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Replicação do DNA Profa. Dra. Aline Maria da Silva Instituto de Química- USP Bibliografia: Genes VII - Benjamin Lewin Biologia Molecular Básica-Arnaldo Zaha Lenhinger Principles of Biochemistry (3a. Ed.) Replicação Transcrição Tradução Proteína Ácido Desoxirribonucleico Ácido Ribonucleico Replicação do DNA O mecanismo de replicação está baseado no pareamento das bases da dupla hélice do DNA. A estrutura do DNA contém a informação necessária para perpetuar sua sequência de bases A replicação do DNA é semi-conservativa Experimento realizado por Meselson & Stahl em 1958 Cultivo em meio 14NH4Cl Cultivo em meio 15NH4Cl Purificação do DNA seguida de centrifugação em gradiente de CsCl A replicação é bidirecional A replicação do cromossomo circular Replicon: Unidade do DNA onde está ocorrendo um evento de replicação Replicon: 1. Origem + Término 2. Ativados apenas uma única vez em cada ciclo celular 3. O genoma de uma célula procariótica constitue um único replicon 4. Cada cromossomo eucariótico constitue vários replicons e todos são ativados uma única vez no ciclo celular ainda que não simultaneamente A replicação é vista como um “olho” flanqueado por DNA não replicado O genoma bacteriano circular constitue um único replicon A velocidade da forquillha de replicação bacteriana é 50000pb/min Um única origem de replicação em E.coli (OriC, 245 pb) Origem de Replicação em bactérias: Somente origens completamente metiladas podem iniciar a replicação O genoma eucariótico constitue vários replicons A velocidade da forquillha de replicação eucariótica é 2000pb/min Os replicons eucarióticos tem 40-100 kb e são iniciados em tempos diferentes Fase S demora ~ 6hrs em uma célula somática Forquilha de replicação: Região do DNA onde ocorre a transição do DNA parental fita dupla para as novas fitas filhas duplas Fita contínua (líder) Fita descontínua Polimerases de DNA: As enzimas que sintetizam DNA A síntese de DNA ocorre pela adição de nucleotídeos a extremidade 3´OH da cadeia em crescimento. O precursor da síntese é o desoxiribonucleosídeo 5´trifosfato Sentido da síntese sempre é 5’ → 3’ A replicação é um processo extremamente fiel. As DNA- polimerases tem atividade revisora Desoxiribonucleosídeo 5´trifosfato (precursor) Fita sendo polimerizada Fita molde Desoxyribose As DNA-polimerases sempre requerem um iniciador previamente pareado ao molde que será copiado Pareamento de bases incorreto correto Atividade revisora de exonuclease 3’ → 5’ garante a fidelidade da replicação Modelo da estrutura das DNA-polimerases Propriedades das DNA-polimerases Bacterianas Pol I PolII PolIII Polimerização 5’ → 3’ + + + Exonuclease 3’ → 5’ + + + Exonuclease 5’ → 3’ + - - Número de subunidades 1 ≥4 ≥10 Tamanho em kDa 103 90 ~900 Velocidade de Polimerização(nt/seg) 16-20 40 250-1000 Processividade 3-200 1500 ≥500000 (nt adicionados antes da dissociação do molde) DNA-polimerase III é uma holoenzima de mais de 10 cadeias de estrutura dimérica A subunidade Beta da DNA- polimerase III envolve o duplex das fitas-filhas OriC do cromossomo de E.coli Proteínas presentes na origem de Replicação de E.coli Metila as sequências GATC na OriCDam Metilase Alivia a tensão torsional gerada pela abertura da dupla-fita DNA girase Facilita a ação da DnaARNA polimerase Liga a fita simples de DNASingle strand binding (SSB) Sintetiza os primers de RNAPrimase (DnaG) Proteína do tipo histona que estimula a iniciação HU Auxilia a ligação de DnaB na origemDnaC Desenrola o DNADnaB (helicase) Reconhece a origem e abre a dupla fita em sítios específicos DnaA A síntese do DNA é semi-descontínua e requer um iniciador (primer) de RNA Fita contínua Fita descontínua Síntese da Fita descontínua Síntese da Fita Contínua Fragmentos de Okasaki ocorrem na fita descontínua A DNA polimerase III é responsável pela síntese da maior parte do DNA A DNA polimerase I remove o primer de RNA e preenche as lacunas A DNA ligase sela as quebras A DNA ligase sela as quebras Mecanismo de ação da DNA ligase Proteínas presentes na forquilha de Replicação de E.coli SuperenrolamentoDNA girase Liga os fragmentosDNA Ligase Preenche as lacunas e excisa os primersDNA Polimerase I Sintese da fita novaDNA Polimerase III Sintetiza os primers de RNAPrimase (DnaG) Desenrola o DNADnaB (helicase) Liga a fita simples de DNASSB Síntese das fitas contínua e descontínua é independente O complexo de replicação A proteína DNA B (helicase) é responsável pelo movimento para frente da forquilha Cada core catalítico da DNA PolIII sintetiza uma das fitas-filhas O primossomo afasta uma das fitas molde Proteínas SSB mantem as fitas parentais separadas Forquilha sentido horário Forquilha sentido antihorário Terminação Terminação Forquilha sentido horário Forquilha sentido antihorário Terminação Terminação Duplicação dos cromossomos Separação dos cromossomos e divisão celular