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● ROTEIRO DE ATIVIDADE PRESENCIAL (AP) Disciplina: Biotecnologia e Enzimologia Professor(a): Suelen Pereira Ruiz Herrig Roteiro de atividade presencial: AP1 ( x ); AP2 ( ); AP3 ( ) Aluno Alexandre Fagner Bernardo da Silva RA: 09035621 1. Orientações de autoestudo para Atividade Presencial Prezado aluno, segue abaixo o material didático a ser estudado para orientá-lo no desenvolvimento da Atividade Presencial (AP). Material Didático Materiais de Autoestudo (Aluno: os materiais indicados pelo professor, devem ser lidos e estudados previamente as atividades práticas) Introdução à Biotecnologia Biotecnologia e a multidisciplinaridade. Tecnologia do DNA Recombinante Biotecnologia e produção de fármacos Microrganismos de interesse industrial Metabolismo microbiano Substratos de fermentação Aulas/Vídeos conceituais (Aluno: as Aulas/Vídeos indicados pelo professor, devem ser assistidos previamente as atividades práticas) Unidade I – aulas 1 a 6 Unidade II – aulas 1, 2 e 3 Materiais Complementares (Aluno: os materiais indicados pelo professor, podem ser utilizados como complemento as atividades práticas) Alberts, B.; Bray, D.; Hopkin, K.; Johnson, A.; Lewis, J.; Raff, M.; Roberts, K.; Walter, P. Fundamentos da Biologia Celular. Porto Alegre: Artmed. https://biblioteca- a.read.garden/viewer/9788582714065/ii BORZANI, Walter (Coord.) Biotecnologia industrial: fundamentos. São Paulo: Edgard Blucher. 2. Orientações para Atividade Presencial (Etapa 1 e Etapa 2) 2.1. Vídeo (s) de Orientação da Atividade Presencial: Link dos Vídeos Link do vídeo da explanação (produzido pelo professor) Link: https://youtu.be/mPBjWsuJd5M Link(s) de vídeo e/ou imagem(s) para demonstração da prática (produzido pelo professor ou terceiros) Link Etapa 1: Extração DNA morango: https://youtu.be/1w5u0XIGydI?si=dPAvHOPoSyF55 lye https://youtu.be/mPBjWsuJd5M https://youtu.be/1w5u0XIGydI?si=dPAvHOPoSyF55lye https://youtu.be/1w5u0XIGydI?si=dPAvHOPoSyF55lye Extração de DNA: https://youtu.be/MOqM8FRbarc?si=1BHTscZzrllsIA HI DNA de morango: https://youtu.be/MLWUOliXziw?si=WuXoaVDEe0 YTYnW2 Extração de DNA: https://youtu.be/qcXPbu5OC- g?si=T5dgjYAisz6GiscO Cebola: https://youtu.be/5KC0m8vG0bY?si=D6zE7w9mAe3 uuNZg Banana: https://youtu.be/ld1-Y-3dJhA?si=V_- I5TH6_gX6Fw6w 3. Contextualização e preparação para a atividade presencial: A biotecnologia é uma área da ciência que utiliza organismos vivos, sistemas biológicos e processos celulares para desenvolver produtos e tecnologias que beneficiam a sociedade em diversas áreas. Entre as várias aplicações da biotecnologia, destacam-se a tecnologia do DNA recombinante, a produção de biofármacos, o estudo dos metabolismos microbianos e os fatores de crescimento de microrganismos. A tecnologia do DNA recombinante revolucionou a biotecnologia, permitindo a manipulação precisa do material genético de organismos. Isso possibilita a criação de organismos geneticamente modificados (OGMs) para melhorar características agrícolas, como resistência a pragas e doenças, ou para produzir alimentos e produtos mais nutritivos. A produção de biofármacos é outra aplicação crucial da biotecnologia. Biofármacos são medicamentos produzidos a partir de células vivas, geralmente microorganismos geneticamente modificados, que produzem proteínas terapêuticas. Isso torna possível a fabricação de tratamentos altamente eficazes para diversas doenças, como insulina para diabetes ou anticorpos monoclonais para câncer e doenças autoimunes. O estudo dos metabolismos microbianos é fundamental para a produção de biocombustíveis e produtos químicos sustentáveis. Microrganismos como bactérias e leveduras podem ser geneticamente modificados para converter matérias-primas renováveis, como açúcares e lignocelulose, em produtos úteis, como etanol ou ácidos orgânicos. Os fatores de crescimento de microrganismos são essenciais para a produção em larga escala de microrganismos utilizados em aplicações biotecnológicas. O controle preciso das condições de crescimento e o fornecimento adequado de nutrientes e fatores de crescimento são fundamentais para obter altos rendimentos na produção de produtos biotecnológicos, como enzimas industriais, proteínas terapêuticas e produtos químicos. 