Prévia do material em texto

Você acertou 4 de 10
questões
Verifique o seu desempenho e continue
treinando! Você pode refazer o exercício
quantas vezes quiser.
Verificar Desempenho
A
B
C
1 Marcar para revisão
Durante uma análise cadeia Markoviana Monte
Carlo �MCMC�, o que determina quando uma
cadeia se move da árvore atual para uma nova
árvore?
A cadeia sempre aceitará uma
proposta que produza uma
probabilidade posterior maior do que o
estado atual.
A cadeia Markoviana sempre aceitará
uma proposta que seja consistente
com a anterior.
A cadeia Markoviana aceitará uma
proposta com uma probabilidade que
é fixada no início da pesquisa.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 1/17
D
E
A cadeia rejeitará uma proposta que
produza uma probabilidade de log
maior do que o estado atual.
A probabilidade de aceitar uma
proposta depende da razão entre as
probabilidades posteriores entre o
estado atual e proposto.
Resposta incorreta
Opa! A alternativa correta é a letra
A. Confira o gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma
proposta que produza uma probabilidade
posterior maior do que o estado atual.
Justificativa: Na geração de uma cadeia
Markoviana Monte Carlo �MCMC�, o novo
estado é sempre aceito se a probabilidade
posterior, ou log, for maior que a do estado
atual. Isso significa que a cadeia MCMC
está sempre buscando otimizar a
probabilidade, movendo-se para estados
com maior probabilidade. A probabilidade
não é fixada no início e nem é calculada
por uma razão. Embora seja raro, a cadeia
MCMC pode aceitar um ponto com
probabilidade inferior ao anterior, mas isso
ocorre apenas em circunstâncias
específicas e não é a norma.
2 Marcar para revisão
A seguir são apresentadas diferentes árvores
filogenéticas (de A ao E�.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 2/17
A
B
C
Imagem: Leandro Pederneiras
Após analisar a figura, assinale a alternativa que
retrata de forma correta a interpretação dos
gráficos.
Os ramos curvos das divergências do
gráfico a significam a idade evolutiva
retrocedendo para a raiz.
No gráfico b, ramos mais longos
significam mais longo tempo decorrido
em relação aos ramos curtos.
No tipo de apresentação do gráfico c
a raiz é identificada através do clado
com maior número de ramos
emergindo.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 3/17
D
E
Os dois pontos indicados pelas setas
na figura d, apesar de separados,
possuem idades ancestrais idênticas.
Podemos interpretar dessa forma
porque os pontos estão na mesma
altura no gráfico.
No gráfico e, podemos dizer que o
ponto indicado pela seta laranja é pelo
menos duas vezes mais antigo que o
ponto indicado pela seta azul.
Resposta incorreta
Opa! A alternativa correta é a letra
E. Confira o gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Gabarito: No gráfico e, podemos dizer que
o ponto indicado pela seta laranja é pelo
menos duas vezes mais antigo que o ponto
indicado pela seta azul.
Justificativa: No gráfico E, podemos dizer
que o ponto indicado pela seta laranja na
alternativa E é pelo menos duas vezes mais
antigo que o ponto indicado pela seta azul
porque, ao analisar a escala de tempo, logo
abaixo do gráfico, nota-se a seta azul em
torno de 50 milhões de anos �Ma� e a seta
laranja em torno de 100 Ma. No gráfico A,
uma árvore filogenética em formato circular
apresentam comprimento ramos iguais,
sem escala de tempo. No gráfico B, os
comprimentos mais longos dos ramos
indicam um maior número de mudança
evolutiva. O gráfico C é um tipo de gráfico
não enraizado, ou seja, aquele que
somente nos mostra as relações entre
espécies e suas aproximações, mas sem a
raiz o que indica na árvore um ancestral
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 4/17
A
B
C
D
E
comum. O Gráfico D apenas representa a
relação entre as espécies, sem escala de
tempo, então não podemos avaliar se os
dois ancestrais apresentam a mesma idade
evolutiva.
3 Marcar para revisão
Existem diversas metodologias para buscar a
melhor árvore filogenética. Todas estas
abordagens são fundamentais para o avanço da
compreensão da evolução. Dentre estes
métodos está a aplicação do neighbor-joining.
Qual é a melhor definição desta técnica?
Uma árvore é estimada com base na
proximidade dos táxons em uma
matriz de dados.
Uma busca em árvore é conduzida
para encontrar a árvore que minimiza
a diferença entre as distâncias
observadas e previstas.
A árvore mais curta é encontrada sob
a suposição de que há uma árvore
mais curta.
Um protocolo para adicionar táxons a
uma árvore construída por parcimônia
ou máxima verossimilhança.
Um algoritmo rápido que encontrará
uma árvore com base em distâncias
entre pares.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 5/17
A
B
Resposta incorreta
Opa! A alternativa correta é a letra
E. Confira o gabarito comentado!
Gabarito Comentado
O método neighbor-joining é um algoritmo
rápido que busca encontrar uma árvore
filogenética com base nas distâncias entre
pares de táxons. Ele utiliza a distância
genética, calculada a partir de uma matriz
táxon/caracter, para construir uma árvore.
