Vamos analisar as alternativas apresentadas em relação ao pensamento de João Amos Comênio sobre a didática e a organização do ensino. A) Por níveis independente das idades e desenvolvimento dos alunos. - Essa opção não reflete a abordagem de Comênio, que considerava a importância do desenvolvimento dos alunos. B) Apenas por níveis de desenvolvimento intelectual de cada indivíduo. - Embora Comênio tenha se preocupado com o desenvolvimento, essa opção é muito restrita e não abrange sua visão mais ampla. C) Por níveis respeitando o aprendizado dentro do pensamento clássico de tradição e filosofia empirista. - Essa opção menciona tradições, mas não é a melhor representação do sistema de ensino de Comênio. D) Por diferentes níveis, respeitando o estágio de desenvolvimento de cada indivíduo, presente até os dias atuais. - Esta opção reflete a ideia de Comênio de que o ensino deve ser adaptado ao estágio de desenvolvimento dos alunos, o que é uma característica central de sua abordagem. Portanto, a alternativa correta é: D) por diferentes níveis, respeitando o estágio de desenvolvimento de cada indivíduo, presente até os dias atuais.