A implementação da gestão por processos em uma organização contempla a identificação, a gestão, monitoramento e a melhoria dos processos, entendido processo como um conjunto de atividades inter-relacionadas que transforma insumos (entradas) em produtos. Entre as ferramentas que fazem parte dessa metodologia, pode-se citar: fluxograma, utilizado no mapeamento dos processos da organização. O mapa estratégico, que aponta a cadeia de valor gerada pelo conjunto de processos da organização. Diagrama de Pareto, que identifica os pontos críticos de cada processo. A matriz SWOT, que identifica os desafios e as oportunidades da organização. Benchmarking, que identifica fatores-chave para o sucesso dos processos estratégicos.
A fase de criação de modelos de processos de novos ou modificados dentro do contexto dos objetivos de negócio, utilizando notações, fluxos de atividades, regras de negócio, plataformas tecnológicas, recursos de dados, controles operacionais e integração com outros processos internos e externos chama-se:
Desenho do processo.
Controle do processo.
Gerenciamento de desempenho.
Implementação do processo.