Exercicio biotecnologia e bioinformatica

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Exercício biotecnologia e bioinformática 
1 . (CESPE / CEBRASPE/2009 - adaptada) A ADAGRI anunciou, no mês de abril, que o Ceará é um estado livre da sigatoka negra. Essa é a principal doença da bananeira e é ocasionada por um fungo que está sendo alvo de projeto de pesquisa da EMBRAPA Amazônia Ocidental (Manaus - AM) que visa avaliar a variabilidade genética desse fungo utilizando marcadores genéticos do tipo microssatélites. Microssatélites são regiões do genoma eucarioto que apresentam repetições de uma sequência cerne (sequência motivo) com número variável. O número de alelos geralmente é alto para essas sequências genômicas.
I - O fungo responsável pela sigatoka negra é um organismo eucarioto.
Porque
II - Um organismo eucarioto possui seu material genético composto de ácido desoxirribonucleico.
Marque a alternativa que apresenta a relação entre as asserções I e II.
A) As asserções I e II são falsas.
B) A asserção I é falsa e a asserção II é verdadeira.
C) A asserção I é verdadeira e a asserção II é falsa.
D) As asserções I e II são verdadeiras, mas a asserção II não é uma justificativa para a asserção I.
E) As asserções I e II são verdadeiras e a asserção II é uma justificativa para a asserção I.
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(CETREDE/2019) O Reino Fungi é composto por seres unicelulares ou pluricelulares heterotróficos. Junto com as bactérias, são os principais decompositores do planeta Terra. Sua importância ecológica é tão grande quanto a dos seres produtores e sem eles toda a vida em nosso planeta estaria comprometida. Os fungos podem ser encontrados em todos os cantos da crosta terrestre.
Marque a alternativa que indica, dentre os fungos, aqueles que vivem associados a raízes de plantas formando as micorrizas.
A)Mutualísticos.
B) Saprófagos.
C) Aeróbios.
D) Parasitas.
E ) Basidiomicetos.
3.O Reino Fungi, segundo métodos de biologia molecular, representa um grupo monofilético composto, tradicionalmente, por cinco principais Filos: Chytridiomycota, Zygomycota, Glomeromycota, Ascomycota e Basidiomycota. Sendo leveduras, bolores e fungos filamentosos exemplos destes organismos.
Adaptado de: Santos, E. R. D. Material Complementar ao livro Sistemática Vegetal I: Fungos. 2015. Disponível em: https://uab.ufsc.br/biologia/files/2020/08/Fungos.pdf. Acesso em: 21 jan. 2023.
Sobre leveduras, bolores e fungos filamentosos, analise as asserções I e II.
I - Leveduras, bolores e fungos filamentosos são seres multinucleados.
Porque
II - Organismos multinucleados têm células que apresentam mais de um núcleo.
Marque a alternativa que apresenta a relação entre as asserções I e II.
A)As asserções I e II são verdadeiras e a asserção II é uma justificativa para a asserção I.
B)As asserções I e II são falsas.
C)As asserções I e II são verdadeiras, mas a asserção II não é uma justificativa para a asserção I.
D)A asserção I é verdadeira e a asserção II é falsa.
E)A asserção I é falsa e a asserção II é verdadeira.
4 .O nicho ecológico dos fungos pode ser o mais variado, sendo frequentemente associados à matéria orgânica do solo ou em associação com outros organismos. Sobre os fungos decompositores, é correto afirmar:
A) Eles podem aumentar a produção e melhorar a qualidade das árvores frutíferas liberando carboidratos no solo.
B) A principal função dos fungos decompositores está relacionada ao fornecimento de carboidratos das plantas superiores.
C) Eles degradam unicamente a celulose das folhas que caem das árvores, reciclando a matéria orgânica.
D) Eles são responsáveis pela degradação da matéria orgânica, auxiliando na ciclagem dos elementos da natureza.
E) Independente do tipo de matéria orgânica presente no solo das florestas, todos os fungos podem decompor.
 
5.(COSEAC/2014 - adaptado) Algumas espécies de fungos caracterizam-se por possuir hifas especializadas, capazes de capturar nematoides parasitas de plantas e animais. Tais hifas formam um verdadeiro anel ou laço, que se fecha quando um nematoide toca a parte interna do anel armadilha, imobilizando-o para ser mais tarde colonizado e digerido por hifas apropriadas. A relação entre o fungo e o nematoide é do tipo:
 A) Saprofitismo obrigatório - relação em que os fungos vivem exclusivamente em matéria orgânica morta e não apresentam risco de parasitar outros seres vivos.
B)Mutualismo - relação em que o fungo se beneficia e a outra espécie também é beneficiada pela interação.
C)Parasitismo facultativo - relação em que o fungo é capaz de viver em matéria orgânica em decomposição ou em organismos vivos, causando doenças (animais, plantas, humanos).
D)Predatismo - relação em que o fungo consome o outro organismo matando-o.
E)Parasitismo obrigatório - relação em que os fungos vivem exclusivamente em organismos vivos, causando doenças em plantas e animais.
 
6.Os organismos agrupados como fungos são seres eucariontes e heterotróficos.
Sobre os fungos, assinale a alternativa correta.
A)Alguns fungos são capazes de produzir toxinas que têm ação neurotóxica, nefrotóxica ou hepatotóxica, podem causar alergias, problemas gastrointestinais ou até mesmo levar o indivíduo à morte.
B)Os zigomicetos não desenvolvem corpos de frutificação, nem esporos sexuados, um exemplo é a Candida albicans.
C)Fungos saprófitos provocam doenças como as micoses em seres humanos e a ferrugem em cafeeiros.
D)Candidíase, tricomoníase, histoplasmose e micoses são algumas doenças causadas por fungos.
