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09/06/2023, 14:39 Avaliação II - Individual about:blank 1/5 Prova Impressa GABARITO | Avaliação II - Individual (Cod.:823738) Peso da Avaliação 1,50 Prova 66493804 Qtd. de Questões 10 Acertos/Erros 8/2 Nota 8,00 Durante o Projeto Genoma Humano, duas grandes frentes de trabalho independentes foram organizadas, uma formada por cerca de 5.000 cientistas em um consórcio público e a segunda por meio da iniciativa privada da empresa Celera Genomics, cujo objetivo era patentear os genes sequenciados. Com base nas técnicas utilizadas para o sequenciamento, analise as sentenças a seguir: I- O shotgun hierárquico sequenciava através da fragmentação do DNA total, que era clonado a partir de diferentes tamanhos de fragmentos de 2 mil, 10 mil e 130 mil pares de base. II- O shotgun de genoma inteiro formava três bibliotecas de DNA, com diferentes tamanhos de fragmentos. III- O shotgun hierárquico utilizava como vetor plasmídeos bacterianos comuns, a fim de sequenciar diferentes tamanhos de fragmentos do genoma completo. Assinale a alternativa CORRETA: A As sentenças I e II estão corretas. B As sentenças I e III estão corretas. C Somente a sentença III está correta. D Somente a sentença II está correta. A era da genômica iniciou-se através do Projeto Genoma Humano, através do desenvolvimento de tecnologias que pudessem acelerar o processo. De acordo com o Projeto Genoma Humano, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) A técnica do shotgun hierárquico utilizou como vetor o BAC (cromossomo artificial de bactéria), que permite a inserção de grandes fragmentos de DNA, sendo clonado para formação da biblioteca de DNA. ( ) A técnica do shotgun hierárquico utilizou o vetor plasmidial, onde cromossomo artificial de bactéria era fragmentado e inserido em vetores plasmidiais clonados com extremidades sequenciadas. ( ) A técnica do shotgun de genoma inteiro utilizou somente pequena parte do genoma completo de um organismo para formar vetores plasmidiais clonados com extremidades sequenciadas, que formavam os contigs. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A F - F - V. B V - V - F. C V - F - V. VOLTAR A+ Alterar modo de visualização 1 2 09/06/2023, 14:39 Avaliação II - Individual about:blank 2/5 D V - F - F. A grande vantagem da utilização do RNA-seq é que, nesta tecnologia, não é necessário que se tenha prévio conhecimento do genoma ou dos transcritos que serão avaliados. Algumas das aplicações relacionadas a essa técnica são: a avaliação da expressão gênica diferencial, análise do perfil do transcriptoma e a investigação de SNPs. Com base nas etapas para do método da transcriptoma RNA-seq, ordene os itens a seguir: I- Fragmentar as moléculas por ação de enzimas de restrição, sonicação ou nebulização, formando fragmentos que serão ligados a adaptadores (pequenas sequências de nucleotídeos que indicam onde o sequenciamento deve ser iniciado em cada molécula). II- Isolar e fragmentar o RNA a ser sequenciado e convertê-lo em cDNA. III- Aplicar métodos de sequenciamento para sequenciar pequenas porções, compostas por 30 a 200 pb (pares de bases), de cada um dos fragmentos. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A II - I - III. B I - III - II. C I - II - III. D II - III - I. A interação entre proteínas e o DNA é de extrema importância na genômica funcional, especialmente pelo fato de que diversas proteínas são reguladoras da expressão gênica. Com base nas técnicas utilizadas para identificar os locais de interação, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) A MNase (nuclease microcócica), uma nuclease específica, capaz de clivar o DNA em pequenos fragmentos, é modificada com a adição de uma proteína, a proteína A (pA) no sequenciamento CUT & RUN. ( ) A MNase modificada com a pA forma regiões de interação entre a proteína e o DNA que podem ser imunoprecipitadas, formando uma amostra rica de precipitados de regiões de interação da proteína de interesse com o DNA. ( ) No sequenciamento ChIP, a proteína de interesse é reticulada ao DNA, ou seja, são formadas ligações covalentes entre a proteína e o DNA por meio da adição de anticorpos específicos para essa proteína. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A V - F - V. B F - V - F. C F - F - V. D V - V - F. 3 4 09/06/2023, 14:39 Avaliação II - Individual about:blank 3/5 [Laboratório Virtual - RT-PCR] Segundo o sumário da aula prática, em um contexto mais atual de sua importância, pode-se dizer que, na pandemia de COVID-19, o RT-PCR em tempo real é um dos métodos de melhor utilização e confiabilidade para detectar o RNA viral no SARSCoV-2. De acordo com essa prática, assinale a alternativa CORRETA: A O estágio de polimerização antecede o estágio da transcrição reversa. B Todos os estágios da RT-PCR são realizados na bancada comum e transferidos para o termociclador. C A transcrição reversa utiliza a enzima Taq DNA polimerase como responsável por converter o cDNA em RNA. D