A estrutura física da UAN, bem como o seu processo de manipulação, deve seguir um "fluxo higiênico" adequado e ininterrupto. O dimensionamento da edificação e das instalações, segundo Akutsu et al. (2005) e Brasil (2004), deve ser compatível com todas as operações, devendo existir separação entre as diferentes atividades por meios físicos ou por outros meios eficazes a fim de evitar a contaminação cruzada. O teto, a parede e o piso devem possuir revestimento liso, impermeável e lavável, sendo mantidos íntegros, conservados, livres de rachaduras, trincas, vazamentos, infiltrações, bolores, descascamentos e outros que não devem transmitir contaminantes aos alimentos. Com relação à escolha do piso para uma UAN, não basta apenas dimensioná-lo, pois outros fatores devem ser considerados, dentre eles, pode-se destacar que:

a. A aplicação de piso monolítico deve ser considerada, visto ser um fator que favorece a higienização.
b. Deve possuir vários níveis, favorecendo o deslocamento de carros que auxiliam no desenvolvimento das tarefas.
c. A resistência ao ataque de substâncias corrosivas, assim como a permeabilidade, são características secundárias.
d. Quanto à cor, seu índice de reflexão (IR) deve estar situado entre 45% e 50%, recomendando-se a cor preta.
e. A característica antiderrapante não necessita ser observada, pois repercute indiretamente nos índices de acidentes de trabalho.