E)No grupo dos ascomicetos, estão os fungos venenosos, como os cogumelos do gênero Amanita.
7.Os cogumelos venenosos apresentam sérios riscos à vida, dependendo do tipo de toxina que eles produzem. A amatoxina é a mais estudada e a mais letal. Qual é o mecanismo de absorção e de ação desta toxina?
A)Absorção gastrointestinal. Inibição da enzima RNA polimerase que participa de processos fundamentais na síntese de proteínas.
B)Absorção intradérmica. Estímulo dos receptores colinérgicos de acetilcolina no sistema nervoso parassimpático.
C)Absorção gastrointestinal. Interação com a actina e assim desestabilizar a ligação entre os monômeros de actina.
D)Absorção intraperitoneal. Inibição não competitiva da atividade da fosfatase alcalina, g-glutamil transpeptidase e leucina aminopeptidase.
E)Absorção intraperitonial. Inibição da enzima DNA polimerase que atua na divisão nuclear e mitose celular.
8.Os seres vivos foram divididos em cinco reinos baseados em suas características morfofisiológicas, porém após algumas décadas foi possível um novo agrupamento denominado "Domínios". A respeito desses domínios é possível afirmar que:
A)Os procariotos e os eucariotos fazem parte do domínio Eukaria, pois compartilham um ancestral comum.
B)O domínio Eukaria engloba os seres vivos unicelulares e pluricelulares que não possuem membranas em seu núcleo.
C)Os fungos por serem eucariotos pertencem ao domínio Eukaria junto com as plantas, animais e os protistas.
D)As leveduras, apesar de serem fungos, não pertencem ao domínio Eukaria por serem unicelulares.
E)Os bolores e os cogumelos pluricelulares anucleados são os principais representantes do domínio Eukaria.
9. (FCC/2007 - adaptada) A penicilina G é produzida em escala industrial pelo fungo Penicillium chrysogenum. A cinética do processo está apresentada no gráfico abaixo.
De acordo com o gráfico a produção de penicilina.
A)Consome lactose e libera amônia no meio.
B)Consome amônia e libera lactose no meio.
C)É maior quando biomassa fúngica começa a se estabilizar.
D)É inibida por amônia no tanque de cultivo.
E)A produção de penicilina inibe a produção de bactérias pela liberação de amônia para o meio.
10. (VUNESP/2013 - adaptada) Os fungos são seres vivos que podem ser encontrados em todos os ambientes. Entre os benefícios e prejuízos que eles podem trazer ao homem estão como exemplos, respectivamente:
A)Atuar na decomposição e servir de alimento.
B)Servir para tratar rejeitos industriais e causar micoses.
C)Sintetizar celulose e poluir o ar.
D)Fazer a fotossíntese e danificar as unhas.
E)Produzir gás oxigênio e decompor alimentos.
1.A biotecnologia busca o tratamentoe melhora da qualidade de vida de diversos pacientes. A terapia celular e a terapia genética são exemplos, onde cada vez mais são utilizadas para tratar diversas doenças.
Em relação a terapia genética, marque a alternativa correta.  
A)O DNA do paciente é extraído e purificado, após usado em injeções para tratar as células.
B)São usados vírus para correção de defeitos genéticos e melhoramento de células.
C)A sequência exata de DNA é usada para se determinar a melhor forma de tratamento.
D)Transferência de material genético normal para células com DNA anormal, para correção do defeito genético.
E)As células tronco são utilizadas para restaurar determinado tecido, devido a sua capacidade de autorrenovação e diferenciação.
2.(FGV/ Prefeitura de Salvador/2017 - adaptada) Nos últimos anos, os cientistas descobriram uma nova técnica para "recortar" e mudar partes do código genético, conseguindo eliminar trechos indesejados do genoma, que causam doenças e, se necessário, inserir novas sequências no local. Essa possibilidade de "cortar e cola" partes do código genético tornou possível a cura de algumas condições hereditárias, como, por exemplo, o diabetes, a obesidade, a fibrose cística e tipos graves de distrofia muscular.
Essa nova técnica é conhecida como 
A)edição de DNA.
B)reprodução por clonagem.
C)implante de células-tronco.
D)terapia gênica.
E)inseminação artificial.
3.Ao final da reação de sequenciamento de Sanger, que utiliza os ddNTPs, é necessário realizar a etapa de eletroforese para visualização do resultado.
 
Marque a alternativa que apresenta o objetivo da eletroforese após a reação de sequenciamento.
A)Separar os fragmentos maiores de DNA que irão correr no gel mais rápido que os menores.
B)Separar os fragmentos de DNA de acordo com a sua carga, do polo positivo, para o polo negativo.
C)Realizar a emissão de fluorescência dos ddNTPs adicionados na reação de sequenciamento.
D)Separar os fragmentos de DNA gerados na reação de sequenciamento de acordo com seu tamanho e carga.
E)A identificação da sequência de DNA não pode ser separada por gel de poliacrilamida devido ao tamanho da molécula.
4.O sequenciamento de DNA de Sanger foi uma das primeiras metodologias descritas para se determinar a ordem exata de nucleotídeos. A metodologia utiliza um dideoxinulceotideo, um nucleotídeo modificado para não ter um hidrogênio (H) livre na molécula de açúcar, e assim impedir que a DNA polimerase adicione novos nucleotídeos. Após a reação de sequenciamento, o resultado manual envolve uma corrida eletroforetica e posterior revelação do resultado.
De acordo com o sequenciamento de Sanger manual abaixo, marque a alternativa que apresenta a sequência de DNA correta.
 
A)CGCCGGATTT
B)GCGGCCTATT
C)GGCCCCTATT
D)CGTCCATTAA
E)GCCCCCATAA
5.Na década de 1990, células do cordão umbilical de recém-nascidos humanos começaram a ser guardadas por criopreservação, uma vez que apresentam alto potencial terapêutico em consequência de suas características peculiares.