Inicialmente, preparamos a reação de transcrição reversa e em seguida a polimerização. As fases de leitura aberta (ORF) compreendem os códons de início (ATG) e de parada (TAA, TAG ou TGA), que para o RNA são substituídos pela uracila. Sobre o exposto, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas: I- ORFs que contenham 100 ou mais códons podem ser indicadas como possíveis genes presentes no genoma que está sendo avaliado. PORQUE II- A presença do códon de início no genoma é um indicativo de um gene funcional, pois essa mesma sequência, quando encontrada no RNA (ou seja, na forma AUG), indica o local de início do processo de tradução da proteína codificada pelo RNA. Assinale a alternativa CORRETA: A A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira. B As asserções I e II são proposições falsas. C As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I. D As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. No processo de digestão in gel, os spots contendo as proteínas de interesse são submetidos a um processo de hidrólise química e enzimática, formando fragmentos proteicos menores, capazes de migrar pela malha do gel e se difundir no sobrenadante, formando a amostra que será analisada por espectrometria de massas. De acordo com a digestão in gel, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) As proteínas são apenas separadas de acordo com sua massa molecular, embora, nesse caso, as bandas obtidas do gel representem populações de proteínas com massas similares. ( ) A análise no espectrômetro de massas necessita que a carga líquida se torne negativa, ou seja, o processo de ionização não é necessário. ( ) A cromatografia líquida é utilizada como método de fracionamento, em que os peptídeos presentes na amostra são dissolvidos em uma fase líquida, bombeadas para passar por uma fase estacionária e direcionadas para espectrometria de massas. ( ) As amostras podem ser submetidas a outro fracionamento prévio à análise por MS, com o 5 6 7 09/06/2023, 14:39 Avaliação II - Individual about:blank 4/5 objetivo de reduzir a complexidade da amostra ou apenas complementar o fracionamento já realizado na eletroforese. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A F - F - V - F. B V - V - F - V. C V - F - F - V. D V - F - V - V. A sigla CRISPR vem do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats e pode ser traduzida como grupos de repetições palindrômicas curtas e regularmente interespaçadas. Já o Cas 9 se refere à nuclease que se encontra associada ao sistema CRISPR. Com base na técnica CRISPR-Cas9, analise as sentenças a seguir: I- Uma molécula de RNA guia (gRNA) é inserida em uma sequência maior de RNA. Quando em contato com o DNA, o gRNA se liga uma a sequência específica do DNA, indicando para a enzima Cas9 onde o DNA deveser cortado. II- Os mecanismos de reparo de DNA presentes na célula é ativado e utilizado para a inserção, exclusão de pares de bases do DNA ou para efetuar a substituição de segmentos inteiros de DNA por segmentos de DNA personalizados. III- Os efeitos da edição do genoma em células e animais experimentais, pois essa ferramenta se mostra bastante promissora para o tratamento de doenças relacionadas a determinados genes, como a fibrose cística e a hemofilia, e para auxiliar no tratamento de outras doenças, como o câncer. Assinale a alternativa CORRETA: A Somente a sentença II está correta. B Somente a sentença I está correta. C Somente a sentença III está correta. D As sentenças I, II e III estão corretas. A genômica estrutural busca determinar qual é esse local e onde estão os marcadores associados a cada um dos genes encontrados. Sobre os termos utilizados para denominar os locais de um cromossomo, assinale a alternativa CORRETA: A O termo homólogo se refere aos diferentes cromossomos, que apresentam genes heterógenos. B O termo locus se refere a uma das formas em que um gene pode ser encontrado em um cromossomo. C O termo locus se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo. 8 9 09/06/2023, 14:39 Avaliação II - Individual about:blank 5/5 D O alelo se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo. [Laboratório Virtual - Cromatografia em coluna e em camada delgada] Para realizar a cromatografia, inicialmente é necessário preparar a coluna cromatográfica. Esse preparo exige que alguns passos sejam seguidos. De acordo com o método para preparar a coluna cromatográfica, ordene os itens a seguir: I- Colocar um algodão na bureta com o auxílio do bastão de vidro e acoplar o funil. II- Adicionar a solução de hexano, armazenada na pisseta, no béquer contendo sílica em gel (béquer 1). III- Com o auxílio do bastão de vidro, misture o hexano com a sílica em gel. Em seguida, transfira o conteúdo do béquer 1 para a bureta. Depois, sedimente o adsorvente da proveta com os dedos. ( ) Primeira etapa. ( ) Segunda etapa. ( ) Terceira etapa. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A I - II - III. B II - I - III. C III - II - I. D I - III - II. 10 Imprimir