Técnicas de Análise do Transcriptoma e Genômica Estrutural

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GABARITO | Avaliação II - Individual (Cod.:771459)
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Prova 58131153
Qtd. de Questões 10
Acertos/Erros 10/0
Nota 10,00
Diferentemente do genoma, que é idêntico em todas as células somáticas de um mesmo 
organismo, uma importante característica do transcriptoma é ser específico em cada tipo celular e se 
apresenta de maneira bastante variável a diferentes condições, refletindo efeitos de diferentes 
estímulos, sejam eles químicos, fisiológicos, patológicos, entre outros. Sobre as técnicas utilizadas 
para análise do transcriptoma, assinale a alternativa CORRETA:
A A ORESTES sequencia somente as extremidades do cDNA, identificando o RNA por meio de
comparações com bancos de dados, como o BLAST.
B Tanto a metodologia utilizada pela EST quanto a ORESTES, comparam os dados obtidos com
bancos de dados disponíveis, como o BLAST, a fim de identificar os genes correspondentes.
C O método EST tem todo o cDNA clonado sequenciado, fornecendo informações sobre a região
codificadora do RNA mensageiro.
D A técnica do microarray, ou microarranjos de DNA limita a busca de genes a um pequeno
número de cDNA, pois necessita de sondas específicas marcadas com fluoróforo.
As informações obtidas no processo de digestão proteica são relativas à m/z dos diferentes 
peptídeos. Contudo, é de grande interesse que as sequências de aminoácidos que compõem as 
proteínas sejam também identificadas. De acordo com a detecção da sequência dos aminoácidos de 
uma proteína, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: 
( ) No processo de fragmentação dos íons peptídicos, são utilizadas técnicas que favorecem a 
formação de fragmentos que sejam opostos e complementares. 
( ) A sequência de aminoácidos dos peptídeos pode ser deduzida por softwares apropriados para o 
sequenciamento, que podem formar a sequência completa da proteína. 
( ) Os processos de dissociação induzida por colisão (CID) ou por transferência de elétrons (ETD) 
formam íons de massa molecular elevada, que são aplicados ao primeiro ciclo de cromatografia 
líquida. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A V - V - F.
B V - F - F.
C F - F - V.
D V - F - V.
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A grande vantagem da utilização do RNA-seq é que, nesta tecnologia, não é necessário que se 
tenha prévio conhecimento do genoma ou dos transcritos que serão avaliados. Algumas das 
aplicações relacionadas a essa técnica são: a avaliação da expressão gênica diferencial, análise do 
perfil do transcriptoma e a investigação de SNPs. Com base nas etapas para do método da 
transcriptoma RNA-seq, ordene os itens a seguir: 
I- Fragmentar as moléculas por ação de enzimas de restrição, sonicação ou nebulização, formando 
fragmentos que serão ligados a adaptadores (pequenas sequências de nucleotídeos que indicam onde 
o sequenciamento deve ser iniciado em cada molécula). 
II- Isolar e fragmentar o RNA a ser sequenciado e convertê-lo em cDNA. 
III- Aplicar métodos de sequenciamento para sequenciar pequenas porções, compostas por 30 a 200 
pb (pares de bases), de cada um dos fragmentos. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A II - III - I.
B II - I - III.
C I - II - III.
D I - III - II.
A determinação da região de um gene no cromossomo pode ser realizada pela técnica de 
eletroforese em gel de campo pulsado. Sobre essa técnica, assinale a alternativa CORRETA:
A Essa técnica é utilizada para detecção de grandes cromossomos somente, pois os pequenos
cromossomos não conseguem ser isolados nas bandas do gel.
B O campo pulsado se deve à corrente elétrica que se alterna perpendicularmente ao gel.
C Essa técnica identifica a presença ou não de DNA na amostra, não sendo possível indicar sua
localização.
D O campo pulsado se deve à correte elétrica comum aplicada à eletroforese em gel.
A genômica estrutural é o estudo da estrutura propriamente dita do genoma, sendo seu principal 
objetivo atrelado à possibilidade de manipulação de fragmentos do DNA ou de seus genes in loco. 
Sobre a genômica estrutural, associe os itens, utilizando o código a seguir: 
I- Mapas cromossômicos de alta resolução. 
II- Mapas cromossômicos de baixa resolução. 
III- Mapas cromossômicos físicos. 
( ) A primeira etapa se baseia na ocorrência de um alelo que não esteja presente no mapa 
cromossômico, em uma região com marcadores já mapeados. Dessa forma, pode-se definir em qual 
cromossomo aquele novo alelo ocorre. 
( ) A segunda etapa determina a posição dos genes dentro de cada cromossomo, fornecendo 
informações mais precisas sobre esses gene e marcadores no genoma. 
( ) A terceira etapa aplica diferentes técnicas determinando um mapa físico do genoma e ocorre o 
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sequenciamento. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A I - III - II.
B I - II - III.