O poder terapêutico dessas células baseia-se em sua capacidade de
A)reconhecimento de células semelhantes.
B)adesão em diferentes tecidos.
C)multiplicação lenta.
D)diferenciação em células especializadas.
E)comunicação entre as células.
6.As células tronco podem ter sua origem embrionária, células tronco adultas e Células-tronco pluripotentes induzidas (iPS), com diferentes capacidades de diferenciação.
Marque a alternativa que apresenta a origem das células tronco iPS. 
A)A partir da doação do embrião pelas clínicas de fertilização.
B)A partir de células tronco embrionária.
C)Célula de qualquer tecido adulto que é reprogramado geneticamente.
D)Células tronco hematopoiéticas reprogramadas.
E)Células tronco do coração.
7."A biofabricação é um campo de pesquisa, desenvolvimento e inovação multidisciplinar que combina princípios de engenharia, biologia e ciências dos materiais, pelo uso de processos de manufatura para criar construções que imitam, em certa medida, a arquitetura dos sistemas vivos no espaço (3D). Esta área debutou no cenário científico com estratégias potenciais para engenharia de tecidos e medicina regenerativa visando à produção de tecidos para reconstrução, órgãos para transplantes e modelos organoides para descoberta de novos fármacos, mas agora diversas outras áreas se beneficiam desse campo emergente." A manufatura aditiva, mais comumente conhecida como impressão 3D, é um processo de fabricação de objetos sólidos a partir de um arquivo digital contendo informações de coordenadas espaciais. A criação de um objeto impresso em 3D é alcançada por meio de um processo aditivo realizado pela deposição de camadas até a confecção do objeto inteiro utilizando variados tipos de materiais, incluindo metais, resinas, polímeros e, mais recentemente, até mesmo componentes biológicos como biomoléculas e células vivas. (fonte: Fundação de apoio à pesquisa do distrito federal. Bioimpressão e nanotecnologia. 2021. Disponível em: https://www.fap.df.gov.br/bioimpressao-e-nanotecnologia/. Acesso em 10/2/2022.)
 
Marque a alternativa que apresenta uma definição para organoides.
A)Nome dado ao cultivo em laboratório de células-tronco para gerar um miniórgão.
B)Nome dado para as células capazes de se transformar em uma família ou grupo de células relacionadas.
C)São células-tronco que têm seu DNA reprogramado para que se torne indiferenciado.
D)Nome dado às células-tronco pluripotentes que são transplantadas para recuperação de tecidos.
E)Nome dado aos órgãos transplantados.
8.De acordo com a sequência de DNA de um indivíduo é possível saber se o medicamento prescrito terá a ação farmacológica desejada ou não. Isso porque o DNA é que contém a informação para produção das proteínas e enzimas, dependendo da sequência pode gerar maior ou menor afinidade pelo fármaco. Diante disto, podemos ter alguns tipos de respostas nos pacientes, como os metabolizadores rápidos, intermediários e os lentos.
Marque alternativa que apresenta o efeito esperado em um paciente que apresenta a sequência de DNA que metaboliza um medicamento rápido. 
A)Efeitos colaterais evidentes.
B)Ação do medicamento garantida.
C)Ação do medicamento, porém com efeitos colaterais.
D)Sem ação medicamentosa e com efeito colateral.
E)Sem ação medicamentosa.
9.As células tronco têm sido muito estudadas e utilizadas na medicina regenerativa para substituir células danificadas ou mortas de tecidos e órgãos, como modelos de estudos para compreensão de doenças e testes de novos medicamentos. Essas aplicações são muito úteis e possíveis devido à capacidade deste tipo de célula.
A)Possuírem uma maior capacidade de diferenciação que as células tronco embrionárias.
B)De multiplicação celular constante e sem controle, permitindo a obtenção de muitas células para uso.
C)Possuírem a capacidade de autorrenovação uma vez que são células tronco embrionárias obtidas do cordão umbilical.
D)Estar presente em todos os tipos de tecido e podem se transformar em qualquer célula.
E)Possuírem a capacidade de autorrenovação e diferenciação em diferentes tipos de células.
1.A biorremediação é uma abordagem sustentável e eficaz para o tratamento de ambientes contaminados por poluentes, utilizando organismos vivos, como bactérias, fungos, plantas e outros microrganismos, para degradar, transformar ou remover substâncias tóxicas e poluentes do solo, água e ar. Assinale uma das vantagens da biorremediação em relação a outras técnicas de despoluição?
A)Independência das condições químicas e biológicas do ambiente.
B)Utilização exclusiva de microrganismos do gênero Bacillus.
C)Baixo custo em comparação com outras técnicas.
D)Redução da necessidade de nutrientes para os microrganismos.
E)Remoção completa e imediata de poluentes do ambiente.
2.O processo de tratamento de águas residuais envolve o uso de microrganismos anaeróbicos. A finalidade do uso de microrganismos no tratamento de águas residuais é:
A)A propagação e crescimento de microrganismos a fim de serem liberados no ambiente para posterior tratamento.
B)A limpezada água e eliminação de todo tipo de material jogado no esgoto.
C)O consumo do material orgânico presente na água residual com formação de lodo.
D)A eliminação de outros microrganismos prejudiciais ao ser humano.
E)Resíduos sólidos e sedimentos, como areia, pedras e outros elementos.
