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Prova Impressa GABARITO | Avaliação I - Individual (Cod.:955519) Peso da Avaliação 2,00 Prova 82140292 Qtd. de Questões 10 Acertos/Erros 10/0 Nota 10,00 Na década de 70, através do método de Sanger, foram criadas as primeiras técnicas de sequenciamento de DNA. Ele permite especificar o nucleotídeo de cada posição da fita ou fragmento de DNA. Sobre o método de Sanger, assinale a alternativa CORRETA: A Os didesoxinucleotídeos são ineficazes para a técnicas de Sanger, sendo utilizados somente os primers e diversas fitas de DNA réplicas da mesma fita molde, com a mesma extremidade 5'. B Os didesoxinucleotídeos são similares aos primers ou iniciadores, já que iniciam a reação em diferentes terminações 3'. C São utilizados iniciadores (primers), fitas de DNA réplicas da mesma fita molde, ou seja, com a mesma extremidade 5' e diferentes terminações 3', devido à inserção dos didesoxinucleotídeos, que são nucleotídeos terminadores de cadeia (ddNTP: ddATP, ddTTP, ddCTP e ddGTP). D A técnica de Sanger, utiliza terminadores de sequência em réplicas de DNA de uma fita molde diferenciada. A criação das bibliotecas de DNA e cDNA se tornou possível através da execução das técnicas de clonagem de DNA. Sobre as bibliotecas, assinale a alternativa CORRETA: A As bibliotecas de mRNA são originadas a partir da fragmentação do DNA com enzimas de restrição e, posteriormente, da clonagem do DNA. B Uma biblioteca de DNA contém somente os íntrons de uma molécula de DNA, sendo extremamente específico para identificar o conteúdo expresso em uma célula ou tecido. C A biblioteca de cDNA contém éxons e íntrons, já que são clonados todos os fragmentos de DNA, incluindo o não codificante. D As bibliotecas de cDNA contêm somente os éxons de uma molécula de mRNA, que posteriormente é convertido em cDNA pela técnica de transcrição reversa. A técnica de PCR é utilizada para gerar várias cópias de um fragmento de DNA ou cDNA de forma ágil e eficaz. Porém para obtermos resultados mais precisos, conforme o seu objetivo de pesquisa, a PCR qualitativa ou quantitativa se torna mais eficiente. Em relação a essas técnicas, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) A PCR qualitativa necessita de um termociclador específico capaz de quantificar a amplificação dos fragmentos de DNA ao final de cada ciclo em tempo real. VOLTAR A+ Alterar modo de visualização 1 2 3 21/05/2024, 23:12 Avaliação I - Individual about:blank 1/5 ( ) A PCR qualitativa indica a presença de um fragmento específico de DNA ou cDNA em uma amostra, mas não indica quanto do gene está expresso na amostra. ( ) A qPCR é conhecida como PCR em tempo real (quantitativa) e fornece informações precisas relativas à quantidade de expressão de um gene. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A F - V - F. B V - F - F. C F - V - V. D F - F - V. Com o intuito de mandar e replicar um fragmento clonado, por certo tempo, temos como parte essencial nesse processo as bibliotecas de DNA e cDNA. Sobre essas técnicas, associe os itens, utilizando o código a seguir: I- Biblioteca de cDNA. II- Hibridização em colônia. III- Biblioteca de DNA. ( ) Técnica que detecta os fragmentos do DNA de interesse com sondas específicas em meio de cultivo sólido. ( ) Clonagem de fragmentos aleatórios do DNA, permitindo a sua identificação, isolamento e sequenciamento do genoma. ( ) Clonagem de mRNAs, em que cada célula/tecido pode originar uma biblioteca diferente, considerando o padrão de expressão gênica específico, relacionado sempre a sua função. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A II - I - III. B I - III - II. C II - III - I. D I - II - III. O sequenciamento de um gene de um organismo é umas das técnicas mais importante na biologia molecular, pois detecta mutações, cadeias de transmissão e origem da chegada do vírus a uma região específica. . De acordo com as técnicas empregadas para o sequenciamento de DNA, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) Os didesoxinucleotídeos (ddNTP) são utilizados para o sequenciamento com o método de Sanger, em que, posteriormente, faz-se a identificação da sequência com eletroforese. ( ) O método empregado na plataforma Illumina foi a base para o desenvolvimento dos testes de sequenciamento que conhecemos atualmente, sendo a primeira geração de sequenciamento de DNA. ( ) O pirosequenciamento tem como base a formação de pirofosfato a cada novo nucleotídeo adicionado à nova fita. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: 4 5 21/05/2024, 23:12 Avaliação I - Individual about:blank 2/5 A F - F - V. B V - V - F. C V - F - V. D V - F - F. [Laboratório Virtual - Extração e Purificação de DNA e RNA] Segundo o sumário da aula prática, as amostras contendo o DNA ou RNA purificados devem ser: 1) ressuspensas em um tampão e armazenadas em tubos, ambos “livres” de enzimas que possam degradá-las (como DNAse ou RNAse – nucleases); e 2) mantidas em baixas temperaturas (-20 ºC ou - 80 ºC). Todos os procedimentos devem ser realizados com luvas para evitar a degradação das amostras, devido à presença de nucleases nos fluidos corporais das mãos. De acordo com o processo de extração de DNA e RNA identificado na prática, associe os itens, utilizando o código a seguir: I- Etapa de Lise. II- Etapa de Ligação. III- Etapa de Lavagem. IV- Etapa de Eluição. ( ) Pipete 25 µl da Proteinase K no tubo Eppendorf. Em seguida, pipete 200 µl da amostra de sangue no mesmo tubo e, por último, pipete 200 µl do tampão lise S no tubo. Tampe o Eppendorf e