Vamos analisar cada afirmativa sobre as endonucleases de restrição: I. A propriedade de reconhecimento da sequência nucleotídica independe da origem do DNA. Verdadeiro, as endonucleases de restrição reconhecem sequências específicas de nucleotídeos, independentemente da origem do DNA. II. As endonucleases de restrição não têm preferência de corte pelo sentido 5' ou 3' e também não cortam as fitas complementares do DNA nos mesmos pontos, o que gera fragmentos com diferentes nucleotídeos. Falso, as endonucleases de restrição geralmente têm uma preferência de corte e costumam cortar as fitas complementares nos mesmos pontos, resultando em fragmentos que têm extremidades compatíveis. III. Os fragmentos de RNA formados pela ação das endonucleases de restrição podem se ligar dependendo da origem da molécula, porque todos têm terminações com apenas um filamento. Falso, as endonucleases de restrição atuam principalmente no DNA, e os fragmentos resultantes são de DNA, não de RNA. Além disso, as extremidades geradas podem ser de diferentes tipos (cohesive ou blunt), mas não se referem a "terminações com apenas um filamento". Com base nas análises, apenas a afirmativa I está correta. Portanto, a alternativa correta é: A. Apenas a afirmativa I está correta.