C II - I - III.
D III - II - I.
As ciências ômicas buscam o entendimento do funcionamento celular dos organismos e suas 
alterações biológicas. A era das diferentes ciências "ômicas" está intimamente relacionada entre si. 
Sobre as "ômicas", associe os itens, utilizando o código a seguir: 
I- Transcriptoma. 
II- Proteoma. 
III- Metaboloma. 
( ) Estudo das proteínas e enzimas expressas. 
( ) Estudo dos metabólitos resultantes de processos biológicos. 
( ) Estudo do RNA mensageiro, ou seja, quais genes são lidos. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A I - II - III.
B II - III - I.
C I - III - II.
D II - I - III.
No processo de digestão in gel, os spots contendo as proteínas de interesse são submetidos a um 
processo de hidrólise química e enzimática, formando fragmentos proteicos menores, capazes de 
migrar pela malha do gel e se difundir no sobrenadante, formando a amostra que será analisada por 
espectrometria de massas. De acordo com a digestão in gel, classifique V para as sentenças 
verdadeiras e F para as falsas: 
( ) As proteínas são apenas separadas de acordo com sua massa molecular, embora, nesse caso, as 
bandas obtidas do gel representem populações de proteínas com massas similares. 
( ) A análise no espectrômetro de massas necessita que a carga líquida se torne negativa, ou seja, o 
processo de ionização não é necessário. 
( ) A cromatografia líquida é utilizada como método de fracionamento, em que os peptídeos 
presentes na amostra são dissolvidos em uma fase líquida, bombeadas para passar por uma fase 
estacionária e direcionadas para espectrometria de massas. 
( ) As amostras podem ser submetidas a outro fracionamento prévio à análise por MS, com o 
objetivo de reduzir a complexidade da amostra ou apenas complementar o fracionamento já realizado 
na eletroforese. 
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Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A V - F - F - V.
B V - V - F - V.
C F - F - V - F.
D V - F - V - V.
Com a biotecnologia da transcriptômica, proteômica e metabolômica, tornou-se possível 
analisar todo o conjunto que esteja sendo expresso em um determinado tipo celular em diferentes 
fases de desenvolvimento de um organismo. Sobre as funções das "ômicas", avalie as asserções a 
seguir e relação proposta entre elas: 
I- As "ômicas" permitem obter informações relativas à progressão de doenças, à influência de fatores 
ambientais sobre os processos biológicos que estejam sendo investigados, ou ainda, determinar 
biomarcadores específicos para uma determinada condição. 
PORQUE
 
II- Com o desenvolvimento e aplicação das "ômicas" obtêm-se informações ou dados em larga escala, 
capazes de elucidar respostas biológicas complexas. 
Assinale a alternativa CORRETA:
A A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
B As asserções I e II são proposições falsas.
C Asasserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
D As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
A sigla CRISPR vem do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats e 
pode ser traduzida como grupos de repetições palindrômicas curtas e regularmente interespaçadas. Já 
o Cas 9 se refere à nuclease que se encontra associada ao sistema CRISPR. Com base na técnica 
CRISPR-Cas9, analise as sentenças a seguir: 
I- Uma molécula de RNA guia (gRNA) é inserida em uma sequência maior de RNA. Quando em 
contato com o DNA, o gRNA se liga uma a sequência específica do DNA, indicando para a enzima 
Cas9 onde o DNA deve ser cortado. 
II- Os mecanismos de reparo de DNA presentes na célula é ativado e utilizado para a inserção, 
exclusão de pares de bases do DNA ou para efetuar a substituição de segmentos inteiros de DNA por 
segmentos de DNA personalizados. 
III- Os efeitos da edição do genoma em células e animais experimentais, pois essa ferramenta se 
mostra bastante promissora para o tratamento de doenças relacionadas a determinados genes, como a 
fibrose cística e a hemofilia, e para auxiliar no tratamento de outras doenças, como o câncer. 
Assinale a alternativa CORRETA:
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A Somente a sentença I está correta.
B Somente a sentença III está correta.
C Somente a sentença II está correta.
D As sentenças I, II e III estão corretas.
Uma das descobertas mais intrigantes do projeto genoma humano foi identificar que somente 
uma pequena porcentagem de todo genoma codificava uma proteína. Com base nas sequências 
codificadoras e não codificadoras de proteínas, analise as sentenças a seguir: 
I- Sequências codificadoras são chamadas de éxons e são responsáveis por originar sequências de 
aminoácidos específicas, que corresponde a uma proteína. 
II- Sequências não codificadoras são denominadas de íntrons, não tendo função conhecida no genoma 
humano. 
III- Sequências reguladoras são aquelas denominadas como éxons, regulando quando e quanto de um 
gene será expresso. 
Assinale a alternativa CORRETA:
A As sentenças I e II estão corretas.
B As sentenças II e III estão corretas.
C Somente a sentença III está correta.
D Somente a sentença II está correta.
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