É importante perceber que o procedimento empírico, base do senso comum, também está presente na ciência, mas de outra forma. A diferença é que:
a) na ciência, assim como no senso comum, o procedimento empírico é a base da produção do conhecimento. A diferença é que o senso comum opera observações formais e rigorosas, e o conhecimento científico é obtido por julgamentos de valor amparados em interpretações usuais da sociedade.
b) no senso comum, o procedimento empírico tem base nas observações cotidianas e em opiniões pessoais; já no conhecimento científico, tais procedimentos se fundamentam no saber popular, nas tradições, nos costumes e nas interpretações populares dos fenômenos e da realidade social.
c) tanto o conhecimento científico quanto o senso comum leva em conta protocolos rígidos de observação, levantamento de hipóteses, sequências de experimentos e análise de resultados. A diferença é que o conhecimento científico opera por meio do senso crítico.
d) na produção do conhecimento científico, as conclusões não são elaboradas apenas pela observação informal e pelas interações cotidianas como no senso comum, nele há protocolos de observação e é preciso testar hipóteses, por meio de experimentos, antes de qualquer conclusão ou generalização.
e) na produção do conhecimento científico, as conclusões são elaboradas exclusivamente por meio da observação informal e considerando as crenças e tradições, sendo que todas as conclusões e generalizações dependem da opinião dominante no contexto em que são produzidas.