3.Pelo uso da engenharia genética é possível transferir uma informação genética de uma espécie para a outra e fazer com a espécie receptora adquira aquela nova característica. A tecnologia que permite isso é chamada de tecnologia do DNA recombinante e tem sido utilizada para criar plantas resistentes a pragas e herbicidas, plantas mais nutritivas, plantas mais resistentes ao solo etc. Os organismos obtidos por esta tecnologia recebem o nome de:
A)OGM
B)Mutantes
C)Transgênicos
D)Totipotentes
E)Clonagem
4.A produção de plantas idênticas geneticamente, também conhecida como clonagem vegetal, é uma técnica amplamente utilizada na agricultura, na preservação de espécies ameaçadas, na produção de plantas ornamentais e na pesquisa científica. Qual é a característica das células vegetais que permite a produção de plantas idênticas geneticamente através da micropropagação?
A)Autofagia
B)Diferenciação
C)Maturação
D)Haploidia
E)Totipotência
5.O processo de fermentação é bastante explorado pelas indústrias de alimentos para modificar uma matéria prima. Quando se fala de leite, usamos um grupo de microrganismos denominados________________, que realizam a fermentação _______________ responsável pela produção de queijo, iogurte e leite fermentado.  
Preencha corretamente as lacunas.
A)Bactérias acéticas, fermentação acética  
B)Bactérias acéticas, fermentação butiríca 
C)Bactérias lácticas, fermentação láctica  
D)Bactérias lácticas, fermentação alcoólica  
E)Clostridium butyricum, fermentação butiríca 
6.A utilização de animais transgênicos na produção de biofármacos representa uma abordagem inovadora e promissora na indústria farmacêutica e na biotecnologia. Qual é uma das principais vantagens de utilizar animais transgênicos na produção de biofármacos em comparação com outros sistemas de expressão?
A)Maior dificuldade na obtenção de proteínas plasmáticas.
B)Elevada produção do biofármaco em um rebanho pequeno.
C)Conformação incorreta das proteínas após sua expressão.
D)Menor viabilidade econômica na produção de proteínas.
E)Menor produção de proteínas funcionais.
7.Sobre o uso de animais transgênicos NÃO é correto afirmar:
A)Permitem uso de animais como biorreatores na produção de biofármacos.
B)A produção de animais transgênicos permite a criação de animais imunocompatíveis com o homem, de modo a permitir o xenotransplante.
C)O único modo de se criar um animal transgênico é pela inserção do DNA recombinante através do sistema biológico Agrabacterium tumefaciens.
D)A inserção do gene de interesse precisa acontecer nas células germinativas ou no início da fecundação.
E)Permitem a criação de modelos de doenças humanas pela inserção de genes ou silenciamento de genes.
8.Para aumentar a concentração de proteína no leite de vacas visando à produção de queijo, a abordagem utilizada envolve a introdução de modificações genéticas nas vacas por meio da técnica de engenharia genética. Qual é a abordagem utilizada para aumentar a concentração de proteína no leite de vacas visando à produção de queijo?
A)Inserção do gene da lactase no genoma das vacas.
B)Modificação do DNA mitocondrial das vacas.
C)Introdução de genes resistentes a doenças nas vacas.
D)Inserção dos genes CSN2 e CSN3 para aumentar a quantidade de caseína no leite.
E0Adição de enzimas de restrição ao leite das vacas.
9.A Biotecnologia Industrial desempenha um papel crucial, atuando na melhoria dos processos industriais, na redução de impactos ambientais e na criação de produtos inovadores. Qual é o principal objetivo da Biotecnologia Industrial?
A)Utilizar organismos ou partes destes para processos mais limpos e menos poluentes na indústria.
B)Criar organismos sintéticos para fins de pesquisa científica.
C)Substituir processos industriais por métodos mais poluentes.
D)Produzir organismos geneticamente modificados para uso agrícola.
E)Promover a produção de produtos químicos sintéticos em larga escala.
10.Pesticidas são contaminantes ambientais altamente tóxicos aos seres vivos e, geralmente, com grande persistência ambiental. A busca por novas formas de eliminação dos pesticidas tem aumentado nos últimos anos, uma vez que as técnicas atuais são economicamente dispendiosas e paliativas. A biorremediação de pesticidas utilizando microrganismos tem se mostrado uma técnica muito promissora para essa finalidade, por apresentar vantagens econômicas e ambientais. Para ser utilizado nesta técnica promissora, um microrganismo deve ser capaz de
A)Metabolizar o contaminante, liberando subprodutos menos tóxicos ou atóxicos.
B)Transferir o contaminante do solo para a água.
C)Apresentar alta taxa de mutação ao longo das gerações.
D)Estimular o sistema imunológico do homem contra o contaminante.
E)Absorver o contaminante sem alterá-lo quimicamente.
1.Aline é biomédica e trabalha em um laboratório para diagnóstico de doenças genéticas. Um dos genes mais pesquisados é o brca1, que quando sofre mutações específicas está associado ao risco aumentado de câncer. Para identificar as mutações, é necessário comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência referência não mutada. Qual banco de dados, disponível no NCBI, Aline pode consultar para conseguir uma sequência referência curada para o gene brca1?
A)RefSeq.
B)BLAST.
C)KEGG.
D)GenBank.
E)PubMed.
2.Julgue as afirmativas a seguir sobre a ferramenta BLAST, usada para alinhamento de sequências e disponível no portal do NCBI.
I. Muito usada para sequências com apenas alguns trechos/locais conservados.
II. Importante utilizá-la quando duas sequências têm tamanhos próximos, pois toda extensão da sequência será comparada.
III. O alinhamento é feito par a par, comparando apenas duas sequências por vez.
IV. Usada para busca em banco de dados de sequências.
É correto o que se afirma em:
A)I e II.
B)II, III e IV.
C)II e IV.
D)II e III.
E)I, III e IV.
3.Muitos programas de computador já foram e continuam sendo desenvolvidos para auxiliar no desenho de primers usados na PCR (Reação em Cadeia de Polimerase). Dentre eles, podemos citar o Primer3, que pode ser usado de forma on-line por qualquer pessoa. Qual das opções abaixo contém uma informação essencial que o usuário precisa fornecer obrigatoriamente, para que um programa consiga desenhar primers?
