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Regulação da expressão gênica - Procariotos ● Procariotos não conseguem se deslocar rapidamente em busca de alimentos ou migrar quando o ambiente é desfavorável -> selecionados para responder rapidamente às variações do ambiente ● Os processos que envolvem a manifestação da expressão genética (envolvidos no dogma central), envolvem a regulação do gene -> Genes constitutivos: que não sofrem regulação de expressão -> Genes regulados: podem ser induzidos ou reprimidos ● Conseguem reprimir a transcrição genética que codifica enzimas não necessárias em determinada ocasião, além de ativar genes que codificam as enzimas necessárias naquele momento * Precisa atender a dois critérios: 1 - Devem ser capazes de reconhecer condições ambientais nas quais devem ativar/reprimir a transcrição de genes relevantes 2 - Devem ser capazes de regular a transcrição de cada gene especifico ou de um grupo deles Características ● O RNA bacteriano é policistrônico -> regula o gene que vai ser transcrito e o que não vai * Isso é interessante porque o operon geralmente possui genes que codificam enzimas da mesma via (são todas ativadas juntas) ● Os genes são regulados em unidades transcricionais chamadas operons -> Operon: unidade transcricional do gene ● Cada um possui duas sequências regulatórias: -> Sítio de ligação do ativador -> Operador/sítio de ligação do repressor Reguladores transcricionais ● Permite que o organismo responda à alteração do ambiente (presença ou ausência de nutrientes) ● Cis-atuantes: estão no mesmo cromossomo sobre o qual atuam ● Trans-atuantes: estão em cromossomos diferentes sobre o qual atuam * Exemplo: se uma molécula for expressa no cromossomo e atuar no plasmídeo Tipos de regulação ● Além do sítio promotor da transcrição, existem os sítios para ligação das proteínas reguladoras REGULAÇÃO NEGATIVA ● A molécula ligante é uma repressora que impede fisicamente a ligação entre RNA polimerase e DNA -> Dissociação: o repressor impede fisicamente que a RNA polimerase se ligue ao DNA, porém um sinal molecular pode ligar ao repressor e impedir que se ligue ao DNA (ativa transcrição) -> Associação: o sinal molecular leva à ligação do repressor, impedindo a ligação de RNA polimerase ao DNA (inibe a transcrição) REGULAÇÃO POSITIVA ● Tem um ativador da transcrição que quando em conjunto com a RNA polimerase e DNA, ativa transcrição -> Dissociação: um sinal molecular se liga ao ativador e desliga-o do DNA (inibe transcrição) ~ - -> Associação: um sinal molecular se liga ao ativador e estimula sua afinidade por DNA (ativa transcrição) Metabolismo da lactose ● A bactéria possui afinidade pela glicose pois ela é rapidamente metabolizada (não precisa de muitas enzimas beta- galactosidase para quebrar ligações glicosídicas da lactose, por exemplo) * Porém, se o meio tem somente lactose, a bactéria tem regulação de expressão para transcrever essa enzima (não sintetiza essa enzima quando não é necessário) * O recurso deve ser rápido pela competição que o individuo encontra com os outros, de modo que não produzir nada de galactosidase a todo momento é prejudicial porque os recursos esgotarão ● Pode-se regular o início da transcrição, o interrompimento dela e também, a estabilidade do RNAm na célula (meia vida); além de regular a tradução (quanto de proteína se faz a partir de um RNA) e a proteína propriamente dita (adição de grupos químicos à molécula) Experimento ● Experimento e Jacob e Monod: estudo da produção da beta-galactosidase e E. coli em resposta à lactose -> O operon Lac possuía enzimas da via da lactose e quando mutado, a via se inibia -> LacZ: produz beta-galactosidase -> LacY: produz a galactose permease -> LacA: produz transacetilase -> LacI: mutante que não faz parte do