Para responder à sua pergunta, vamos analisar as alternativas apresentadas em relação ao contexto histórico do Brasil Colonial e a questão do registro de batismo. A dificuldade em conseguir o registro de batismo estava relacionada principalmente à origem dos colonos e suas condições sociais e religiosas. Analisando as opções: A) Porque os colonos tendiam à migração interna, sendo difícil conseguir a certidão de nascimento. - Embora a migração interna possa ter sido um fator, não é o principal motivo relacionado ao registro de batismo. B) A maioria dos colonos eram cristãos novos que não haviam se batizado na Igreja católica. - Esta opção é relevante, pois muitos cristãos novos enfrentavam dificuldades para se integrar à Igreja Católica e, portanto, não tinham registros de batismo. C) A maioria dos colonos eram prisioneiros vindos de Portugal que não possuíam certidão necessária para o batismo. - Embora houvesse prisioneiros, essa não é uma explicação abrangente para a dificuldade em conseguir registros de batismo. D) A maioria dos colonos eram cristãos novos que não possuíam certidão de nascimento, documento necessário para o batismo. - Esta opção também é válida, pois muitos cristãos novos não tinham certidões de nascimento, o que dificultava o batismo. Considerando as opções, a alternativa que melhor explica a dificuldade em conseguir o registro de batismo é a B), pois destaca a condição dos cristãos novos, que enfrentavam barreiras para se batizar na Igreja Católica.