4. Objetivo da atividade: ● Reforçar as aplicações da biotecnologia, pois será um facilitador de todo o seu aprendizado nos temas mais específicos futuramente, pois esses temas trazem conceitos essenciais a todo o estudo. ● Aplicar os conhecimentos obtidos nas aulas conceituais. 5. Descrição da Atividade 5.1. Etapa 1: https://youtu.be/MOqM8FRbarc?si=1BHTscZzrllsIAHI https://youtu.be/MOqM8FRbarc?si=1BHTscZzrllsIAHI https://youtu.be/MLWUOliXziw?si=WuXoaVDEe0YTYnW2 https://youtu.be/MLWUOliXziw?si=WuXoaVDEe0YTYnW2 https://youtu.be/qcXPbu5OC-g?si=T5dgjYAisz6GiscO https://youtu.be/qcXPbu5OC-g?si=T5dgjYAisz6GiscO https://youtu.be/5KC0m8vG0bY?si=D6zE7w9mAe3uuNZg https://youtu.be/5KC0m8vG0bY?si=D6zE7w9mAe3uuNZg https://youtu.be/ld1-Y-3dJhA?si=V_-I5TH6_gX6Fw6w https://youtu.be/ld1-Y-3dJhA?si=V_-I5TH6_gX6Fw6w Nesta atividade prática, os alunos irão realizar a extração de DNA de alimentos, aprendendo a aplicar técnicas laboratoriais básicas. O objetivo é compreender os princípios da extração de DNA, manipular reagentes e soluções específicos, e observar o DNA extraído. Os alunos seguirão um protocolo que inclui a preparação da amostra, filtração e precipitação do DNA. Ao final, os alunos poderão visualizar e analisar o DNA que precipitaram, consolidando o aprendizado sobre biotecnologia. A atividade será realizada: ( ) Individual ( ) Em grupo ( x ) Em dupla Formato da entrega ( x ) Texto ( x ) Foto ( ) Vídeo ( ) Questionário ( ) Áudio ( ) Outro: Atividade prática: Extração de DNA de alimentos Materiais Alimentos: Morangos, banana, cebola e tomate Álcool etílico (etanol) gelado Peneira pequena ou gaze Água destilada Cloreto de sódio Detergente líquido neutro (transparente) Béqueres de 100 mL Pistilo Gral Espátula Papel filtro Funil Tubos de ensaio bastão de vidro Cronômetro Microscópio Lâminas de vidro Lamínula Aparato filtrante (gases ou papel de filtro) Procedimento Preparo da amostra: Higienizar os vegetais em água corrente e secar. Utilize um pistilo para amassar morangos ou banana e faca para triturar pedaços de cebola e tomate, por 5 minutos. Colocar o extrato obtido em um béquer. Preparo da solução de extração: No vegetal triturado, adicione 80 mL de água destilada aquecida (média de 60 ºC), 5 mL de detergente líquido e 5 g de cloreto de sódio. Misturar suavemente: Mexer devagar para não formar espuma e aguardar 30 min. Filtração da mistura: Colocar um filtro ou gaze sobre um funil, ou peneira e posicione-o sobre o béquer. Despejar a mistura através do filtro para remover sólidos, coletando o líquido filtrado no copo abaixo. Este líquido contém o DNA dissolvido. Precipitação do DNA Adicione 40 mL do líquido filtrado em um béquer. Cuidadosamente, adicione uma quantidade igual (40 mL) de álcool etílico frio ao recipiente, vertendo o álcool lentamente pelas paredes do tubo para formar uma camada sobre o líquido filtrado. O DNA precipitará na interface entre as duas camadas. Deixar a mistura repousar por alguns minutos sem agitar. O DNA aparecerá como uma substância esbranquiçada, emaranhada na camada de álcool. Coleta do DNA Use uma pipeta ou conta-gotas para coletar o DNA precipitado da interface das camadas. Retire um pouco dos filamentos e coloque-os em uma lâmina, pingue uma gota da solução extratora, cubra com uma lamínula e em seguida observe ao microscópio na objetiva de 40 x. Exercícios1) Explique a importância do detergente e do cloreto de sódio na solução de extração do DNA. R: O detergente presente no xampu ajuda a dissolver a bicamada lipídica que compõe a membrana plasmática e as membranas das organelas. 2) Tire uma foto dos tubos de ensaio e explique o que ocorreu. Cole aqui as fotos. 