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Biologia Evolucionária

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A técnica SPR corta um ramo e cola em outra parte da própria árvore criando árvore por rearranjo.
O que a técnica SPR faz na construção de árvores filogenéticas?

Aprimorando com Questões

há 4 meses

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há 4 meses

73 pág.

Respostas

há 4 meses

A técnica SPR (Subtree Pruning and Regrafting) é utilizada na construção de árvores filogenéticas para otimizar a topologia da árvore. Ela funciona cortando um ramo (subárvore) da árvore e colando-o em outra parte, permitindo explorar diferentes arranjos e melhorar a adequação da árvore aos dados. Isso ajuda a encontrar uma representação mais precisa das relações evolutivas entre as espécies analisadas.

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Análise filogenética

ESTÁCIO EAD

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A análise filogenética é uma representação gráfica que demostra as relações evolutivas entre organismos. A partir da filogenia, ou seja, do estudo da relação evolutiva entre as espécies, podemos compreender melhor a vida, seu comportamento ao longo do tempo, e prever as forças que podem ou não modificar a história.
O que é uma árvore filogenética?

A árvore filogenética também nos auxilia a compreender se uma característica é homóloga ou análoga.
Qual é a diferença entre características homólogas e análogas?

O termo árvore filogenética é usado para se referir às histórias evolutivas ramificadas, isto é, a história de um ancestral e todos os seus descendentes ao longo do tempo representadas por ramos e troncos.
Por que é importante inferir uma árvore da história evolutiva?

A construção da árvore filogenética possui diversas funcionalidades, desde as mais científicas e amplas, como a classificação dos seres vivos ou a evolução de determinada característica, como os frutos.
Quais são algumas das aplicações da análise filogenética?

A ancestralidade é a conexão entre um ancestral e seus descendentes.
O que representa a ancestralidade em uma árvore filogenética?

Compreender o passado para construir uma árvore filogenética, não tendo vivido nele e sem um livro contando a história detalhada, é uma tarefa complexa; mas já existem metodologias confiáveis que nos permitem fazer inferências com credibilidade.
Quais são as fontes de informação para a construção de uma árvore filogenética?

Uma árvore filogenética, ou cladograma, é um gráfico com linhas retas denominadas ramos — linhagens em evolução —, conectadas por nós — divisão das linhagens.
Quais são as propriedades fundamentais de uma árvore filogenética?

Para apontar determinado pedaço do gráfico filogenético nos estudos de filogenética, usamos o termo clado, que significa “um ancestral e todos os seus descendentes”.
O que é um clado em uma árvore filogenética?

TUALMENTE, UMA ÁRVORE FILOGENÉTICA, OU CLADOGRAMA, REPRESENTA A HISTÓRIA EVOLUTIVA DE UM CONJUNTO DE TERMINAIS CONECTADOS POR SUAS ANCESTRALIDADES.
SOBRE AS ÁRVORES FILOGENÉTICAS, ANALISE AS AFIRMATIVAS A SEGUIR E ASSINALE A ALTERNATIVA CORRETA:
A) Uma linhagem evolutiva é dita como a completa história genealógica de uma única população.
B) Linhagem populacional é constituída por um conjunto de linhagens populacionais de uma mesma espécie durante um longo intervalo de tempo.
C) Uma barreira geográfica formadora de cladogênese significa uma população que se torna reprodutível num tempo diferente das demais, impossibilitando a troca genética.
D) Quando duas populações se isolam por um longo tempo, não permitindo mais a troca genética entre as populações, mesmo quando se conectam geograficamente, dizemos que houve um evento extrínseco de divergência.
E) Quando duas populações se isolam por diferença temporal, mas sem o isolamento geográfico, dizemos que houve uma divergência simpátrica.

VIMOS QUE, COM O AVANÇO DA FILOGENIA, MUITOS TÁXONS JÁ ERAM COMPLETOS, ISTO É, COMPOSTOS POR TODOS OS DESCENDENTES DE UM ANCESTRAL COMUM, MAS TAMBÉM SE VERIFICOU QUE ALGUNS GRUPOS NÃO CONTINHAM TODOS OS DESCENDENTES EXISTENTES. ASSIM, FOI ADOTADA A TERMINOLOGIA PARA GRUPO MONIFILÉTICO, PARAFILÉTICO E POLIFILÉTICO.
OS GRUPOS MONOFILÉTICOS SÃO AQUELES QUE APRESENTAM:
A) Um conjunto de táxons que contêm um único ancestral comum e todos os seus descendentes conhecidos.
B) Um conjunto de táxons que contêm um único ancestral comum e quase todos os descendentes.
C) Um conjunto de táxons que não inclui o ancestral comum de todos os seus membros.
D) Um conjunto de táxons que não têm um ancestral comum, mas tem todos seus descendentes conhecidos.
E) Vários ancestrais comuns para cada conjunto de táxon.

A matriz W diz que o caractere 1 possui a condição 0 no táxon X e 1 nos demais táxons (ABC), logo, esta mudança foi compartilhada por todos os três táxons de uma só vez.
Qual é a condição do caractere 1 no táxon X?

O caractere 2 somente teve transformação nos táxons B e C (do estado 0 para 1), por isso temos uma seta indicando essa mudança na parte comum dos dois táxons, pois será herdada para todos seus descendentes.
Em quais táxons ocorreu a transformação do caractere 2?

Portanto, pelo critério da parcimônia, a árvore A seria a escolhida como a hipótese mais provável.
Qual árvore é escolhida como a hipótese mais provável pelo critério da parcimônia?