A)Temperatura de melting.
B)Sequência de nucleotídeos do alvo no DNA.
C)Temperatura de anelamento.
D)Conteúdo GC.
E)Tamanho do produto amplificado.
4.Em uma análise utilizando a PCR, Lucas encontrou como resultado a amplificação de várias regiões diferentes do DNA das amostras analisadas. O que ele esperava era encontrar apenas uma região amplificada, somente nas amostras positivas. Para solucionar o problema, seu chefe sugeriu, então, que ele desenhasse um novo par de primers e prestasse atenção no comprimento em nucleotídeos, para melhorar a especificidade. Você diria para Lucas desenhar um novo par de primers com um comprimento maior ou menor que o par de primers que ele havia usado primeiro?
A)Maior, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
B)Menor, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
C)Igual, pois o comprimento não interfere na especificidade dos primers.
D)Menor, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
E)Maior, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
5.Escolha a opção que justifique por que é importante que o comprimento do produto amplificado pela reação de PCR seja maior que 150 pares de bases (pb).
A)A temperatura de anelamento para amplificar uma região menor que 150pb é maior que 72°C.
B)Estabelecer um comprimento mínimo do produto aumenta a especificidade da reação.Primers que se ligam ao redor de regiões menores que 150pb formamestruturas secundárias com maior facilidade.
C)A enzima Taq DNA polimerase não consegue amplificar segmentos de DNA menores que 150pb.
D)Primers que se ligam ao redor de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior facilidade.
E)Produtos amplificados menores que 150pb podem se confundir com restos de primers que não se ligaram ao DNA e ficam no final da eletroforese.
6. (PR4 - UFRJ - Biólogo - UFRJ - Biologia Molecular - 2016)
Um pesquisador e sua equipe acabam de obter a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo anteriormente desconhecido. Querendo saber se esse gene ou um gene similar está presente no genoma humano, ele deve recorrer à seguinte ferramenta de bioinformática:
A)Mega.
B)BLAST.
C)GenBank.
D)Multialignm.
E)Velvet.
7. (UFSM, 2006, Biólogo) As temperaturas são essenciais para a realização da amplificação do DNA por PCR. Associe a segunda coluna com a primeira.
1. de 0°C a 10°C
2. de 35°C a 65°C
3. 72°C
4. 82°C
5. de 90°C a 96°C
( ) Maior probabilidade de alinhamento dos primers com a fita molde.
( ) Formação de fitas-molde a partir de todos os segmentos.
( ) Ideal para ação da enzima Taq-DNA-polimerase.
( ) Ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3'.
( ) Estabelecimento de ligações - pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers.
A)2 - 5 - 3 - 3 - 2.
B)2 - 3 - 1 - 3 - 4.
C)4 - 2 - 3 - 2 - 1.
D)5 - 4 - 1 - 5 - 3.
E)3 - 4 - 5 - 4 - 2.
8.O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos científicos da área biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você queira direcionar a sua busca para obter artigos mais adequados ao seu interesse, o que poderia ser feito?
A)Cadastrar seus dados profissionais e receber uma autorização para acessar a parte restrita do PubMed que permite buscas avançadas.
B)Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é necessário avaliar todos os títulos que aparecem como resultado para escolher aqueles mais adequados.
C)Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele direcione automaticamente suas buscas de acordo com os critérios que você deseja.
D)Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de instituição pública, como universidades ou bibliotecas. Só assim é possível direcionar a busca por artigos.
E)Utilizar os filtros de busca, que incluem ano e tipo de artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca avançada.
9.Durante um noticiário na televisão que falava sobre notícias na área de ciência e tecnologia, o repórter citou o termo NCBI. Dona Rosângela, curiosa, perguntou a seu neto o significado daquele termo. Qual seria a resposta correta que o neto de Dona Rosângela deveria dar?
A)O NCBI é um banco de dados de sequências de nucleotídeos curadas e sem redundância.
B)O NCBI é uma ferramenta usada para o alinhamento de sequências biológicas.
C)O NCBI se trata apenas de um banco de dados de artigos científicos da área biomédica.
D)O NCBI é um portal que apresenta bancos de dados e ferramentas importantes para a área biotecnológica.
E)O NCBI é um programa on-line para o desenho de primers.
10.Considere o alinhamento de uma sequência nucleotídica desconhecida em relação a um banco de dados de genes associados ao desenvolvimento de câncer usando a ferramenta BLAST. A partir dessa situação, são descritas algumas características desse programa. Assinale a alternativa que retrata a utilização correta dessa ferramenta.
A)Se o valor de e-value for igual a 0.0, o alinhamento deve ser desconsiderado, pois ocorreu ao acaso.
B)A opção de BLASTn deve ser escolhida, uma vez que compara sequência de aminoácidos contra um banco de dados de proteínas.
C)Caso encontre o e-value igual a 100%, a sequência desconhecida será idêntica à sequência no banco de dados.
D)Quanto menor o valor de e-value, menor a probabilidade de o alinhamento ter sido obtido ao acaso com uma sequência do banco de dados.
E)A variação da ferramenta indicada nesse caso é o BLASTp, que compara sequência de nucleotídeos contra um banco de dados de proteínas.
1.O aluno Pedro está começando agora uma nova iniciação científica. Sua orientadora lhe disse que ele irá trabalhar com a enzima mieloperoxidase (MOP), mas ele ainda não compreende a importância do seu projeto. Ele precisa acessar um banco de dados biológico que reúna uma grande variedade de informações sobre essa proteína, como vias metabólicas e doenças associadas a ela. Qual banco de dados você recomendaria a ele?
A)Swiss-Prot.
B)GenBank.
C)KEGG.
D)PubMed.
E)PDB.