3) Desenhe e descreva a aparência do DNA precipitado que você observou ao microscópio. Explique o que pode ter influenciado a clareza e a quantidade de DNA visível na lâmina. R: Quando o DNA é observado ao microscópio após a extração e preparação na lâmina, ele geralmente se apresenta como filamentos finos e emaranhados que podem ter uma coloração esbranquiçada ou translúcida. Esses filamentos são compostos por múltiplas fibras de DNA agrupadas 4) A biotecnologia apresenta aplicações em diversas áreas como saúde, alimentos, ambiental, agropecuária, veterinária e industrial. Sobre as aplicações da biotecnologia, selecione a alternativa correta: a) Com o avanço da biotecnologia na área da saúde, foi possível a elaboração de medicamentos biotecnológicos, porém não é possível a produção de hormônios. b) Com o desenvolvimento das técnicas de biotecnologia na área da agricultura, foi possível a produção de plantas resistentes, fornecendo melhores condições e rendimento na colheita. c) Na área industrial, as aplicações da biotecnologia não proporcionam importância tecnológica e econômica, por serem produtos convencionais, como o etanol. d) As aplicações da biotecnologia na área de alimentos são recentes, não contribuindo para o marco histórico da biotecnologia. e) Na área da medicina veterinária, as aplicações da biotecnologia englobam somente a produção de vacinas. 5) Sobre a tecnologia do DNA recombinante, analise as afirmativas a seguir e assinale verdadeiro (V) ou falso (F): I. É uma técnica que envolve a manipulação de genes de diferentes organismos para criar novas sequências de DNA. II. Consiste em experimentos de biologia molecular na avaliação da expressão de determinados genes. III. É um tecnologia que pode ser empregada apenas na produção de medicamentos. IV. Com a tecnologia do DNA recombinante, ocorreu a produção da insulina. É correto o que se afirma em: a) I, II, III e IV b) II e III c) II e IV d) I, II e IV e) IV apenas 5.2. Etapa 2: A atividade será realizada: ( X ) Individual ( ) Em grupo ( ) Em dupla Formato da entrega ( ) Texto ( ) Foto ( ) Vídeo ( X ) Questionário ( ) Áudio ( ) Outro: 1)A Biotecnologia refere-se ao conjunto de atividades baseadas em conhecimentos multidiciplinares que utiliza agentes biológicos para o desenvolvimento de produtos úteis. Sobre a importância e histórico da Biotecnologia, é correto afirmar que: a) A penicilina foi o primeiro antibiótico descoberto em 1928, sendo um medicamento obtido pela biotecnologia. b) Durante a segunda Guerra mundial, não teve nenhum avanço e contribuições para a biotecnologia. c) A estrutura e natureza do DNA foi descoberta em 1953, porém não contribuiu com nenhum marco histórico na biotecnologia. d) A tecnologia do DNA recombinante permitiu o avanço no desenvolvimento de transgênicos, porém é possível realizar essa técnica apenas com células de tecidos vegetais. e) Após os conhecimentos e avanços das técnicas da tecnologia do DNA recombinante, denomina-se biotecnologia tradicional. 2)Sobre o papel da multidisciplinaridade na biotecnologia, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas: I. A multidisciplinaridade desempenha um papel fundamental na biotecnologia PORQUE II. Envolve a colaboração de profissionais de diversas áreas de atuação para desenvolver soluções e produtos. A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: a) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa correta da I. b) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa correta da I. c) A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa. d) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira. e) As asserções I e II são proposições falsas. 3)Qual é a função das enzimas de restrição (endonucleases) no processo de clonagem de DNA? a) As enzimas de restrição são usadas para amplificar o DNA de interesse. b) As enzimas de restrição são usadas para introduzir o DNA clonado em células hospedeiras. c) As enzimas de restrição são usadas para cortar o DNA em fragmentos específicos, permitindo a inserção do gene de interesse no vetor. d) As enzimas de restrição são usadas para aumentar a expressão gênica. 