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MHC classe I
Inicialmente são produzidas as moléculas de MHC: a síntese das moléculas do MHC ocorre no lúmen do RE, e montagem e dobra das moléculas de MHC são mediadas por duas proteínas chamadas CHAPERONAS (a dobra da molécula alfa [e auxiliada pela CALNEXINA – a cadeia parcialmente dobrada é transferida para uma segunda chaperona chamada CALRETICULINA) que auxilia no dobramento final da cadeia alfa e na associação com a cadeia β2microglobulina. 
Na sequência a molécula TAPASINA se associa a molécula de MHC I e permite com que seja formado o complexo “MHC-I/TAPASINA/TAP” que permitirá o carregamento do peptídeo para dentro do lúmen.
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As proteínas presentes no citosol, originadas principalmente de micro-organismos intracelulares, ou de proteínas ou micro-organismos que foram endocitados e que conseguiram escapar do fagossomo, são associadas ao peptídeo UBICTINA que permitem com que sejam degradadas por PROTEOSSOMAS (grandes complexos protéicos). As proteínas são degradadas a pequenas sequencias de aminoácidos “PEPTÍDEO”
Estes peptídeos são então transportados pelo TAP para o lúmen onde são editados pelas moléculas de ERAP, permitindo com que os peptídeos se liguem as moléculas de MHC-I do complexo, fazendo com que o MHC perca a sua afinidade pela TAPASINA e possam ser transportado para fora da célula.
Posteriormente, o complexo MHC-I+ peptídeo é transportado pelo complexo de Golgi a superfície celular.
MHC classe II
Inicialmente são produzidas as moléculas de MHC: a síntese das moléculas do MHC ocorre no lúmen do RE, e montagem e dobra das moléculas de MHC são mediadas por duas proteínas chamadas CHAPERONAS (CALNEXINA), posteriormente, a esta molécula é adicionada a CADEIA INVARIANTE (cadeia invariável) que promove o dobramento e montagem final da molécula, além disso, se liga a molécula de MHC, bloqueando o sítio de ligação ao antígeno (impedindo com que os peptídeos que estão no RE se liguem ao MHC de classe II, e se liguem ao MHC de classe I).
 Na sequência a molécula de MHC II contendo a cadeia invariante é levada por vesículas para fora do RE e são direcionadas as vesículas contendo os Peptídeos e se fundem a elas.
Por outro lado, as proteínas e micro-organismos extracelulares que foram endocitados ou fagocitados ficam mantidos em vesículas e são degradados por enzimas lisossomais (TIOL e ASPARTIL), formando os peptídeos que poderão se ligar as moléculas de MHC-II.
Para que o PEPTÏDEO possa ser associado a molécula de MHC de classe II, é necessário remover a CADEIA INVARIANTE. Para isso, esta cadeia é degradada pelas enzimas lisossomais, deixando apenas um fragmento pequeno chamado de CLIP, este por sua vez é removido pela ação da molécula de HLA-DM. Permitindo com que os peptídeos se liguem ao sitio de ligação, são degradados a resíduos menores de 10-30 aminoácidos. 
Posteriormente, as vesículas contendo o complexo MHC-II+ peptídeo se funde a superfície celular.

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