2. (Adaptado de VUNESP - 2020 - EBSERH - Farmacêutico) A revolução biotecnológica tem fornecido informações extremamente úteis para a descoberta de fármacos. O sufixo "ômica" indica uma série de novas disciplinas e procedimentos que visam à identificação funcional e/ou estrutural de tecidos, de células, de padrões de expressão gênicos e de características metabólicas (Bhogal & Balls, 2008), dentre elas:
BHOGAL, N.; BALLS, M. Translation of new technologies: from basic research to drug discovery and development. Curr. Drug Discov. Technol., v.5, n.3, p.250-62, 2008.
A)Genômica, transcriptômica e biônica.
B)Genômica, transcriptômica e metabolômica.
C)Proteômica, lipidômica e dicotômica.
D)Genômica, dicotômica e proteômica.
E)Genômica, lipidômica e biônica.
3.(Adaptado de UFCE - 2015 - Engenheiro - Área Engenharia de Pesca)
A transcritômica ou transcriptômica é a ciência que estuda o transcritoma produzido por determinada célula, tecido ou organismo. Sobre esse tema, é correto afirmar que:
A)O transcriptoma é o mesmo em todos tecidos e órgãos.
B)Podem haver vários transcriptomas em um único organismo.
C)Independente de estágio de desenvolvimento, o transcriptoma é o mesmo.
D)A transcriptômica estuda o conjunto de proteínas.
E)Apesar de sua aplicação em diversos campos da biologia, a transcriptômica não pode ser pesquisada a partir de técnicas de alto desempenho e sequenciamento de nova geração (NGS).
4.A química de produtos naturais tem empregado novas metodologias com o objetivo de acelerar a descoberta e o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com fins terapêuticos. Entre eles, técnicas de separação associadas às espectrométricas de alto desempenho, assim analisando o extrato bruto de uma planta, ou seja, sem prévio isolamento de um composto único, uma vez que esses estudos são realizados para a obtenção das informações qualitativas e quantitativas acerca da maior quantidade possível de tipos diferentes de constituintes de cada amostra. Esse tipo de estudo emprega qual abordagem ômica?
A)Lipidômica.
B)Proteômica.
C)Genômica.
D)Metabolômica.
E)Transcriptômica.
5.Um grande avanço da bioinformática aconteceu durante a execução do Projeto Genoma Humano, que durou mais de 10 anos e teve como objetivo principal determinar a ordem dos nucleotídeos de todo genoma da nossa espécie. Essa empreitada científica estimulou o aprimoramento de computadores e de programas para lidar com a grande quantidade de dados que começou a ser gerada. Hoje vivemos o que é chamado de ¿era pós-genômica¿, como o desenvolvimento e aperfeiçoamento de técnicas e programas que permitem estudar outras ciências ômicas. De acordo com as ciências ômicas, analise as afirmativas a seguir:
 
I. Genética é o estudo de todo o DNA de um indivíduo.
II. Metabolômica estuda moléculas de baixo peso molecular produzidas por uma célula.
III. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu RNA.
 
Quais são as afirmativas corretas?
A)As afirmativas 1 e 3 estão corretas.
B)As afirmativas 1 e 2 estão corretas.
C)Somente a afirmativa de número 3 está correta.
D)Somente a afirmativa 2 está correta.
E)Somente a afirmativa de número 1 está correta.
6.Depois de resultados do sequenciamento genômico, um pesquisador agora deseja analisar a expressão dos genes e comparar o resultado de dois pacientes, um saudável e outro com câncer pulmonar. Para isso, ele analisou o conjunto completo de RNAs da biópsia do pulmão dos pacientes. Como é chamadaa abordagem ômica utilizada pelo pesquisador na fase atual de sua pesquisa?
A)Proteômica.
B)Genômica.
C)Lipidômica.
D)Metabolômica.
E)Transcriptômica.
7.A sequência de Shine-Delgarno e as sequências das "pontas" dos íntrons são exemplos de sinais na sequência de DNA. Esses sinais são sequências características conservadas, que marcam as regiões necessárias para que a transcrição e tradução ocorram. Qual processo de bioinformática inclui a identificação desses sinais?
A)Montagem do genoma.
B)Predição gênica.
C)Construção de árvore filogenética.
D)Extração do DNA.
E)Sequenciamento do genoma.
8.Diferentes tipos de dados biológicos podem ser armazenados em bancos de dados computacionais. Em relação aos tipos de bancos de dados biológicos, relacione as duas colunas.
1. Curado.
2. Acesso livre.
3. Especializado
4. Primário.
( ) Armazenam informações biológicas originais, resultados de experimentos científicos.
( ) Banco que contém informações processadas por um profissional com uma boa experiência no assunto.
( ) Reúnem todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV.
( ) Está disponível para qualquer tipo de usuário, sem restrição de acesso.
Qual a sequência correta?
A)4-1-3-2.
B)1-2-3-4.
C)1-3-2-4.
D)4-3-2-1.
E)2-4-1-3.
9.Julgue as afirmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos.
I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas.
II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo usuário.
III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais confiáveis eles são.
A)A afirmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsas.
B)A afirmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições falsas.
C)As afirmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa.
D)As afirmativas I, II e III são proposições verdadeiras.
E)As afirmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição falsa.
10. (CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular)
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta.
A)A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identificação direta das proteínas expressas.
B)As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios.
C)A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose.
D)O microarranjo de DNA consiste em um arranjo predefinido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a uma superfície sólida.
E)A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio.
1.O aluno Pedro está começando agora uma nova iniciação científica. Sua orientadora lhe disse que ele irá trabalhar com a enzima mieloperoxidase (MOP), mas ele ainda não compreende a importância do seu projeto. Ele precisa acessar um banco de dados biológico que reúna uma grande variedade de informações sobre essa proteína, como vias metabólicas e doenças associadas a ela. Qual banco de dados você recomendaria a ele?
