozônio permitiu o aumento do número de habitats disponíveis para a colonização. Nas últimas décadas, os estudos de ecologia microbiana molecular evidenciaram que a maioria dos micro-organismos presentes em um habitat jamais foi cultivado. A evolução de técnicas de identi�cação de sequências genômicas permite criar chips de 1 a 2 centímetros disponíveis para análise de amostras de DNA de vários organismos. Esses microarranjos se compõem, na verdade, de 5.000 a 6.000 genes que podem hibridizar com amostras-teste e veri�car a presença de determinado gene. Vamos ver alguns desses: https://pt.wikipedia.org/wiki/%C3%81rvore_filogen%C3%A9tica#/media/File:Phylogenetic_tree_pt.svg https://pixabay.com/pt/illustrations/v%C3%ADrus-microsc%C3%B3pio-infec%C3%A7%C3%A3o-doen%C3%A7a-4030721/ Fungo aquático | Fonte: Wikipedia Algas e fungos Coletivamente, os eucariotos microbianos – produtores primários - são chamados de protistas. Alguns são fototró�cos , como as algas, que contêm cloroplastos e vivem em ambientes com poucos minerais. Já os fungos, que não possuem pigmentos fotossintetizadores , apresentam-se como unicelulares ou �lamentosos. 10 11 Atenção As algas e os fungos possuem parede celular; os protozoários, não. Móveis e �agelados, os protozoários surgiram em uma rami�cação precoce na árvore Eukarya. Eles vivem em ambientes aquáticos - e vários são patógenos para o homem e outros animais. 12 Physarum psittacinum. | Fonte: Wikipedia Bolores ou mofos limosos Trata-se de outra informação importante em termos de evolução. Eles foram os primeiros protistas a se agruparem para cooperação celular num esboço de estruturas multicelulares. Suas células se reúnem, formando uma estrutura multicelular chamada de corpo de fruti�cação. Os esporos saem a partir desse corpo. Líquen sobre um tronco de árvore. | Fonte: Wikipedia Liquens Estruturas formadas por fungos associados a outros organismos. De aparência semelhante a folhas, os liquens crescem sobre rochas, folhas e árvores. Atuam em mutualismo com outros seres fototró�cos, como algas ou cianobactérias (produtores primários). Esses seres dão a cor ao líquen por possuírem compostos carotenoides. Já o fungo confere proteção ao sistema. https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Young_Aquatic_fungus_champignonAquatique_%C3%A0_lamelles_Moyenne-De%C3%BBle_2015_05_34_F.Lamiot.jpg http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html https://en.wikipedia.org/wiki/Physarum#/media/File:Physarum_psittacinum124.jpghttps://pt.wikipedia.org/wiki/L%C3%ADquen#/media/File:Parasita_na_arvore_050806_REFON_2.jpg Vírus | Fonte: Pixabay Vírus Muitos autores excluem a apresentação dos vírus nesta grupo, mas todos os seres vivos são parasitados por eles. Segundo essa ótica, devemos entender e aceitar a sua participação. Mas, a�nal, qual é a origem dos vírus no planeta? Apesar de haver uma certa lógica em sua exclusão da evolução dos domínios – vírus não são considerados formas de vida . E isso é o ponto de saída da virologia molecular para estudar os traços evolutivos dos vírus. Há três hipóteses para a origem dos vírus: Progressiva ou escape: Os vírus surgiram de elementos genéticos que ganharam capacidade de se mover entre células; Regressiva ou de redução: Os vírus são remanescentes de organismos celulares, hipótese ilustrada com exemplares grandes, como o Mimivirus e o vírus da varíola humana; Coevolução dos vírus com os seus hospedeiros naturais; Duas hipóteses (progressiva e regressiva) a�rmam que os vírus surgiram depois das células. Será mesmo? Não tenha certeza disso. Alguns estudos genéticos têm mostrado que os vírus existiram em um mundo pré-celular como unidades de autorreplicação e que eram mais complexos e organizados. Como já aprendemos que existiram moléculas de RNA com atividade enzimática no mundo pré-celular, talvez essas moléculas tivessem a capacidade de infectar as primeiras células. 