Os linfócitos B diferenciam-se em plasmócitos, responsáveis pela produção de anticorpos solúveis (imunoglobulinas). A IgM é a primeira a ser detectada, surgindo em altos níveis cerca de 15 dias após a infecção pelo Trypanosoma cruzi, sendo utilizada como marcador da fase inicial. Também ocorre a produção precoce de IgG e suas subclasses, enquanto na fase crônica da Doença de Chagas predomina a IgG2a. Além da produção de anticorpos, as células B participam da apresentação de antígenos e da secreção de citocinas, contribuindo para a modulação da resposta imune.