homogeneíze no Vórtex por 20 segundos. Após esse tempo, incube o Eppendorf por 15 min. ( ) Pipete 210 µl de álcool 96% no Eppendorf e homogeneíze de novo no Vórtex. Em seguida, pipete 640 µl do Eppendorf para o tubo spin e centrifugue a 11.000 rpm por 1 minuto. ( ) Retire o Eppendorf da centrífuga, descarte o tubo de coleta e coloque o tubo spin em um novo tubo de coleta. Em seguida, pipete 500 µl do tampão de lavagem SI no tubo spin e centrifugue novamente. Repita o mesmo processo de troca de tubo de coleta, porém a lavagem utilizará 600 µl do tampão de lavagem SII, e centrifugue novamente. Por fim, repita o mesmo processo da troca do tubo de coleta e centrifugue novamente. ( ) Retire o Eppendorf da centrífuga, descarte o tubo de coleta e coloque o tubo spin em um novo tubo de coleta. Em seguida, pipete 200 µl do tampão de eluição S no tubo spin, espere 1 minuto e centrifugue a amostra. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A II - III - IV - I. B I - II - III - IV. C IV - III - II - I. D I - II - IV - III. 6 21/05/2024, 23:12 Avaliação I - Individual about:blank 3/5 [Laboratório Virtual - Hibridização] Segundo o roteiro de hibridização, o sucesso dessa prática depende da capacidade do DNA de se anelar às sequências complementares após a desnaturação (período em que a fita de DNA é simples). Dessa forma, o ponto de fusão do DNA, ou seja, o momento em que ocorre a ruptura das pontes de hidrogênio e a abertura da dupla fita de DNA, varia de um organismo para outro. O ponto de fusão do DNA também depende da quantidade de pares de base G-C e A-T, sendo que, quanto mais pares G-C, maior o ponto de fusão do genoma. Isso ocorre porque o par G-C é mais estável, apresentando três pontes de hidrogênio, enquanto o par A-T conta apenas com duas. Após o anelamento da sonda com sua sequência-alvo complementar, o padrão de hibridização é visto em microscópio de fluorescência. Além do ponto de fusão, outros fatores podem interferir na hibridização da sonda de DNA. Sobre esses fatores, analise as opções a seguir: I- Temperatura de fusão. II- pH alto para produzir condições de hibridização. III- Concentração de cátions monovalentes. IV- Presença de solventes orgânicos.Assinale a alternativa CORRETA: A Somente a opção III está correta. B Somente a opção II está correta. C As opções I, II, III e IV estão corretas. D Somente a opçãoI está correta. A escolha do gel para a técnica de eletroforese deve-se dar através do tamanho da molécula a ser isolada e do objetivo do isolamento. Com base nas matrizes de agarose e poliacrilamida para a técnica de eletroforese em gel, analise as sentenças a seguir: I- No gel de poliacrilamida temos moléculas pequenas que conseguem se movimentar pouco e fragmentos maiores de DNA que se movem facilmente no gel de agarose. II- Na separação de fragmentos de DNA, até com uma única base nitrogenada, pode-se utilizar a poliacrilamida III- No gel de agarose cada banda simboliza um grupo de moléculas de tamanho semelhantes. Pode-se dizer que por isso ela possui menor resolução. Assinale a alternativa CORRETA: A Somente a sentença II está correta. B Somente a sentença I está correta. C Somente a sentença III está correta. D As sentenças I, II e III estão corretas. 7 8 21/05/2024, 23:12 Avaliação I - Individual about:blank 4/5 A terceira geração de métodos de sequenciamento de DNA trouxe um grande avanço, em que pode-se analisar sequências de nucleotídeos de uma única molécula de DNA, sem precisar realizar a sua amplificação. Sobre esses métodos, assinale a alternativa CORRETA: A Para os métodos de terceira geração, são utilizadas plataformas 454, que são esferas sólidas, nas quais são ligadas as sequências adaptadoras, com o DNA a ser sequenciado, formando uma biblioteca de DNA. B É o mais recente avanço em biologia molecular, que permite o sequenciamento de DNA de forma portátil, capaz de sequenciar grandes moléculas de DNA em pequenos equipamentos, semelhantes a pen drives. A plataforma MinION é a mais utilizada. C É um método totalmente automatizado, também conhecido como Illumina, em que o DNA a ser sequenciado é fragmentado por nebulização e os fragmentos são acoplados a uma placa de vidro por meio de primers adaptadores, formando uma biblioteca de DNA, que será submetida ao PCR. D A 3ª geração de sequenciamento utiliza fragmentos de DNA circular, os quais são replicados em chips com nano-poços. A cada novo nucleotídeo adicionado à nova fita, ocorre a emissão de fluorescência e a detecção ocorre em tempo real. Para obter o sequenciamento de nucleotídeos longos e genomas inteiros, pode-se aplicar o sequenciamento Shotgun. Sobre esse sequenciamento, avalie as asserções a seguir e relação proposta entre elas: I- Devido ao grande volume de informação gerado por esse procedimento, é necessário que programas computacionais sofisticados sejam utilizados para a determinação da sequência do material em estudo. PORQUE II- Na técnica Shotgun, o material clonado é sequenciado diversas vezes, fornecendo uma quantidade de dados de cerca de 10 vezes o tamanho do material genético que está sendo estudado, assegurando que todos os nucleotídeos presentes no material genético sejam detectados e inseridos na sequência final do DNA. Assinale a alternativa CORRETA: A A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira. B As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I. C As asserções I e II são proposições falsas. D As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. 9 10 Imprimir 21/05/2024, 23:12 Avaliação I - Individual about:blank 5/5