Apomorfia refere-se a características derivadas que são exclusivas de um grupo, enquanto plesiomorfia refere-se a características ancestrais que são compartilhadas por grupos mais amplos. Na análise filogenética, a identificação dessas características é crucial para entender as relações evolutivas. As apomorfias ajudam a definir grupos monofiléticos, enquanto as plesiomorfias podem indicar ancestralidade comum. Essa distinção é fundamental para a construção de árvores filogenéticas, pois permite traçar a história evolutiva e as divergências entre os organismos.