Um caractere é parcimoniosamente não informativo quando é exclusivo de um terminal, o que denominamos como autapomorfia.
O que é um caractere parcimoniosamente não informativo?

Podemos chamar de caracteres parcimoniosamente informativos aqueles que são compartilhados entre subconjuntos de terminais.
O que caracteriza um caractere parcimoniosamente informativo?

Uma das maiores dificuldades da construção de uma árvore filogenética é a quantidade de hipóteses que podem existir.
Qual é uma das maiores dificuldades na construção de uma árvore filogenética?

Uma sequência de DNA usada na filogenia pode ser um gene, um espaço entre genes ou sítios repetitivos do DNA.
O que pode ser considerado uma sequência de DNA na filogenia?

Para conseguir encontrar a homologia, posicionamos uma sequência em cima da outra em busca de um conjunto de nucleotídeos idênticos entre todas as espécies.
Como encontramos a homologia entre sequências de DNA?

Um modelo de evolução é um modelo de substituição que estabelece os limites e caminhos que os estados de caracteres podem seguir.
O que é um modelo de evolução?

Biologia Evolucionária

Análise filogenética

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Análise filogenética

A árvore filogenética também nos auxilia a compreender se uma característica é homóloga ou análoga.Qual é a diferença entre características homólogas e análogas?

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A construção da árvore filogenética possui diversas funcionalidades, desde as mais científicas e amplas, como a classificação dos seres vivos ou a evolução de determinada característica, como os frutos.Quais são algumas das aplicações da análise filogenética?

A ancestralidade é a conexão entre um ancestral e seus descendentes.O que representa a ancestralidade em uma árvore filogenética?

Uma árvore filogenética, ou cladograma, é um gráfico com linhas retas denominadas ramos — linhagens em evolução —, conectadas por nós — divisão das linhagens.Quais são as propriedades fundamentais de uma árvore filogenética?

Para apontar determinado pedaço do gráfico filogenético nos estudos de filogenética, usamos o termo clado, que significa “um ancestral e todos os seus descendentes”.O que é um clado em uma árvore filogenética?

A matriz W diz que o caractere 1 possui a condição 0 no táxon X e 1 nos demais táxons (ABC), logo, esta mudança foi compartilhada por todos os três táxons de uma só vez.Qual é a condição do caractere 1 no táxon X?

O caractere 2 somente teve transformação nos táxons B e C (do estado 0 para 1), por isso temos uma seta indicando essa mudança na parte comum dos dois táxons, pois será herdada para todos seus descendentes.Em quais táxons ocorreu a transformação do caractere 2?

Portanto, pelo critério da parcimônia, a árvore A seria a escolhida como a hipótese mais provável.Qual árvore é escolhida como a hipótese mais provável pelo critério da parcimônia?

Um caractere é parcimoniosamente não informativo quando é exclusivo de um terminal, o que denominamos como autapomorfia.O que é um caractere parcimoniosamente não informativo?

Podemos chamar de caracteres parcimoniosamente informativos aqueles que são compartilhados entre subconjuntos de terminais.O que caracteriza um caractere parcimoniosamente informativo?

Uma das maiores dificuldades da construção de uma árvore filogenética é a quantidade de hipóteses que podem existir.Qual é uma das maiores dificuldades na construção de uma árvore filogenética?

Uma sequência de DNA usada na filogenia pode ser um gene, um espaço entre genes ou sítios repetitivos do DNA.O que pode ser considerado uma sequência de DNA na filogenia?

Para conseguir encontrar a homologia, posicionamos uma sequência em cima da outra em busca de um conjunto de nucleotídeos idênticos entre todas as espécies.Como encontramos a homologia entre sequências de DNA?

Um modelo de evolução é um modelo de substituição que estabelece os limites e caminhos que os estados de caracteres podem seguir.O que é um modelo de evolução?

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Quais são algumas das aplicações da análise filogenética?

A ancestralidade é a conexão entre um ancestral e seus descendentes.
O que representa a ancestralidade em uma árvore filogenética?

Uma árvore filogenética, ou cladograma, é um gráfico com linhas retas denominadas ramos — linhagens em evolução —, conectadas por nós — divisão das linhagens.
Quais são as propriedades fundamentais de uma árvore filogenética?

Para apontar determinado pedaço do gráfico filogenético nos estudos de filogenética, usamos o termo clado, que significa “um ancestral e todos os seus descendentes”.
O que é um clado em uma árvore filogenética?

A matriz W diz que o caractere 1 possui a condição 0 no táxon X e 1 nos demais táxons (ABC), logo, esta mudança foi compartilhada por todos os três táxons de uma só vez.
Qual é a condição do caractere 1 no táxon X?

O caractere 2 somente teve transformação nos táxons B e C (do estado 0 para 1), por isso temos uma seta indicando essa mudança na parte comum dos dois táxons, pois será herdada para todos seus descendentes.
Em quais táxons ocorreu a transformação do caractere 2?

Portanto, pelo critério da parcimônia, a árvore A seria a escolhida como a hipótese mais provável.
Qual árvore é escolhida como a hipótese mais provável pelo critério da parcimônia?

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Podemos chamar de caracteres parcimoniosamente informativos aqueles que são compartilhados entre subconjuntos de terminais.
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Uma sequência de DNA usada na filogenia pode ser um gene, um espaço entre genes ou sítios repetitivos do DNA.
O que pode ser considerado uma sequência de DNA na filogenia?

Para conseguir encontrar a homologia, posicionamos uma sequência em cima da outra em busca de um conjunto de nucleotídeos idênticos entre todas as espécies.
Como encontramos a homologia entre sequências de DNA?

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