Para responder à sua pergunta, vamos analisar as alternativas em relação ao tratamento de esgotos que utiliza bactérias aeróbias. A) Poços rasos - Geralmente não é um método de tratamento que utiliza bactérias aeróbias. B) Fossas rasas - Também não é um método que se destaca pelo uso de bactérias aeróbias. C) Fossas negras - Este tipo de fossa é mais associado ao tratamento anaeróbio. D) Lodos ativados - Este é um processo de tratamento de esgoto que utiliza bactérias aeróbias para decompor a matéria orgânica, sendo uma das metodologias mais comuns em estações de tratamento de esgoto. E) Lagoas de secagem - Embora possam envolver processos biológicos, não são especificamente conhecidas pelo uso de bactérias aeróbias. Diante dessa análise, a alternativa correta é: D) lodos ativados.