A)PubMed.
B)PDB.
C)Swiss-Prot.
D)GenBank.
E)KEGG.
2. (Adaptado de VUNESP - 2020 - EBSERH - Farmacêutico) A revolução biotecnológica tem fornecido informações extremamente úteis para a descoberta de fármacos. O sufixo "ômica" indica uma série de novas disciplinas e procedimentos que visam à identificação funcional e/ou estrutural de tecidos, de células, de padrões de expressão gênicos e de características metabólicas (Bhogal & Balls, 2008), dentre elas:
BHOGAL, N.; BALLS, M. Translation of new technologies: from basic research to drug discovery and development. Curr. Drug Discov. Technol., v.5, n.3, p.250-62, 2008.
A)Genômica, lipidômica e biônica.
B)Proteômica, lipidômica e dicotômica.
C)Genômica, transcriptômica e metabolômica.
D)Genômica, transcriptômica e biônica.
E)Genômica, dicotômica e proteômica.
3. (Adaptado de UFCE - 2015 - Engenheiro - Área Engenharia de Pesca)
A transcritômica ou transcriptômica é a ciência que estuda o transcritoma produzido por determinada célula, tecido ou organismo. Sobre esse tema, é correto afirmar que:
A)Apesar de sua aplicação em diversos campos da biologia, a transcriptômica não pode ser pesquisada a partir de técnicas de alto desempenho e sequenciamento de nova geração (NGS).
B)Podem haver vários transcriptomas em um único organismo.
C)O transcriptoma é o mesmo em todos tecidos e órgãos.
D)Independente de estágio de desenvolvimento, o transcriptoma é o mesmo.
E)A transcriptômica estuda o conjunto de proteínas.
4.A química de produtos naturais tem empregado novas metodologias com o objetivo de acelerar a descoberta e o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com fins terapêuticos. Entre eles, técnicas de separação associadas às espectrométricas de alto desempenho, assim analisando o extrato bruto de uma planta, ou seja, sem prévio isolamento de um composto único, uma vez que esses estudos são realizados para a obtenção das informações qualitativas e quantitativas acerca da maior quantidade possível de tipos diferentes de constituintes de cada amostra. Esse tipo de estudo emprega qual abordagem ômica?
A)Transcriptômica.
B)Lipidômica.
C)Proteômica.
D)Metabolômica.
E)Genômica.
5.Um grande avanço da bioinformática aconteceu durante a execução do Projeto Genoma Humano, que durou mais de 10 anos e teve como objetivo principal determinar a ordem dos nucleotídeos de todo genoma da nossa espécie. Essa empreitada científica estimulou o aprimoramento de computadores e de programas para lidar com a grande quantidade de dados que começou a ser gerada. Hoje vivemos o que é chamado de ¿era pós-genômica¿, como o desenvolvimento e aperfeiçoamento de técnicas e programas que permitem estudar outras ciências ômicas. De acordo com as ciências ômicas, analise as afirmativas a seguir:
 
I. Genética é o estudo de todo o DNA de um indivíduo.
II. Metabolômica estuda moléculas de baixo peso molecular produzidas por uma célula.
III. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu RNA.
 
Quais são as afirmativas corretas?
A)As afirmativas 1 e 3 estão corretas.
B)Somente a afirmativa 2 está correta.
C)As afirmativas 1 e 2 estão corretas.
D)Somente a afirmativa de número 1 está correta.
E)Somente a afirmativa de número 3 está correta.
6.Depois de resultados do sequenciamento genômico, um pesquisador agora deseja analisar a expressão dos genes e comparar o resultado de dois pacientes, um saudável e outro com câncer pulmonar. Para isso, ele analisou o conjunto completo de RNAs da biópsia do pulmão dos pacientes. Como é chamada a abordagem ômica utilizada pelo pesquisador na fase atual de sua pesquisa?
A)Lipidômica.
B)Genômica.
C)Transcriptômica.
D)Proteômica.
E)Metabolômica.
7.A sequência de Shine-Delgarno e as sequências das "pontas" dos íntrons são exemplos de sinais na sequência de DNA. Esses sinais são sequências características conservadas, que marcam as regiões necessárias para que a transcrição e tradução ocorram. Qual processo de bioinformática inclui a identificação desses sinais?
A)Predição gênica.
B)Sequenciamento do genoma.
C)Montagem do genoma.
D)Construção de árvore filogenética.
E)Extração do DNA.
8.Diferentes tipos de dados biológicos podem ser armazenados em bancos de dados computacionais. Em relação aos tipos de bancos de dados biológicos, relacione as duas colunas.
1. Curado.
2. Acesso livre.
3. Especializado
4. Primário.
( ) Armazenam informações biológicas originais, resultados de experimentos científicos.
( ) Banco que contém informações processadas por um profissional com uma boa experiência no assunto.
( ) Reúnem todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV.
( ) Está disponível para qualquer tipo de usuário, semrestrição de acesso.
Qual a sequência correta?
A)1-3-2-4.
B)4-3-2-1.
C)4-1-3-2.
D)2-4-1-3.
E)1-2-3-4.
9.Julgue as afirmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos.
I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas.
II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo usuário.
III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais confiáveis eles são.
A)A afirmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições falsas.
B0As afirmativas I, II e III são proposições verdadeiras.
C)As afirmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa.
D)A afirmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsas.
E)As afirmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição falsa.
10. (CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular)
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta.
A)As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios.
B)O microarranjo de DNA consiste em um arranjo predefinido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a uma superfície sólida.
C)A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identificação direta das proteínas expressas.
D)A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio.
E)A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose.
