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Diferentemente do genoma, que é idêntico em todas as células somáticas de um mesmo organismo, uma importante característica do transcriptoma é ser específico em cada tipo celular e se apresenta de maneira bastante variável a diferentes condições, refletindo efeitos de diferentes estímulos, sejam eles químicos, fisiológicos, patológicos, entre outros.
Sobre as técnicas utilizadas para análise do transcriptoma, assinale a alternativa CORRETA:
A O método EST tem todo o cDNA clonado sequenciado, fornecendo informações sobre a região codificadora do RNA mensageiro.
B A ORESTES sequencia somente as extremidades do cDNA, identificando o RNA por meio de comparações com bancos de dados, como o BLAST.
C Tanto a metodologia utilizada pela EST quanto a ORESTES, comparam os dados obtidos com bancos de dados disponíveis, como o BLAST, a fim de identificar os genes correspondentes.
D A técnica do microarray, ou microarranjos de DNA limita a busca de genes a um pequeno número de cDNA, pois necessita de sondas específicas marcadas com fluoróforo.
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BIOLOGIA MOLECULAR - AVALIAÇÃO II
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BIOLOGIA MOLECULAR - AVALIAÇÃO II

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há 10 meses

Vamos analisar cada uma das alternativas para identificar a correta sobre as técnicas utilizadas para análise do transcriptoma: A) O método EST tem todo o cDNA clonado sequenciado, fornecendo informações sobre a região codificadora do RNA mensageiro. - Esta afirmação é parcialmente verdadeira, mas o método EST (Expressed Sequence Tag) não necessariamente sequencia todo o cDNA, apenas fragmentos. B) A ORESTES sequencia somente as extremidades do cDNA, identificando o RNA por meio de comparações com bancos de dados, como o BLAST. - Esta afirmação é correta. ORESTES (Oligo-cDNA Ends) realmente se concentra nas extremidades do cDNA. C) Tanto a metodologia utilizada pela EST quanto a ORESTES, comparam os dados obtidos com bancos de dados disponíveis, como o BLAST, a fim de identificar os genes correspondentes. - Embora ambas as metodologias possam usar bancos de dados, a afirmação não é precisa em relação ao funcionamento específico de cada uma. D) A técnica do microarray, ou microarranjos de DNA limita a busca de genes a um pequeno número de cDNA, pois necessita de sondas específicas marcadas com fluoróforo. - Esta afirmação é um pouco enganosa, pois os microarrays podem analisar muitos genes simultaneamente, mas realmente utilizam sondas específicas. Após essa análise, a alternativa correta é: B) A ORESTES sequencia somente as extremidades do cDNA, identificando o RNA por meio de comparações com bancos de dados, como o BLAST.

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A genômica estrutural é o estudo da estrutura propriamente dita do genoma, sendo seu principal objetivo atrelado à possibilidade de manipulação de fragmentos do DNA ou de seus genes in loco. Sobre a genômica estrutural, associe os itens, utilizando o código a seguir:
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
I- Mapas cromossômicos de alta resolução.
II- Mapas cromossômicos de baixa resolução.
III- Mapas cromossômicos físicos.
( ) A primeira etapa se baseia na ocorrência de um alelo que não esteja presente no mapa cromossômico, em uma região com marcadores já mapeados. Dessa forma, pode-se definir em qual cromossomo aquele novo alelo ocorre.
( ) A segunda etapa determina a posição dos genes dentro de cada cromossomo, fornecendo informações mais precisas sobre esses gene e marcadores no genoma.
( ) A terceira etapa aplica diferentes técnicas determinando um mapa físico do genoma e ocorre o sequenciamento.
A - I - II - III.
B - I - III - II.
C - III - II - I.
D - II - I - III.

A determinação da região de um gene no cromossomo pode ser realizada pela técnica de eletroforese em gel de campo pulsado.
Sobre essa técnica, assinale a alternativa CORRETA:
A O campo pulsado se deve à correte elétrica comum aplicada à eletroforese em gel.
B Essa técnica é utilizada para detecção de grandes cromossomos somente, pois os pequenos cromossomos não conseguem ser isolados nas bandas do gel.
C O campo pulsado se deve à corrente elétrica que se alterna perpendicularmente ao gel.
D Essa técnica identifica a presença ou não de DNA na amostra, não sendo possível indicar sua localização.

A genômica estrutural busca determinar qual é esse local e onde estão os marcadores associados a cada um dos genes encontrados. Sobre os termos utilizados para denominar os locais de um cromossomo, assinale a alternativa CORRETA:
A O termo locus se refere a uma das formas em que um gene pode ser encontrado em um cromossomo.
B O termo homólogo se refere aos diferentes cromossomos, que apresentam genes heterógenos.
C O termo locus se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo.
D O alelo se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo.

Existem diferentes técnicas de ionização que podem ser aplicadas aos peptídeos, sendo as principais delas a ionização/dessorção a laser assistida por matriz (MALDI) e a ionização por eletro spray (ESI). Sobre os processos de ionização utilizados nas análises de proteômica, assinale a alternativa CORRETA:
A A ionização ESI é considerada agressiva por desnaturar amostras peptídicas.
B A ionização por MALDI permite degradação de moléculas como DNA e proteínas.
C A ionização por MALDI é considerada branda, sendo aplicável a moléculas sensíveis como DNA e proteínas.
D A ionização ESI utiliza cristais que são bombardeados por laser, sendo sublimados (convertidos em fase gasosa) e ionizados durante o processo.

As regiões responsáveis por codificar ou regular o DNA são conservadas entre as espécies, permitindo driblar um dos grandes desafios do Projeto Genoma Humano, ou seja, a interpretação dos dados, já que grande parte dessa informação era não codificadora.
Sobre as sequências codificadoras e reguladoras de DNA, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
I- Uma estratégia utilizada para conhecer as sequências codificadoras do genoma humano é baseada na comparação com outras espécies que sejam evolutivamente relacionadas aos seres humanos, como os camundongos, por exemplo.
II- A partir da estratégia é possível definir quais regiões são não codificadoras entre as duas espécies, indicando que essas regiões estiveram menos sujeitas a mutações ao longo do processo evolutivo.
A As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
B As asserções I e II são proposições falsas.
C A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
D As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.

Durante o Projeto Genoma Humano, duas grandes frentes de trabalho independentes foram organizadas, uma formada por cerca de 5.000 cientistas em um consórcio público e a segunda por meio da iniciativa privada da empresa Celera Genomics, cujo objetivo era patentear os genes sequenciados.
Com base nas técnicas utilizadas para o sequenciamento, analise as sentenças a seguir:
I- O shotgun hierárquico sequenciava através da fragmentação do DNA total, que era clonado a partir de diferentes tamanhos de fragmentos de 2 mil, 10 mil e 130 mil pares de base.
II- O shotgun de genoma inteiro formava três bibliotecas de DNA, com diferentes tamanhos de fragmentos.
III- O shotgun hierárquico utilizava como vetor plasmídeos bacterianos comuns, a fim de sequenciar diferentes tamanhos de fragmentos do genoma completo.
A As sentenças I e III estão corretas.
B Somente a sentença II está correta.
C Somente a sentença III está correta.
D As sentenças I e II estão corretas.

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