4)Selecione a alternativa que corresponde com a ordem correta sobre a clonagem gênica: (1) União do vetor ao gene de interesse (2) Clivagem com enzimas de restrição (3) Seleção do vetor e ligação do DNA alvo ao vetor (4) Introdução no organismo hospedeiro (5) Isolamento e fragmento do DNA de interesse Selecione a alternativa que corresponde com a ordem correta: a) 1, 2, 3, 4, 5 b) 2, 4, 5, 3, 1 c) 3, 5, 3, 2, 1 d) 5, 4, 2, 1, 3 e) 5, 2, 3, 1, 4 5)O processo processo pelo qual um fragmento de DNA pode ser replicado em uma célula bacteriana é denominado de: a) Fissão binária b) Meiose c) Transcrição d) Transformação 6)A produção de medicamentos por meio da fermentação microbiana envolve microrganismos específicos que desempenham um papel fundamental. Considerando a complexidade desse processo, analise as alternativas que se referem aos medicamentos obtidos por fermentação microbiana a partir de um microrganismo específico e assinale verdadeiro (V) ou falso (V): ( ) A penicilina é produzida por fermentação pelo microrganismo Penicillium notatum. ( )Cefalosporinas são antibióticos produzidos por fermentação a partir de microrganosmos do gênero Streptomyces. ( ) Cloranfenicol é um antibiótico produzido por Streptomyces venezuelae. ( ) Estreptomicina é um antibiótico produzido por bactérias do gênero Bacillus. É correto afirmar que são corretas: a) V, V, V, V b) V, V, V, F c) F, V, F, V d) V, F, F, F e) F, F, V, V 7)Nos processos biotecnológicos que empregam microrganismos é de grande importância o conhecimento do metabolismo. Sobre o metabolismo microbiano, analise as afirmativas: I. Anabolismo refere-se ao conjunto de reações químicas em um organismo, com componentes essenciais incluindo enzimas e trifosfato de adenosina (ATP), sendo responsável pela síntese de moléculas complexas. II. O catabolismo envolve a síntese de moléculas simples em precursores mais simples. III. O metabolismo é o termo geral que engloba tanto o anabolismo quanto o catabolismo. IV. O catabolismo envolve a quebra de moléculas complexas em precursores mais simples. É correto o que se afirma em: a) I, II, III, IV b) I apenas c) I, II d) I, III, IV e) I e IV 8)Sobre os produtos farmacológicos obtidos por meio da biotecnologia, escreva sobre como ocorre o processo de produção de insulina pela biotecnologia. Destacando suas vantagens em relação às técnicas tradicionais de obtenção da insulina a partir de fontes animais. Além disso, avalie como a produção de insulina por biotecnologia impactou o tratamento de pacientes com diabetes e sua qualidade de vida. R: A partir de uma modificação genética em uma bactéria que passa a produzir insulina a partir do DNA recombinante, identificou-se o gene de interesse, usa-se o plasmídeo da bactéria, o gene de interesse humano, inseriu no vetor plasmidial da bactéria e tem- se a bactéria transgênica, e ela passa a produzir insulina, depois realiza-se a purificação do meio de cultura, separando o meio de cultivo, a célula bacteriana e extrai-se a insulina que é comercializada. Antes era obtido a partir do pâncreas suíno, por ser o mais parecido como humano, no entanto, causava muitas alergias e reações. A produção de insulina com essa técnica impactou de forma positiva o tratamento de pacientes com diabetes pois aumentou a eficiência do tratamento e diminuiu os efeitos colaterais melhorando a qualidade de vida dos pacientes. 9)Nos processos biotecnológicos, os microrganismos apresentam grande importância, a qual deve ter um controle para a obtenção de um produto de qualidade. Sobre os microrganismos de interesse industriais, responda: a) Escreva quais são as fontes de microrganismos de interesse industrial para uso biotecnológico. R: Os fungos e bactérias são os principais microrganismos de interesse industrial, são utilizados na área da biotecnologia, devem ser benéficos para área industrial. As fontes de microrganismos podem ser: • Isolamento de recursos naturais (solo, água etc.) • Compra em coleção de culturas (bancos de cultura comercializados por empresas) • Obtenção de mutantes naturais • Obtenção de mutantes induzidos • Obtenção de mutantes induzidos por técnicas de engenharia genética. b) Explique quais as características desejáveis que esses microrganismos devem possuir para aplicações bem sucedidas na indústria. Além disso, forneça exemplos específicos de setores industriais nos quais os microrganismos desempenham um papel fundamental e como suas características são aproveitadas para melhorar processos industriais. R: Os microrganismos empregados em processos industriais devem possuir características específicas que os tornem eficientes, estáveis e seguros para garantir o sucesso das aplicações. 