1.Existem diversas formas de buscarmos a melhor hipótese filogenética com uma matriz de táxons × caractere. Dentre as possibilidades, temos a máxima verossimilhança. Qual das alternativas a seguir define melhor este conceito?
A)A melhor árvore calculada a partir da quantidade de passos, ou mudanças, nos ramos.
B)A proporção das probabilidades de duas hipóteses alternativas.
C)A probabilidade de que uma hipótese seja falsa através do método dos mínimos quadrados.
D)A probabilidade de observar um conjunto de dados, fornecido uma hipótese.
E)A probabilidade de que um evento ocorra.
2.Observe o cladograma abaixo:
Imagem Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a um grupo parafilético.
A)O conjunto de espécies A F.
B)O conjunto de espécies U V H.
C)O conjunto de espécies P Q R.
D)O conjunto de espécies J K L M.
E)O conjunto de espécies G H I.
3.Observe o caldograma abaixo:
Imagem: Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a um grupo polifilético.
A0O conjunto de espécies N O P
B)O conjunto de espécies A B C D
C)O conjunto de espécies H I
D)O conjunto de espécies S T
E)O conjunto de espécies W X Y
4.Analise a figura a seguir:
Imagens: Leandro Pederneiras
Analisando as árvores da esquerda e direita é possível afirmar que:
A)São perfeitamente similares, apenas a forma de apresentação mudou e alguns ramos giraram em seu próprio eixo.
B)São árvores diferentes porque possuem relações entre grupos diferentes.
C)O grupo A B C D E é mais próximo relacionado ao grupo I J K L M na árvore da esquerda do que na da direita.
D)Alguns clados foram cortados e colados em diferentes ramos na árvore da direita.
E)Possuem topologias idênticas, mas a árvore da direita possui nós mais profundos.
5.O quadro a seguir mostra uma matriz de dados táxons x caracteres, sendo apresentados 9 espécies (de A ao I) e 9 caracteres (de 1 ao 9):
Como uma análise de parcimônia seria afetada pela remoção das duas primeiras posições (1 e 2) e da última posição (9) da matriz de dados fornecida?
A)A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará; a árvore ótima terá três etapas a mais.
B)A topologia de árvore ideal pode ou não mudar; o comprimento ideal da árvore pode ser maior ou menor.
C)A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará, e nem seu comprimento.
D)A topologia de árvore ideal certamente mudará; a árvore ótima será menor.
E)A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará; a árvore ótima será três etapas mais curta.
6.A seguir são apresentadas diferentes árvores filogenéticas (de A ao E).
Imagem: Leandro Pederneiras
Após analisar a figura, assinale a alternativa que retrata de forma correta a interpretação dos gráficos.
A)Os ramos curvos das divergências do gráfico a significam a idade evolutiva retrocedendo para a raiz.
B)No gráfico b, ramos mais longos significam mais longo tempo decorrido em relação aos ramos curtos.
C)No tipo de apresentação do gráfico c a raiz é identificada através do clado com maior número de ramos emergindo.
D)Os dois pontos indicados pelas setas na figura d, apesar de separados, possuem idades ancestrais idênticas. Podemos interpretar dessa forma porque os pontos estão na mesma altura no gráfico.
E)No gráfico e, podemos dizer que o ponto indicado pela seta laranja é pelo menos duas vezes mais antigo que o ponto indicado pela seta azul.
7.Para compreender o que diz uma árvore filogenética, diversas terminologias e conceitos são empregados. A seguir, são listados diferentes conceitos sobre a filogenia. Assinale a alternativa que retrata de forma correta um conceito das árvores filogenéticas:
A)Podemos rodar os ramos em seu próprio eixo sem alterar as relações de parentesco, mas se cortarmos e colarmos um ramo em outra parte, dizemos que a topologia mudou.
B)O ponto no qual o gráfico se inicia é denominado clado inferior, onde está a raiz da árvore.
C)Quando queremos apontar um táxon duplicado dentro da árvore filogenética, dizemos que existe um grupo irmão.
D)Topologia significa o táxon terminal, aqueles nomes que estão inseridos no topo da árvore filogenética.
E)Terminal, num cladograma, significa um ramo com dois nós (duas divergências) nas extremidades.
8.Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), o que determina quando uma cadeia se move da árvore atual para uma nova árvore?
A)A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma probabilidade de log maior do que o estado atual.
B)A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma probabilidade que é fixada no início da pesquisa.
C)A probabilidade de aceitar uma proposta depende da razão entre as probabilidades posteriores entre o estado atual e proposto.
D)A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual.
E)A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que seja consistente com a anterior.
9.Existem diversas metodologias para buscar a melhor árvore filogenética. Todas estas abordagens são fundamentais para o avanço da compreensão da evolução. Dentre estes métodos está a aplicação do neighbor-joining. Qual é a melhor definição desta técnica?
A)Uma árvore é estimada com base na proximidade dos táxons em uma matriz de dados.
B)Uma busca em árvore é conduzida para encontrar a árvore que minimiza a diferença entre as distâncias observadas e previstas.
C)A árvore mais curta é encontrada sob a suposição de que há uma árvore mais curta.
D)Um algoritmo rápido que encontrará uma árvore com base em distâncias entre pares.
E)Um protocolo para adicionar táxons a uma árvore construída por parcimônia ou máxima verossimilhança.
10.A árvore filogenética é uma hipótese sobre relações evolutivas, mas para construir precisamos usar características que sejam indicadores confiáveis de ancestralidade comum. Nesse contexto, utilizamos para a construção das árvores as características homólogas. A seguir estão listadas algumas propriedades das características ditas homólogas. Analise a alternativa que NÃO se refere a essa característica:
A)Ponto de origem em local similar
B)Estrutura e composição similar
C)Desenvolvimento similar
D)Linhagens diferentes com traços similares
E)Funções similares
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