A árvore escolhida é aquela que minimiza a
diferença entre as distâncias na matriz e as
previstas pela árvore. Este método realiza
uma série de cálculos na matriz a partir de
um algoritmo, sendo considerado um
método rápido. As outras alternativas não
se enquadram como definições corretas
dessa metodologia.
4 Marcar para revisão
Existem diversas formas de buscarmos a
melhor hipótese filogenética com uma matriz de
táxons × caractere. Dentre as possibilidades,
temos a máxima verossimilhança. Qual das
alternativas a seguir define melhor este
conceito?
A probabilidade de que um evento
ocorra.
A probabilidade de observar um
conjunto de dados, fornecido uma
hipótese.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 6/17
C
D
E
A probabilidade de que uma hipótese
seja falsa através do método dos
mínimos quadrados.
A proporção das probabilidades de
duas hipóteses alternativas.
A melhor árvore calculada a partir da
quantidade de passos, ou mudanças,
nos ramos.
Resposta incorreta
Opa! A alternativa correta é a letra
B. Confira o gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Gabarito: A probabilidade de observar um
conjunto de dados, fornecido uma
hipótese.
Justificativa: A máxima verossimilhança é
um conceito que busca a probabilidade de
observar um conjunto de dados, dada uma
hipótese. Este método é diferente do
teorema de Bayes, que calcula a
probabilidade de um evento ocorrer entre
outros. O método dos mínimos quadrados,
por outro lado, é utilizado em métodos de
distância e não em probabilidades. A
quantidade de passos é um critério
utilizado na parcimônia, e não na máxima
verossimilhança. A inferência Bayesiana é
um método que avalia a probabilidade
posterior de uma árvore e incorpora
informações prévias sobre a probabilidade
de hipóteses alternativas.
Questão 8 de 10
1 2 3 4 5
6 7 8 9 10
Exercicio Análise Filogenética Sair
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/7/17
A
B
C
D
E
5 Marcar para revisão
A árvore filogenética é uma hipótese sobre
relações evolutivas, mas para construir
precisamos usar características que sejam
indicadores confiáveis de ancestralidade
comum. Nesse contexto, utilizamos para a
construção das árvores as características
homólogas. A seguir estão listadas algumas
propriedades das características ditas
homólogas. Analise a alternativa que NÃO se
refere a essa característica:
Linhagens diferentes com traços
similares
Ponto de origem em local similar
Estrutura e composição similar
Desenvolvimento similar
Funções similares
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
O conceito de homologia se refere à
semelhança entre estruturas de diferentes
organismos que apresentam origem,
estrutura, composição, desenvolvimento e
função similares. A alternativa A, que
Corretas �4�
Incorretas �6�
Em branco �0�
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 8/17
A
B
menciona "linhagens diferentes com traços
similares", não se enquadra nessa
definição. Isso porque a homologia é
observada em características específicas,
e não em linhagens inteiras. Portanto, a
presença de traços similares em diferentes
linhagens não é suficiente para classificá-
las como homólogas. A homologia é um
indicador de ancestralidade comum, e não
simplesmente de semelhança entre traços.
6 Marcar para revisão
Observe o caldograma abaixo:
Imagem: Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de
espécies. Analise as alternativas que, segundo
o cladograma, se refere a um grupo polifilético.
O conjunto de espécies N O P
O conjunto de espécies H I
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 9/17
C
D
E
O conjunto de espécies W X Y
O conjunto de espécies A B C D
O conjunto de espécies S T
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Gabarito: O conjunto de espécies H I
Justificativa: O grupo polifilético é um
conjunto de táxons que não inclui o
ancestral comum de todos os seus
membros. Ao analisar as alternativas,
aquela que representa um grupo
prolifilético, é o conjunto de espécies H I
porque possuem origem em linhagens
amplamente desconexas. Os conjuntos de
espécies listados nas outras alternativas
(conjunto de espécies N, O, P; conjunto de
espécies W X Y; conjunto de espécies A B
C D e o conjunto de espécies S T)
apresentam um ancestral comum.
7 Marcar para revisão
Analise a figura a seguir:
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 10/17
A
B
Imagens: Leandro Pederneiras
Analisando as árvores da esquerda e direita é
possível afirmar que:
Possuem topologias idênticas, mas a
árvore da direita possui nós mais
profundos.
São árvores diferentes porque
possuem relações entre grupos
diferentes.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 11/17
C
D
E
São perfeitamente similares, apenas a
forma de apresentação mudou e
alguns ramos giraram em seu próprio
eixo.
Alguns clados foram cortados e
colados em diferentes ramos na
árvore da direita.
O grupo A B C D E é mais próximo
relacionado ao grupo I J K L M na
árvore da esquerda do que na da
direita.
Resposta incorreta
Opa! A alternativa correta é a letra
C. Confira o gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Resposta correta:  São perfeitamente
similares, apenas a forma de apresentação
mudou e alguns ramos giraram em seu
próprio eixo.
