Aula 6 - Desenho de Primers

Prévia do material em texto

Tecnologia Genética
Desenho de Primers
INSTRUTOR: Nathália Delvaux
nathalia.ramos@ibmr.br
CONCEITOS GERAIS
● O Primer delimita a parte do DNA que será amplificada na PCR.
● Principais determinantes da especificidade nas técnicas genéticas (PCR).
● O desenho de primer é necessário para identificar onde desse DNA está o patógeno
específico.
● Amplicons: Produto da PCR (Região que foi amplificada pela PCR).
● Temperatura de Anelamento (Ta): Temperatura em que ocorre o pareamento
entre primer e template (pode ter variação de 3 a 5°C).
● Conteúdo GC: Quantidade de bases G ou C no primer. As bases nitrogenadas G e C
possuem tripla ligação de Hidrogênio.(↑Conteúdo GC ↑Temperatura de anelamento)
● Hairpin: Tipo de estrutura secundária possível realizada entre polímeros de
nucleotídeos. Ocorre quando um primer se anela a ele mesmo, acontece com todos
os primers, em quantidades diferentes. (Dificulta/impede o anelamento)
(Quantidade de hairpins que um primer forma é um critério na sua escolha, quanto
menos hairpins melhor)
● Dímeros: Produto de PCR gerado através da ligação entre dois primers iguais
(homodímero) ou entre dois primers diferentes (heterodímero).
1