Alguns fungos têm se mostrado importantes ao combate de ambientes contaminados por compostos de difícil degradação, como pesticidas, resíduos industriais e metais pesados. Assim, pode-se afirmar: A área responsável por estudos de combate a ambientes contaminados por compostos de difícil degradação é conhecida como biorremediação. Biosorção é outra linha de estudo que se preocupa com a descontaminação de ambientes. A biosorção remove metais pesados ou radioativos através da absorção realizada pelos fungos, ou seja, quando ocorre uma ligação química entre a superfície dos fungos e estes compostos químicos. Alguns fungos adsorvem metais pesados, integrando-os em seu metabolismo. Estes fungos fazem parte do grupo Mucoromycotina. Os basidiomicetos não são tão bons como decompositores de substratos lignocelulósicos, pois possuem estrutura molecular semelhante àquelas encontradas em compostos organoclorados e sintéticos.