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BIOINFORMÁTICA - QUESTÕES CORRIGIDAS

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Ana Carolina

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Ferramentas de estudo

Questões resolvidas

Diante do assunto abordado na unidade 2, a montagem de genomas pode acontecer de duas formas básicas de acordo com suporte computacional utilizado e com a questão norteadora da pesquisa. São elas:
a. Montagem par-a-par e Montagem múltipla.
b. Montagem múltipla e Montagem por referência.
c. Montagem par-a-par e Montagem por referência.
d. Montagem de novo e Montagem múltipla.
e. Montagem por referência e Montagem de novo.

Ainda sobre a montagem de genomas, vista na unidade 2, assinale a alternativa que melhor define a etapa de processamento chamada de Conting.
a. É dita como a informação mais próxima do genoma alvo.
b. É formada por meio da junção ordenadas de contigs.
c. Corresponde a sequência curta de nucleotídeos que é gerada pelo sequenciamento em si.
d. Correspondem as informações maiores, formados por um agrupamento de reads.
e. É o genoma na forma inicial.

De acordo com o assunto “Montagem de genomas”, abordado na unidade 2, assinale a alternativa que, numa visão geral, apresenta respectivamente a sequência do processo de montagem de um genoma.
a. Organização dos fragmentos / Fragmentação do material / Sequência final / Genoma.
b. Genoma / Fragmentação do material / Organização dos fragmentos / Sequência final.
c. Sequência final / Fragmentação do material / Organização dos fragmentos / Genoma.
d. Fragmentação do material / Organização dos fragmentos / Genoma / Sequência final.
e. Genoma / Organização dos fragmentos / Sequência final / Fragmentação do material.

Ainda sobre a montagem de genomas, vista na unidade 2, assinale a alternativa que melhor define a etapa de processamento chamada de Scaffold.
a. Sequência que é lida a cada rodada de experimento.
b. Formados por um agrupamento de reads.
c. É dita como a informação mais próxima do genoma alvo e é formada por meio da junção ordenadas de contigs.
d. Corresponde a sequência curta de nucleotídeos que é gerada pelo sequenciamento em si.
e. É a primeira etapa da montagem de genoma.

A partir do assunto estudado em “Alinhamento de sequências”, abordado na unidade 1, defina qual o nome do processo que corresponde à base da pesquisa de semelhança em banco de dados e que visa o alinhamento de duas sequências.
a. Alinhamento múltiplo.
b. Alinhamento par-a-par.
c. Alinhamento coletivo.
d. Alinhamento discreto.
e. Alinhamento único.

Sobre “Alinhamento de sequências”, estudado na unidade 1, marque a alternativa que melhor define o alinhamento exaustivo.
a. São aqueles que não realizam o alinhamento ótimo entre sequências.
b. São aqueles que nos dão como resultado o melhor alinhamento possível de acordo com a metodologia algorítmica de comparação de sequências.
c. Processo de alinhar duas sequências e, corresponde, a base da pesquisa de semelhança em banco de dados.
d. Corresponde ao processo de alinhamento que envolve mais de duas sequências ou estruturas.
e. São aqueles que nunca apresentam resultado.

De acordo com o assunto “Plataformas de sequenciamento” estudado na unidade 1, marque a alternativa INCORRETA sobre o sequenciamento de Sanger.
a. Sanger descobriu que se conseguisse interromper a replicação de um mesmo DNA em pontos diferentes ele poderia juntar essas fitas menores e formar a sequência completa do DNA.
b. O método consiste em adicionar didesoxiribonucleotídeos (ddNTP’s) no carbono 3’ da pentose.
c. Existem infinitos tipos de ddNTP’s.
d. Quando os ddNTP’s tentam se ligar com a fita de DNA, com a ausência do OH, o próximo nucleotídeo não tem onde se ligar e a replicação para.
e. Também é conhecido como primeira geração.

A partir do assunto “Alinhamento de sequências”, estudado na unidade 1, assinale a alternativa que melhor define o alinhamento de várias sequências.
a. Processo de alinhar duas sequências e, corresponde, a base da pesquisa de semelhança em banco de dados.
b. São aqueles que não realizam o alinhamento ótimo entre sequências.
c. Corresponde ao processo de alinhamento que envolve mais de duas sequências ou estruturas.
d. São aqueles que nos dão como resultado o melhor alinhamento possível de acordo com a metodologia algorítmica de comparação de sequências.
e. É a forma de alinhamento mais primitiva que se desenvolveu.

Diante do assunto “Plataforma de sequenciamento”, estudado na unidade 1, como é conhecido o sequenciamento de Sanger?
a. Nova geração (NGS).
b. Primeira geração.
c. Segunda geração.
d. Terceira geração.
e. Quarta geração.

