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UFAM / ICB / Departamento de Genética Curso: Medicina – Disciplina: Genética Estudo Dirigido Prof. Diego Sotero 1. Em Escherichia coli a DNA-polimerase I possui atividades de exonuclease 5’e 3’ enquanto a DNA-polimerase III possui atividade exonuclease 3’e 5’. Explique a funcionalidade por trás das diferenças em atividade exonuclease associada a essas duas polimerases. 2. Construa um mapa de conceitos relacionando os seguintes termos: DNA / polimerase do RNA / holoenzima / fator sigma / transcrição do DNA / promotor/ sequência terminalizadora / transcrito 3. Enumere as seguintes enzimas na ordem direta em que começam a funcionar na replicação e conceitue cada uma delas: Ligase - DNA polimerase - primase - helicase - exonuclease 4. Os esquemas I e II abaixo mostram as etapas da expressão gênica em dois organismos distintos, um procarioto e um eucarioto. a) Indique, com justificativa, qual esquema se refere ao eucarioto. Em qual ou quais compartimentos celulares ocorrem as etapas indicadas por 1 e 2 no esquema I, e as etapas 3 e 5 do esquema II? b) A remoção diferencial de íntrons do RNA mensageiro pode resultar na produção de diferentes peptídeos. Qual das etapas indicadas nos esquemas corresponde ao processo de Aluno: Matrícula: remoção de íntrons? Explique por que a remoção diferencial de íntrons pode acarretar na produção de diferentes peptídeos. 5. Observe a figura abaixo: Fonte: SNUSTAD, P., SIMMONS, M.J. Fundamentos de Genética (6ª Edição). Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2013. Com base nela responda: por que os hormônios esteroides interagem com receptores dentro da célula, enquanto hormônios peptı́dicos interagem com receptores na superfı́cie celular? Qual o impacto destes mecanismos no controle da expressão de genes em eucariotos? 6. Defina mutação, seus principais tipos existentes e aponte dois distúrbios metabólicos onde a mutação tem papel fundamental. Justifique sua resposta. 7. A Síndrome do X frágil é a segunda forma mais comum de retardo mental hereditário em seres humanos. As pessoas com síndrome do X frágil apresentam comprometimento mental acentuado; também podem apresentar anormalidades faciais e de comportamento. A análise molecular mostrou que esse cromossomo contém uma repetição trinucleotídica instável, (CGG)n, no sítio frágil. Essa repetição está localizada na região 59 não traduzida de um gene designado FMR-1, do inglês fragile X mental retardation gene 1 (gene do retardo mental do X frágil 1). O produto proteico desse gene, designado FMRP, é uma proteína de ligação do RNA, e a ausência da mesma parece ser a causa das deficiências mentais observadas. A transcrição do gene FMR-1 é desativada em pacientes com X frágil, genes FMR-1 normais – ou seja, expressos – contêm de 6 a 59 cópias dessa repetição. Já os genes FMR-1 anormais – ou seja, não expressos – encontrados em pessoas com a síndrome do X frágil contêm de 200 a 1.500 cópias. O que determina o aumento do número de cópias das repetições trinucleotídicas nos cromossomos de 6 a 59 para 200 a 1.500? Para realizar os exercícios abaixo utilize a tabela do código genético. 8. Ek dada a sequência nucleotı́dica hipotética de um mRNA a partir de um “gene selvagem”. Para os mutantes 1 e 2, decorrentes de mutações pontuais (em um único nucleotídico), escreva a sequência de aminoácidos esperada. Gene Selvagem 5’-AUG AAA UAC UUU GUU CAU-3’ Met Lys Tyr Phe Val His Gene Mutante 1 Mutação de troca de sentido: 5’-AUG AUA UAC UUU GUU CAU-3’ _______________________ Gene Mutante 2 Mutação sem sentido: 5’-AUG UAA UAC UUU GUU CAU-3’ _______________________ 9. Ek dada a sequência nucleotı́dica hipotética de um mRNA a partir de um “gene selvagem”. Para os mutantes 3, 4 e 5, decorrentes de mutações por mudança de fase de leitura (inserção ou deleção de bases), escreva a sequência de aminoácidos esperada. Gene Selvagem 5’-AUG AAA UAC UUU GUU CAU-3’ Met Lys Tyr Phe Val His Gene Mutante 3 Inserção ou deleção de uma base: 5’-AUG CAA AUA CUU UGU UCA U-3’ _________________________ Gene Mutante 4 Inserção ou deleção de duas bases: 5’-AUG UCA AAU ACU UUG UUC AU-3’ __________________________ Gene Mutante 5 Inserção ou deleção de três bases: 5’-AUG UCA AAA UAC UUU GUU CAU-3’ ___________________________ 10. De acordo com o que foi visto em aula sobre a síntese protéica responda: a) Qual é a relação entre o RNA mensageiro e a formação de polissomos? b) Qual é a diferença entre o rRNA e o mRNA e tRNA e as proteínas solúveis no processo de síntese protéica? c) Quais são as funções dos sı́tios de ligação A, P e E do aminoacil-tRNA no ribossomo?