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Prova Impressa GABARITO | Avaliação II - Individual (Cod.:955521) Peso da Avaliação 2,00 Prova 84643071 Qtd. de Questões 10 Acertos/Erros 8/2 Nota 8,00 A sigla CRISPR vem do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats e pode ser traduzida como grupos de repetições palindrômicas curtas e regularmente interespaçadas. Já o Cas 9 se refere à nuclease que se encontra associada ao sistema CRISPR. Com base na técnica CRISPR-Cas9, analise as sentenças a seguir: I- Uma molécula de RNA guia (gRNA) é inserida em uma sequência maior de RNA. Quando em contato com o DNA, o gRNA se liga uma a sequência específica do DNA, indicando para a enzima Cas9 onde o DNA deve ser cortado. II- Os mecanismos de reparo de DNA presentes na célula é ativado e utilizado para a inserção, exclusão de pares de bases do DNA ou para efetuar a substituição de segmentos inteiros de DNA por segmentos de DNA personalizados. III- Os efeitos da edição do genoma em células e animais experimentais, pois essa ferramenta se mostra bastante promissora para o tratamento de doenças relacionadas a determinados genes, como a fibrose cística e a hemofilia, e para auxiliar no tratamento de outras doenças, como o câncer. Assinale a alternativa CORRETA: A Somente a sentença II está correta. B Somente a sentença I está correta. C As sentenças I, II e III estão corretas. D Somente a sentença III está correta. Uma das descobertas mais intrigantes do projeto genoma humano foi identificar que somente uma pequena porcentagem de todo genoma codificava uma proteína. Com base nas sequências codificadoras e não codificadoras de proteínas, analise as sentenças a seguir: VOLTAR A+ Alterar modo de visualização 1 2 30/06/2024, 17:12 Avaliação II - Individual about:blank 1/7 I- Sequências codificadoras são chamadas de éxons e são responsáveis por originar sequências de aminoácidos específicas, que corresponde a uma proteína. II- Sequências não codificadoras são denominadas de íntrons, não tendo função conhecida no genoma humano. III- Sequências reguladoras são aquelas denominadas como éxons, regulando quando e quanto de um gene será expresso. Assinale a alternativa CORRETA: A As sentenças I e II estão corretas. B As sentenças II e III estão corretas. C Somente a sentença III está correta. D Somente a sentença II está correta. Por meio do Projeto Genoma Humano, criou-se dois grandes grupos de trabalho independentes, formados por 5.000 cientistas em um consórcio público e da iniciativa privada da empresa Celera Genomics, respectivamente. O intuito foi patentear os genes sequenciados. Com base nas técnicas utilizadas para o sequenciamento, analise as sentenças a seguir I- O shotgun hierárquico sequenciava através da fragmentação do DNA total, que era clonado a partir de diferentes tamanhos de fragmentos de 2 mil, 10 mil e 130 mil pares de base. II- O shotgun hierárquico utilizava como vetor plasmídeos bacterianos comuns, a fim de sequenciar diferentes tamanhos de fragmentos do genoma completo. III- O shotgun de genoma inteiro formava três bibliotecas de DNA, com diferentes tamanhos de fragmentos. Assinale a alternativa CORRETA: A Somente a sentença III está correta. B Somente a sentença II está correta. C As sentenças I e II estão corretas. 3 30/06/2024, 17:12 Avaliação II - Individual about:blank 2/7 D As sentenças I e III estão corretas. A interação entre proteínas e o DNA é de extrema importância na genômica funcional, especialmente pelo fato de que diversas proteínas são reguladoras da expressão gênica. Com base nas técnicas utilizadas para identificar os locais de interação, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) A MNase (nuclease microcócica), uma nuclease específica, capaz de clivar o DNA em pequenos fragmentos, é modificada com a adição de uma proteína, a proteína A (pA) no sequenciamento CUT & RUN. ( ) A MNase modificada com a pA forma regiões de interação entre a proteína e o DNA que podem ser imunoprecipitadas, formando uma amostra rica de precipitados de regiões de interação da proteína de interesse com o DNA. ( ) No sequenciamento ChIP, a proteína de interesse é reticulada ao DNA, ou seja, são formadas ligações covalentes entre a proteína e o DNA por meio da adição de anticorpos específicos para essa proteína. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A V - V - F. B F - V - F. C V - F - V. D F - F - V. [Laboratório Virtual - RT-PCR] A transcrição reversa é uma reação que ocorre pela ação da enzima transcriptase reversa ou RT. Essa enzima é uma DNA polimerase dependente de RNA, ou seja, ela é capaz de sintetizar uma fita de DNA utilizando como molde a fita simples de RNA. Sua descoberta se deu a partir da observação de que, quando os retrovírus, cujo material genético é um RNA, infectam um hospedeiro, o RNA viral é convertido em DNA. Sobre a técnica de RT-PCR, assinale a alternativa CORRETA: A Ao final da técnica, origina-se o RNA mensageiro, a partir do uso da enzima transcriptase reversa. B Nessa técnica, são utilizados somente os quatro dNTPs, a amostra de RNA e os cofatores enzimáticos. 