13 14 Comentário Em 2001, Takemura e seus colaboradores estudaram a pressão evolutiva dos vírus nas células procariotas. Os estudiosos a�rmaram que vírus grandes de genoma DNA entraram em células procariotas por um evento de endossimbiose, tornando-se permanentes na célula e impulsionando a formação de um núcleo primitivo. Independentemente das teorias, a virologia é um campo de estudos fascinante que nos faz cada vez mais acreditar que o conceito simplista de vírus como entidade parasitária não corresponde ao seu papel no planeta. https://pixabay.com/pt/illustrations/v%C3%ADrus-microsc%C3%B3pio-infec%C3%A7%C3%A3o-doen%C3%A7a-1812092/ http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html http://estacio.webaula.com.br/cursos/go0070/aula2.html Atividade 1. Caracterize metabolicamente o último ancestral comum (LUCA). 2. Assinale as opções que representam os três domínios de vida: a) Procarioto, Bactéria e Eucarioto b) Eukarya, Batéria e Archeae c) Eucarioto, Archeae e Procarioto d) Bactéria, Eucarya e Procarioto 3. Qual a hipótese para a formação de uma organela geradora de energia? 4. Qual a hipótese para o aparecimento dos vírus no planeta? Notas Estromatólitos 1 Massas microbianas fossilizadas. Precipitados 2 Contendo magnésio, sulfetos de ferro e níquel. Cianobactérias 3 Trata-se, portanto, de células - e isso nos faz compreender que não foram as cianobactérias os primeiros seres vivos como até então se supunha. Autótrofa 4 Seres vivos que produzem seu próprio alimento. Ancestral Luca 5 Em resumo, eles chegaram a identi�car 355 genes ancestrais, mostrando que bactérias e arqueas são derivadas �logeneticamente da LUCA e que, depois, surgiu um novo ramo, de onde derivavam os eucariotos. Procariota 6 Procarioto vem de uma palavra grega que signi�ca pré-núcleo. Mesmo local 7 Diferentemente dos eucariotos, onde a replicação e a transcrição acontecem no núcleo e a tradução, no citoplasma. Incorporação 8 Um processo chamado de endossimbiose. Hipertermó�las 9 Organismo que sobrevive em temperaturas extremamente altas, acima de 60°C. Fototró�cos 10 Utilizam a luz para as suas necessidades energéticas. Fotossintetizadores 11 A importância deles na reciclagem de matéria orgânica é signi�cativa: fungos, que se nutrem de matéria em decomposição,são os principais agentes de biodegradação na natureza. Patógenos 12 Organismos capazes de causar doenças em seu hospedeiro. Vida 13 Vírus comportam-se como tal dentro de células durante a replicação do seu genoma. Mimivirus 14 O Mimivirus é um vírus gigante, volumoso, com genoma de 1,2 milhão de pares de base e que não demonstra ser totalmente dependente da célula hospedeira para se replicar. Alguns virologistas a�rmam que ele seria um descendente de ancestrais mais complexos. Mimivirus, vírus de genoma DNA cujo ancestral foi responsável pela pressão evolutiva de células eucariotas. | Fonte: Wikipedia Referências CARDOSO, A. M. et al. Archaea: potencial biotecnológico. In: Revista biotecnologia ciência e desenvolvimento. n. 30. jan./jun. 2003. Acesso em: https://www.arca.�ocruz.br/bitstream/icict/12137/2/Biotec%20Cienc%20Desenv_30.pdf. Acesso em: 20 fev. 2019. JEREW, B. Synthetic fuel from carbon dioxide by tweaking 'Pyrococcus Furiosus' bacteria. In: The green optimistic. 28 mar. 2013. Disponível em: https://www.greenoptimistic.com/synthetic-fuel-pyrococcus-furiosus-20130328/#.XG1IROhKgdV. Acesso em: 20 fev. 2019. WEISS, M. C. et al. The physiology and habitat of the last universal common ancestor. In: Nature microbiology. v. 1. 25 jul. 2016. Disponível em: https://www.nature.com/articles/nmicrobiol2016116. Acesso em: 20 fev. 2019. WESSNER, D. R. The origins of viruses. In: Nature education. v. 3. n. 9. Disponível em: https://www.nature.com/scitable/topicpage/the-origins-of-viruses-14398218. Acesso em: 20 fev. 2019. Próxima aula Formas das células procariotas nos vários ambientes do planeta; Bases �siológicas das estruturas de procariotos; Vírus e morfologia viral. Explore mais Estudos da origem da vida no planeta – microfósseis https://en.wikipedia.org/wiki/Mimivirus#/media/File:Mimivirus_svg.svg http://www.enigmasdouniverso.com/cientistas-encontraram-evidencias-mais-antigas-de-vida-na-terra-na-australia/ evidencias mais antigas de vida na terra na australia/> Paramecium caudatum http://www.enigmasdouniverso.com/cientistas-encontraram-evidencias-mais-antigas-de-vida-na-terra-na-australia/ https://www.youtube.com/watch?v=jctNl30Cv_I