operon (é monocistrônico), ele se liga ao DNA no sulco maior em uma sequência específica de bases (sequência “operador”) e reprime o operon * Repressor Lac: operador se sobrepõe ao Lac, impedindo a transcrição por impedir a ligação do sigma * Na ausência de lactose, o repressor está ligado no operador e não há expressão (pois a própria lactose induz esse sistema e interage com os sítios alostéricos do repressor de modo que ela mesma faz com que a enzima se expresse) -> Ativador: CAP ativa a transcrição e a RNA polimerase * Quando ligada ao AMPc: estimula ligação ao operon e ativa transcrição * Quando desligada de AMPc: desliga do operon e inibe transcrição ● Inconsistência: a lactose só será compreendida se houver permease, mas isso não ocorreria na detecção em primeiro contato com a lactose porque a permease só é transcrita se o operon inteiro for também (o que ainda não ocorreu nesse momento) -> as poucas regiões que possuem a permease já são suficientes para aumentar essa expressão e a inserção de permease (ciclo progressivo) ● Jacob e Monod precisaram medir a atividade da enzima enquanto não havia lactose, então utilizavam um análogo não- metabolizável de lactose que marcava a molécula quando havia atividade ● Na presença de glicose e lactose não havia indução da enzima, pois ela só é necessária na ausência da glicose — MUTAÇÕES ● Mutação no operador: expressão vira constitutiva ● Mutação no LacI: expressão vira constitutiva (LacI inativo não se liga ao operador) - Para saber qual tipo era, verificaram dominância (no cromossomo há uma cópia do operon e no plasmídeo também), então um alelo pode ser regulado e o outro pode ter expressão o tempo todo (mutação no operador) -> cis-dominante - Se ambos produzem repressão normal, pode ter regulação em homozigose ou haploidia (mutação no repressor) -> trans-recessiva — REPRESSÃO CATABÓLITA ● Lactose presente no ambiente tem fragmentação para gerar glicose, e essa entrada de glicose regula: -> Com pouco RNAm, o nível de transcrição é basal ● Com glicose, há menos AMPc e a proteína CAP está menos ativa (desestimula a transcrição) ● Regulação positiva: a proteína (AMPc) ligada ativa a indução Metabolismo do triptofano ● Operon Trp: possui 5 genes regulados negativamente pela presença do triptofano * Os genes servem para síntese de triptofano ● Repressor Trp: inibe a transcrição quando ligado ao operon -> Com triptofano: induz ligação e inibe transcrição -> Sem triptofano: desliga o repressor do operon e ativa transcrição Atenuação da transcrição ● Feita por região atenuadora chamada região líder -> Peptídeo líder (região 1): logo após a região líder -> Região 2 - 3 e 3 - 4: possuem complementaridade e podem formar grampos 2-3 e 3-4 * O grampo 3-4 é o atenuador (interrompe a transcrição) EM ALTA DE TRP ● Ribossomo se posiciona (cobre) sobre a região 2 e forma a alça 3-4, que atenua a transcrição -> Alça 3-4 tem mudanças conformacionais na estrutura do DNA e facilita o desligamento da RNA polimerase EM BAIXA DE TRP ● Ribossomo demora a se deslocar para região 2 -> forma alça 2-3 e continua transcrição 3 AMPo significa ausência de glicose - - - - - S feedbacent Engenharia de operons ● Para manejar bactérias expressando proteínas de interesse sobre determinada condição escolhida artificialmente ● Usa-se: -> 2 RNA polimerases: nativa de E. coli e a T7 (do plasmídeo) * Promotor Lac expressa a T7 e o promotor T7 expressa o gene de interesse -> IPTG: mímico da lactose para testar se o nível de transcrição está correndo -> na ausência de IPTG, o RepLac está inibindo as regiões promotoras e inibindo a transcrição, e vice-versa * Na presença de IPTG, a RNA polimerase de E. coli fica apta a expressar T7 (um tipo de RNA polimerase) e ela se liga ao plasmídeo e expressa o gene de interesse