As duas imagens correspondem a um
cladograma, nesse tipo de árvore não é
possível saber a profundidade exata dos
nós porque não possui uma escala de
tempo. As duas árvores são idênticas em
seus relacionamentos (topologia), apenas
com ramos torcidos em seus próprios
eixos, pela alteração da forma (retangular e
diagonal, respectivamente). Os grupos A B
C D E e I J K L M estão na mesma posição
nas árvores, apenas com ramos torcidos,
sendo assim não mudam a relação de
proximidade. Não houve corte nas árvores
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 12/17
A
B
C
D
E
que justificaria a mudança de topografia
entre as árvores.
8 Marcar para revisão
Para compreender o que diz uma árvore
filogenética, diversas terminologias e conceitos
são empregados. A seguir, são listados
diferentes conceitos sobre a filogenia. Assinale
a alternativa que retrata de forma correta um
conceito das árvores filogenéticas:
Terminal, num cladograma, significa
um ramo com dois nós (duas
divergências) nas extremidades.
O ponto no qual o gráfico se inicia é
denominado clado inferior, onde está a
raiz da árvore.
Quando queremos apontar um táxon
duplicado dentro da árvore
filogenética, dizemos que existe um
grupo irmão.
Podemos rodar os ramos em seu
próprio eixo sem alterar as relações de
parentesco, mas se cortarmos e
colarmos um ramo em outra parte,
dizemos que a topologia mudou.
Topologia significa o táxon terminal,
aqueles nomes que estão inseridos no
topo da árvore filogenética.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 13/17
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
A alternativa correta é a letra D. A
explicação para isso é que, em uma árvore
filogenética, é possível rodar os ramos em
seu próprio eixo sem alterar as relações de
parentesco. Isso ocorre porque a posição
dos ramos não afeta a relação de
parentesco entre os táxons. No entanto, se
um ramo for cortado e colado em outra
parte da árvore, a topologia, ou seja, o
conjunto de relações entre clados e ramos,
muda. Isso porque a nova posição do ramo
pode indicar uma relação de parentesco
diferente da original. Portanto, a afirmação
de que a topologia muda quando um ramo
é cortado e colado em outra parte é
correta.
9 Marcar para revisão
O quadro a seguir mostra uma matriz de dados
táxons x caracteres, sendo apresentados 9
espécies (de A ao I) e 9 caracteres (de 1 ao 9��
Como uma análise de parcimônia seria afetada
pela remoção das duas primeiras posições �1 e
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 14/17
A
B
C
D
E
2) e da última posição �9) da matriz de dados
fornecida?
A topologia de árvore ideal
definitivamente não mudará; a árvore
ótima terá três etapas a mais.
A topologia de árvore ideal
definitivamente não mudará, e nem
seu comprimento.
A topologia de árvore ideal
definitivamente não mudará; a árvore
ótima será três etapas mais curta.
A topologia de árvore ideal pode ou
não mudar; o comprimento ideal da
árvore pode ser maior ou menor.
A topologia de árvore ideal certamente
mudará; a árvore ótima será menor.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Gabarito: A topologia de árvore ideal
definitivamente não mudará, e nem seu
comprimento.
Justificativa: Os caracteres que estão na
posição 1, 2 e 9 na matriz de dados não
possui variação de estados, ou seja, ao
analisar a matriz de dados vemos que em
todas as espécies (de A a I) naposição 1
temos a base C, na posição 2 a base G e
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 15/17
A
B
na posição 9 a base C. Isso significa que
elas não trazem informações que possam
diferenciar um táxon ou um conjunto de
táxons. Assim, a retirada destes caracteres,
por tanto, não modifica a topologia e o
comprimento de ramos, pois não houve
alteração. A modificação na topografia só
seria obtida caso tivesse alteração nos
carateres entre os táxons, assim todas as
outras alternativas estão falsas.
10 Marcar para revisão
Observe o cladograma abaixo:
Imagem Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de
espécies. Analise as alternativas que, segundo
o cladograma, se refere a um grupo parafilético.
O conjunto de espécies G H I.
O conjunto de espécies P Q R.
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 16/17
C
D
E
O conjunto de espécies U V H.
O conjunto de espécies A F.
O conjunto de espécies J K L M.
Resposta incorreta
Opa! A alternativa correta é a letra
E. Confira o gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Gabarito: O conjunto de espécies J K L M.
Justificativa: Grupos parafiléticos são
aqueles que faltam poucos descendentes,
menos da metade, para se transformar em
monofilético. Assim, na imagem da árvore
filogenética, o grupo parafilético é o
conjunto de espécies J K L M porque para
ser monofilético só falta uma espécie I. O
conjunto de espécies G, H, I; A e F; P, Q, R;
U, V e H, precisariam incluir muito mais
grupos para ser um grupo monofilético,
pois alguns espécies do conjunto não
apresentam um ancestral comum próximo,
como é o exemplo do conjunto de espécies
J K L M. Lembre-se que para descobrir o
ancestral comum de dois táxons basta
caminhar sempre para trás da filogenia
iniciando do terminal (onde está o nome da
espécie).
06/11/24, 11:11 estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/
https://estacio.saladeavaliacoes.com.br/exercicio/672b6b423092410d6bb73e6e/gabarito/ 17/17