10)Elabore um resumo esquemático sobre o catabolismo de carboidratos em relação aos mecanismos básicos de respiração celular e fermentação, ou seja, via aeróbica e anaeróbica. Catabolismo de Carboidratos 1. Glicólise • Localização: Citosol • Processo: Conversão de uma molécula de glicose (C6H12O6) em duas moléculas de piruvato (C3H4O3) • Produção de ATP: 2 ATP (net) • Produção de NADH: 2 NADH 2. Respiração Celular Aeróbica • Localização: Mitocôndrias • Etapas: o Ciclo de Krebs (ou Ciclo do Ácido Cítrico): ▪ Entrada: 2 moléculas de acetil-CoA (derivadas de piruvato) ▪ Produção: 2 ATP, 6 NADH, 2 FADH2 o Cadeia Transportadora de Elétrons: ▪ Processo: Transferência de elétrons através de complexos protéicos na membrana mitocondrial interna ▪ Produção: ~34 ATP por fosforilação oxidativa • Produção Total de ATP (por molécula de glicose): ~36-38 ATP 3. Fermentação (via Anaeróbica) • Localização: Citosol • Tipos: o Fermentação Lática: ▪ Processo: Conversão de piruvato em lactato ▪ Produção de NAD+: Regeneração de NAD+ para manter a glicólise ▪ Exemplo: Músculos humanos durante exercício intenso o Fermentação Alcoólica: ▪ Processo: Conversão de piruvato em etanol e CO2 ▪ Produção de NAD+: Regeneração de NAD+ para manter a glicólise ▪ Exemplo: Leveduras na produção de bebidas alcoólicas • Produção Total de ATP (por molécula de glicose): 2 ATP (apenas pela glicólise) Esquema Resumido: 1. Glicólise (Citosol) o Glicose → 2 Piruvato o Produção: 2 ATP, 2 NADH 2. Respiração Celular Aeróbica (Mitocôndria) o Ciclo de Krebs ▪ Acetil-CoA → CO2 + Energia ▪ Produção: 2 ATP, 6 NADH, 2 FADH2 o Cadeia Transportadora de Elétrons ▪ NADH/FADH2 → ATP ▪ Produção: ~34 ATP o Total: ~36-38 ATP 3. Fermentação (Citosol) o Fermentação Lática ▪ Piruvato → Lactato ▪ Produção: Regeneração de NAD+ o Fermentação Alcoólica ▪ Piruvato → Etanol + CO2 ▪ Produção: Regeneração de NAD+ o Total: 2 ATP 11)Nos processos biotecnológicos, os meios de cultivos fornecer condições ideais para o desenvolvimento microbiano e obtenção dos produtos. Sobre os meios de cutivo, explique quais devem ser as características ideais de um meio de cultivo de microrganismos em processos biotecnológicos. Composição Nutricional Completa: • Fonte de Carbono: Açúcares como glicose ou lactose para fornecer energia. • Fonte de Nitrogênio: Aminoácidos, proteínas hidrolisadas ou sais de amônio para síntese de proteínas. • Vitaminas e Minerais: Necessários para diversas funções enzimáticas e estruturas celulares. • Fatores de Crescimento: Substâncias específicas que alguns microrganismos necessitam para crescimento. 2. pH Adequado: • O pH do meio deve ser mantido dentro de uma faixa que favoreça o crescimento do microrganismo alvo, geralmente entre 5,5 e 7,5, dependendo do organismo. 3. Osmolaridade: • Deve ser ajustada para imitar as condições naturais do microrganismo e promover um ambiente isotônico. 4. Estabilidade e Esterilidade: • O meio deve ser estéril para evitar contaminação por outros microrganismos. • Deve ser quimicamente estável durante o período de cultivo para manter suas propriedades nutricionais. 5. Disponibilidade de Oxigênio: • Para microrganismos aeróbicos, o meio deve permitir a difusão adequada de oxigênio. • Para microrganismos anaeróbicos, o meio deve evitar a presença de oxigênio. 6. Temperatura e Condições Físicas: • A temperatura do meio deve ser mantida dentro de uma faixa ideal específica para o microrganismo. • Outros fatores físicos, como agitação e aeração, podem ser necessários para otimizar o crescimento. 7. Capacidade de Suporte de Crescimento Específico: • O meio deve suportar o crescimento de alta densidade celular, especialmente em bioprocessos industriais. 8. Facilidade de Preparação e Custo: • O meio deve ser fácil de preparar, econômico e sustentável para escalonamento em processos industriais. Essas características garantem que o meio de cultivo forneça todas as condições necessárias para o desenvolvimento ótimo dos microrganismos e para a obtenção dos produtos biotecnológicos desejados.