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Questões e Problemas – Biologia Molecular (Cap. 13) 1. Uma molécula de RNA tem as seguintes porcentagens de bases: A = 23%, U = 42%, C = 21% e G = 14%. a. Esta molécula de RNA tem fita simples ou fita dupla? Como você pode saber? É provável que a molécula de RNA seja fita única. Se ela for fita dupla, esperaríamos porcentagem quase iguais de adenina e uracila, assim como porcentagens iguais de guanina e citosina. Nesta molécula de RNA, as porcentagens destes potenciais pares de bases não são iguais, então a molécula é fita única; b. Quais seriam as porcentagens de bases na fita molde do DNA que tem o gene para este RNA? Como a fita molde de DNA é complementar à molécula de RNA, esperaríamos porcentagens iguais para as bases na complementaridade de DNA para as bases de RNA. Portanto, esperaríamos no DNA A = 42%, T = 23%, C = 14% e G = 21%. 2. Escreva a sequência consenso para o conjunto a seguir de sequências de nucleotídios. AGGAGTT AGCTATT TGCAATA ACGAAAA TCCTAAT TGCAATT A sequência consenso é identificada ao determinar qual nucleotídio é usado com maior frequência em cada posição. Para os dois nucleotídios que ocorrem em uma mesma frequência na primeira posição, ambos estão listados na posição na sequência e identificados por uma barra: T/A G C A A T T. 3. Escreva uma sequência hipotética de bases que pode ser encontrada nos primeiros 20 nucleotídios de um promotor de um gene bacteriano. Inclua ambas as fitas de DNA e identifique as extremidades 5ʹ e 3ʹ de ambas as fitas. Certifique-se de incluir o sítio de início para transcrição e qualquer sequência consenso encontrada no promotor. A região –10 ou Pribnow Box tem a sequência consenso de TATAAT. Entretanto, alguns promotores bacterianos têm a sequência consenso exata. 4. Os nucleotídios de DNA a seguir foram encontrados próximo da extremidade de uma unidade de transcrição bacteriana. 3ʹ-AGCATACAGCAGACCGTTGGTCTGAAAAAAGCATACA-5ʹ (LETRAS A e C resposta no livro). (b) Este terminador é independente ou dependente de Rho? Com base na potencial estrutura em grampo que pode se formar e a corrida de U que será sintetizada no RNA, este terminador é um terminador independente de Rho (intrínseco). 35. Por meio da engenharia genética, o geneticista faz uma mutação no gene que codifica TBP em células humanas cultivadas. Esta mutação destrói a capacidade do TBP em se ligar a TATA box. Preveja o efeito desta mutação nestas células. Se TBP não pode se ligar a TATA box, então os genes com estes promotores serão transcritos em taxas muito baixas ou não serão transcritos. Como a TATA box é o elemento promotor mais comum para as unidades de transcrição da RNA polimerase II e é encontrada em alguns promotores de RNA polimerase III, a transcrição cai significativamente. É mais provável que a falta de proteínas codificadas por estes genes resulte na morte celular.