4 5 30/06/2024, 17:12 Avaliação II - Individual about:blank 3/7 C Para o processo de transcrição reversa, são necessários oligonucleotídeos sintéticos e a enzima transcriptase reversa. D A técnica de RT-PCR utiliza a enzima Taq DNA polimerase que adicionará os nucleotídeos à dupla fita de RNA. As regiões responsáveis por codificar ou regular o DNA são conservadas entre as espécies, permitindo driblar um dos grandes desafios do Projeto Genoma Humano, ou seja, a interpretação dos dados, já que grande parte dessa informação era não codificadora. Sobre as sequências codificadoras e reguladoras de DNA, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas: I- A comparação entre espécies que são evolutivamente relacionadas, não possibilita o conhecimento de sequências codificadoras do genoma humano. PORQUE II- Assim pode-se identificar as regiões não codificadoras entre as duas espécies, representando que essas regiões estiveram menos propícias a mutações ao longo do processo evolutivo. Assinale a alternativa CORRETA: A As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. B As asserções I e II são proposições falsas. C As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I. D A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa. Existem diferentes técnicas de ionização que podem ser aplicadas aos peptídeos, sendo as principais delas a ionização/dessorção a laser assistida por matriz (MALDI) e a ionização por eletro spray (ESI). Sobre os processos de ionização utilizados nas análises de proteômica, assinale a alternativa 6 Revisar Conteúdo do Livro 7 30/06/2024, 17:12 Avaliação II - Individual about:blank 4/7 CORRETA: A A ionização por MALDI é considerada branda, sendo aplicável a moléculas sensíveis como DNA e proteínas. B A ionização ESI utiliza cristais que são bombardeados por laser, sendo sublimados (convertidos em fase gasosa) e ionizados durante o processo. C A ionização por MALDI permite degradação de moléculas como DNA e proteínas. D A ionização ESI é considerada agressiva por desnaturar amostras peptídicas. No processo de digestão in gel, os spots contendo as proteínas de interesse são submetidos a um processo de hidrólise química e enzimática, formando fragmentos proteicos menores, capazes de migrar pela malha do gel e se difundir no sobrenadante, formando a amostra que será analisada por espectrometria de massas. De acordo com a digestão in gel, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) As proteínas são apenas separadas de acordo com sua massa molecular, embora, nesse caso, as bandas obtidas do gel representem populações de proteínas com massas similares. ( ) A análise no espectrômetro de massas necessita que a carga líquida se torne negativa, ou seja, o processode ionização não é necessário. ( ) A cromatografia líquida é utilizada como método de fracionamento, em que os peptídeos presentes na amostra são dissolvidos em uma fase líquida, bombeadas para passar por uma fase estacionária e direcionadas para espectrometria de massas. ( ) As amostras podem ser submetidas a outro fracionamento prévio à análise por MS, com o objetivo de reduzir a complexidade da amostra ou apenas complementar o fracionamento já realizado na eletroforese. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A F - F - V - F. B V - V - F - V. C V - F - F - V. D V - F - V - V. 8 30/06/2024, 17:12 Avaliação II - Individual about:blank 5/7 [Laboratório Virtual - RT-PCR] Segundo o sumário da aula prática, a transcrição reversa seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR – reverse transcription polymerase chain reaction) é um método de biologia molecular utilizado desde o início da década de 1980. A partir de conhecimentos em virologia baseados em enzimas responsáveis pela replicação viral, os cientistas estudaram a atividade da enzima transcriptase reversa (RT – reverse transcriptase). Sobre os reagentes utilizados na reação de RT-PCR, analise as opções a seguir: I- Amostra de RNA e Transcriptase reversa. II- Primer F, primer R e OligoDT. III- Buffer e MgCl2. IV- dNTP, Taq DNA polimerase e indutor de RNAse.Assinale a alternativa CORRETA: A As opções I e IV estão corretas. B As opções I, II e III estão corretas. C As opções I, III e IV estão corretas. D As opções II e IV estão corretas. O principal objetivo da genômica estrutural é, além de estudar a estrutura do genoma, manipular fragmentos de DNA e seus genes in loco. A respeito da genômica estrutural, associe os itens, utilizando o código a seguir: I- Mapas cromossômicos de alta resolução. II- Mapas cromossômicos de baixa resolução. III- Mapas cromossômicos físicos. ( ) A segunda etapa determina a posição dos genes dentro de cada cromossomo, fornecendo informações mais precisas sobre esses gene e marcadores no genoma. ( ) A primeira etapa se baseia na ocorrência de um alelo que não esteja presente no mapa cromossômico, em uma região com marcadores já mapeados. Dessa forma, pode-se definir em qual cromossomo aquele novo alelo ocorre. ( ) A terceira etapa aplica diferentes técnicas determinando um mapa físico do genoma e ocorre o sequenciamento. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A II - I - III. 9 10 30/06/2024, 17:12 Avaliação II - Individual about:blank 6/7 B I - III - II. C III - II - I. D I - II - III. Revisar Conteúdo do Livro Imprimir 30/06/2024, 17:12 Avaliação II - Individual about:blank 7/7