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Questões resolvidas

Diante do assunto abordado na unidade 2, a montagem de genomas pode acontecer de duas formas básicas de acordo com suporte computacional utilizado e com a questão norteadora da pesquisa. São elas:
a. Montagem par-a-par e Montagem múltipla.
b. Montagem múltipla e Montagem por referência.
c. Montagem par-a-par e Montagem por referência.
d. Montagem de novo e Montagem múltipla.
e. Montagem por referência e Montagem de novo.

Ainda sobre a montagem de genomas, vista na unidade 2, assinale a alternativa que melhor define a etapa de processamento chamada de Conting.
a. É dita como a informação mais próxima do genoma alvo.
b. É formada por meio da junção ordenadas de contigs.
c. Corresponde a sequência curta de nucleotídeos que é gerada pelo sequenciamento em si.
d. Correspondem as informações maiores, formados por um agrupamento de reads.
e. É o genoma na forma inicial.

De acordo com o assunto “Montagem de genomas”, abordado na unidade 2, assinale a alternativa que, numa visão geral, apresenta respectivamente a sequência do processo de montagem de um genoma.
a. Organização dos fragmentos / Fragmentação do material / Sequência final / Genoma.
b. Genoma / Fragmentação do material / Organização dos fragmentos / Sequência final.
c. Sequência final / Fragmentação do material / Organização dos fragmentos / Genoma.
d. Fragmentação do material / Organização dos fragmentos / Genoma / Sequência final.
e. Genoma / Organização dos fragmentos / Sequência final / Fragmentação do material.

Ainda sobre a montagem de genomas, vista na unidade 2, assinale a alternativa que melhor define a etapa de processamento chamada de Scaffold.
a. Sequência que é lida a cada rodada de experimento.
b. Formados por um agrupamento de reads.
c. É dita como a informação mais próxima do genoma alvo e é formada por meio da junção ordenadas de contigs.
d. Corresponde a sequência curta de nucleotídeos que é gerada pelo sequenciamento em si.
e. É a primeira etapa da montagem de genoma.

A partir do assunto estudado em “Alinhamento de sequências”, abordado na unidade 1, defina qual o nome do processo que corresponde à base da pesquisa de semelhança em banco de dados e que visa o alinhamento de duas sequências.
a. Alinhamento múltiplo.
b. Alinhamento par-a-par.
c. Alinhamento coletivo.
d. Alinhamento discreto.
e. Alinhamento único.

Sobre “Alinhamento de sequências”, estudado na unidade 1, marque a alternativa que melhor define o alinhamento exaustivo.
a. São aqueles que não realizam o alinhamento ótimo entre sequências.
b. São aqueles que nos dão como resultado o melhor alinhamento possível de acordo com a metodologia algorítmica de comparação de sequências.
c. Processo de alinhar duas sequências e, corresponde, a base da pesquisa de semelhança em banco de dados.
d. Corresponde ao processo de alinhamento que envolve mais de duas sequências ou estruturas.
e. São aqueles que nunca apresentam resultado.

De acordo com o assunto “Plataformas de sequenciamento” estudado na unidade 1, marque a alternativa INCORRETA sobre o sequenciamento de Sanger.
a. Sanger descobriu que se conseguisse interromper a replicação de um mesmo DNA em pontos diferentes ele poderia juntar essas fitas menores e formar a sequência completa do DNA.
b. O método consiste em adicionar didesoxiribonucleotídeos (ddNTP’s) no carbono 3’ da pentose.
c. Existem infinitos tipos de ddNTP’s.
d. Quando os ddNTP’s tentam se ligar com a fita de DNA, com a ausência do OH, o próximo nucleotídeo não tem onde se ligar e a replicação para.
e. Também é conhecido como primeira geração.

A partir do assunto “Alinhamento de sequências”, estudado na unidade 1, assinale a alternativa que melhor define o alinhamento de várias sequências.
a. Processo de alinhar duas sequências e, corresponde, a base da pesquisa de semelhança em banco de dados.
b. São aqueles que não realizam o alinhamento ótimo entre sequências.
c. Corresponde ao processo de alinhamento que envolve mais de duas sequências ou estruturas.
d. São aqueles que nos dão como resultado o melhor alinhamento possível de acordo com a metodologia algorítmica de comparação de sequências.
e. É a forma de alinhamento mais primitiva que se desenvolveu.

Diante do assunto “Plataforma de sequenciamento”, estudado na unidade 1, como é conhecido o sequenciamento de Sanger?
a. Nova geração (NGS).
b. Primeira geração.
c. Segunda geração.
d. Terceira geração.
e. Quarta geração.

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